RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625177.3

RNF114-208, Transcript of ring finger protein 114, humanhuman

TSL 3

Gene RNF114, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF114-208ENST00000625177 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.81■■■■■ 7
RNF114-208ENST00000625177 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.6■■■■■ 6.01
RNF114-208ENST00000625177 ABCC9O60706 1549 aa52.3■■■■■ 5.96
RNF114-208ENST00000625177 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.93■■■■■ 5.58
RNF114-208ENST00000625177 NACADO15069 1562 aa49.66■■■■■ 5.54
RNF114-208ENST00000625177 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.66■■■■■ 5.54
RNF114-208ENST00000625177 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.05■■■■■ 5.44
RNF114-208ENST00000625177 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.81■■■■■ 5.4
RNF114-208ENST00000625177 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.78■■■■■ 5.4
RNF114-208ENST00000625177 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.72■■■■■ 5.39
RNF114-208ENST00000625177 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.64■■■■■ 5.38
RNF114-208ENST00000625177 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.58■■■■■ 5.37
RNF114-208ENST00000625177 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.38■■■■■ 5.33
RNF114-208ENST00000625177 SCRIBQ14160 1630 aa48.02■■■■■ 5.28
RNF114-208ENST00000625177 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.81■■■■■ 5.24
RNF114-208ENST00000625177 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.22■■■■■ 5.15
RNF114-208ENST00000625177 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
RNF114-208ENST00000625177 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.07■■■■■ 5.13
RNF114-208ENST00000625177 NCAPD3P42695 1498 aa45.81■■■■■ 4.92
RNF114-208ENST00000625177 SMARCA4P51532 1647 aa45.8■■■■■ 4.92
RNF114-208ENST00000625177 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.74■■■■■ 4.91
RNF114-208ENST00000625177 SMARCA2P51531 1590 aa45.67■■■■■ 4.9
RNF114-208ENST00000625177 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
RNF114-208ENST00000625177 HMGXB3Q12766 1538 aa45.52■■■■■ 4.88
RNF114-208ENST00000625177 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.38■■■■■ 4.86
RNF114-208ENST00000625177 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.33■■■■■ 4.85
RNF114-208ENST00000625177 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.3■■■■■ 4.84
RNF114-208ENST00000625177 ERCC6Q03468 1493 aa45.19■■■■■ 4.82
RNF114-208ENST00000625177 NESP48681 1621 aa45■■■■■ 4.79
RNF114-208ENST00000625177 CUX2O14529 1486 aa44.89■■■■■ 4.78
RNF114-208ENST00000625177 WIZO95785 1651 aa44.8■■■■■ 4.76
RNF114-208ENST00000625177 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.75■■■■■ 4.75
RNF114-208ENST00000625177 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.53■■■■■ 4.72
RNF114-208ENST00000625177 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.53■■■■■ 4.72
RNF114-208ENST00000625177 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.49■■■■■ 4.71
RNF114-208ENST00000625177 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.43■■■■■ 4.7
RNF114-208ENST00000625177 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
RNF114-208ENST00000625177 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.42■■■■■ 4.7
RNF114-208ENST00000625177 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
RNF114-208ENST00000625177 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.1■■■■■ 4.65
RNF114-208ENST00000625177 CFTRP13569 1480 aa44.02■■■■■ 4.64
RNF114-208ENST00000625177 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.02■■■■■ 4.64
RNF114-208ENST00000625177 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.99■■■■■ 4.63
RNF114-208ENST00000625177 WDR62O43379 1518 aa43.94■■■■■ 4.62
RNF114-208ENST00000625177 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.77■■■■■ 4.6
RNF114-208ENST00000625177 PRDM2Q13029 1718 aa43.61■■■■■ 4.57
RNF114-208ENST00000625177 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.56
RNF114-208ENST00000625177 TOPBP1Q92547 1522 aa43.18■■■■■ 4.5
RNF114-208ENST00000625177 ABCC8Q09428 1581 aa43.15■■■■■ 4.5
RNF114-208ENST00000625177 IFT140Q96RY7 1462 aa43.12■■