RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, humanhuman

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4-259ENST00000627568 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.59■■■■■ 7.77
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TCF4-259ENST00000627568 SMARCA2P51531 1590 aa49.42■■■■■ 5.5
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TCF4-259ENST00000627568 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.98■■■■■ 5.43
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TCF4-259ENST00000627568 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.44■■■■■ 5.35
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TCF4-259ENST00000627568 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.08■■■■■ 5.29
TCF4-259ENST00000627568 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.03■■■■■ 5.28
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TCF4-259ENST00000627568 CFTRP13569 1480 aa47.62■■■■■ 5.21
TCF4-259ENST00000627568 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.61■■■■■ 5.21
TCF4-259ENST00000627568 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.56■■■■■ 5.2
TCF4-259ENST00000627568 WDR62O43379 1518 aa47.56■■■■■ 5.2
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TCF4-259ENST00000627568 PRDM2Q13029 1718 aa47.27■■■■■ 5.16
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TCF4-259ENST00000627568 TOPBP1Q92547 1522 aa46.69■■■■■ 5.07
TCF4-259ENST00000627568 ABCC8Q09428 1581 aa46.67■■■■■ 5.06
TCF4-259ENST00000627568 IFT140Q96RY7 1462 aa46.63■■■■■ 5.05
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TCF4-259ENST00000627568 OSCARQ8IYS5 282 aa46.4■■■■■ 5.02
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TCF4-259ENST00000627568 CUX1P39880 1505 aa46.01■■■■■ 4.96
TCF4-259ENST00000627568 WDR97A6NE52 1622 aa45.88■■■■■ 4.94
TCF4-259ENST00000627568 CHD1O14646 1710 aa45.87■■■■■ 4.93
TCF4-259ENST00000627568 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
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TCF4-259ENST00000627568 FBLN2P98095 1184 aa45.75■■■■■ 4.91
TCF4-259ENST00000627568 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.68■■■■■ 4.9
TCF4-259ENST00000627568 ARHGEF11O15085 1522 aa45.67■■■■■ 4.9
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TCF4-259ENST00000627568 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.43■■■■■ 4.86
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TCF4-259ENST00000627568 SYNJ1O43426 1573 aa45.4■■■■■ 4.86
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TCF4-259ENST00000627568 NUP160Q12769 1436 aa44.84■■■■■ 4.77
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TCF4-259ENST00000627568 SHROOM2Q13796 1616 aa44.61■■■■■ 4.73
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TCF4-259ENST00000627568 IGF1RP08069 1367 aa44.42■■■■■ 4.7
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