RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627198.2

NRXN1-227, Transcript of neurexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene NRXN1, Length 518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1-227ENST00000627198 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.62■■■■■ 6.49
NRXN1-227ENST00000627198 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.52■■■■■ 5.52
NRXN1-227ENST00000627198 ABCC9O60706 1549 aa49.04■■■■■ 5.44
NRXN1-227ENST00000627198 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.86■■■■■ 5.09
NRXN1-227ENST00000627198 NACADO15069 1562 aa46.64■■■■■ 5.06
NRXN1-227ENST00000627198 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.39■■■■■ 5.02
NRXN1-227ENST00000627198 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.32■■■■■ 5.01
NRXN1-227ENST00000627198 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.23■■■■■ 4.99
NRXN1-227ENST00000627198 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.12■■■■■ 4.97
NRXN1-227ENST00000627198 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.86■■■■■ 4.93
NRXN1-227ENST00000627198 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.72■■■■■ 4.91
NRXN1-227ENST00000627198 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.65■■■■■ 4.9
NRXN1-227ENST00000627198 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.5■■■■■ 4.87
NRXN1-227ENST00000627198 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.04■■■■■ 4.8
NRXN1-227ENST00000627198 SCRIBQ14160 1630 aa45.04■■■■■ 4.8
NRXN1-227ENST00000627198 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.35■■■■■ 4.69
NRXN1-227ENST00000627198 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.35■■■■■ 4.69
NRXN1-227ENST00000627198 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.21■■■■■ 4.67
NRXN1-227ENST00000627198 SMARCA4P51532 1647 aa43.15■■■■■ 4.5
NRXN1-227ENST00000627198 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.1■■■■■ 4.49
NRXN1-227ENST00000627198 NCAPD3P42695 1498 aa43.07■■■■■ 4.49
NRXN1-227ENST00000627198 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.98■■■■■ 4.47
NRXN1-227ENST00000627198 SMARCA2P51531 1590 aa42.91■■■■■ 4.46
NRXN1-227ENST00000627198 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.84■■■■■ 4.45
NRXN1-227ENST00000627198 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.82■■■■■ 4.45
NRXN1-227ENST00000627198 HMGXB3Q12766 1538 aa42.78■■■■■ 4.44
NRXN1-227ENST00000627198 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.55■■■■■ 4.4
NRXN1-227ENST00000627198 ERCC6Q03468 1493 aa42.33■■■■■ 4.37
NRXN1-227ENST00000627198 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.32■■■■■ 4.37
NRXN1-227ENST00000627198 CUX2O14529 1486 aa42.31■■■■■ 4.36
NRXN1-227ENST00000627198 WIZO95785 1651 aa42.31■■■■■ 4.36
NRXN1-227ENST00000627198 NESP48681 1621 aa42.19■■■■■ 4.34
NRXN1-227ENST00000627198 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.03■■■■■ 4.32
NRXN1-227ENST00000627198 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.02■■■■■ 4.32
NRXN1-227ENST00000627198 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
NRXN1-227ENST00000627198 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.8■■■■■ 4.28
NRXN1-227ENST00000627198 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.78■■■■■ 4.28
NRXN1-227ENST00000627198 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.74■■■■■ 4.27
NRXN1-227ENST00000627198 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.64■■■■■ 4.26
NRXN1-227ENST00000627198 CFTRP13569 1480 aa41.47■■■■■ 4.23
NRXN1-227ENST00000627198 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.41■■■■■ 4.22
NRXN1-227ENST00000627198 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.38■■■■■ 4.21
NRXN1-227ENST00000627198 WDR62O43379 1518 aa41.3■■■■■ 4.2
NRXN1-227ENST00000627198 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.24■■■■■ 4.19
NRXN1-227ENST00000627198 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.21■■■■■ 4.19
NRXN1-227ENST00000627198 PRDM2Q13029 1718 aa41.09■■■■■ 4.17
NRXN1-227ENST00000627198 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
NRXN1-227ENST00000627198 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
NRXN1-227ENST00000627198 ABCC8Q09428 1581 aa40.57■■■■■ 4.08
NRXN1-227ENST00000627198 TOPBP1Q92547 1522 aa40.54■■■■■ 4.08
NRXN1-227ENST00000627198 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.48■■■■■ 4.07
NRXN1-227ENST00000627198 IFT140Q96RY7 1462 aa40.45■■■■■ 4.07
NRXN1-227ENST00000627198 OSCARQ8IYS5 282 aa40.34■■■■■ 4.05
NRXN1-227ENST00000627198 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
NRXN1-227ENST00000627198 CUX1P39880 1505 aa40.19■■■■■ 4.02
NRXN1-227ENST00000627198 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
NRXN1-227ENST00000627198 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
NRXN1-227ENST00000627198 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
NRXN1-227ENST00000627198 TRIM41Q8WV44 630 aa40.08■■■■■ 4.01
NRXN1-227ENST00000627198 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.04■■■■■ 4
NRXN1-227ENST00000627198 SOGA1O94964 1423 aa39.99■■■■□ 3.99
NRXN1-227ENST00000627198 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.96■■■■□ 3.99
NRXN1-227ENST00000627198 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.95■■■■□ 3.99
NRXN1-227ENST00000627198 WDR97A6NE52 1622 aa39.87■■■■□ 3.97
NRXN1-227ENST00000627198 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.85■■■■□ 3.97
NRXN1-227ENST00000627198 TOP2BQ02880 1626 aa39.83■■■■□ 3.97
NRXN1-227ENST00000627198 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.83■■■■□ 3.97
NRXN1-227ENST00000627198 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.77■■■■□ 3.96
NRXN1-227ENST00000627198 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.77■■■■□ 3.96
NRXN1-227ENST00000627198 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.77■■■■□ 3.96
NRXN1-227ENST00000627198 SYNJ1O43426 1573 aa39.77■■■■□ 3.96
NRXN1-227ENST00000627198 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
NRXN1-227ENST00000627198 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.71■■■■□ 3.95
NRXN1-227ENST00000627198 CHD1O14646 1710 aa39.7■■■■□ 3.95
NRXN1-227ENST00000627198 ARHGEF11O15085 1522 aa39.7■■■■□ 3.95
NRXN1-227ENST00000627198 GRIN2BQ13224 1484 aa39.56■■■■□ 3.92
NRXN1-227ENST00000627198 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.56■■■■□ 3.92
NRXN1-227ENST00000627198 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.55■■■■□ 3.92
NRXN1-227ENST00000627198 FBLN2P98095 1184 aa39.55■■■■□ 3.92
NRXN1-227ENST00000627198 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.54■■■■□ 3.92
NRXN1-227ENST00000627198 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
NRXN1-227ENST00000627198 PBRM1Q86U86 1689 aa39.43■■■■□ 3.9
NRXN1-227ENST00000627198 SYNJ2O15056 1496 aa39.38■■■■□ 3.9
NRXN1-227ENST00000627198 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
NRXN1-227ENST00000627198 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.37■■■■□ 3.89
NRXN1-227ENST00000627198 ARAP1Q96P48 1450 aa39.32■■■■□ 3.89
NRXN1-227ENST00000627198 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.32■■■■□ 3.89
NRXN1-227ENST00000627198 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.24■■■■□ 3.87
NRXN1-227ENST00000627198 ADAMTS12P58397 1594 aa39.16■■■■□ 3.86
NRXN1-227ENST00000627198 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.1■■■■□ 3.85
NRXN1-227ENST00000627198 GRIN2AQ12879 1464 aa39.05■■■■□ 3.84
NRXN1-227ENST00000627198 KIF27Q86VH2 1401 aa39.04■■■■□ 3.84
NRXN1-227ENST00000627198 NUP160Q12769 1436 aa38.95■■■■□ 3.83
NRXN1-227ENST00000627198 IGF1RP08069 1367 aa38.94■■■■□ 3.82
NRXN1-227ENST00000627198 CEP170Q5SW79 1584 aa38.86■■■■□ 3.81
NRXN1-227ENST00000627198 CUL7Q14999 1698 aa38.81■■■■□ 3.8
NRXN1-227ENST00000627198 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.76■■■■□ 3.8
NRXN1-227ENST00000627198 SHROOM2Q13796 1616 aa38.71■■■■□ 3.79
NRXN1-227ENST00000627198 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.68■■■■□ 3.78
NRXN1-227ENST00000627198 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.66■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.3 ms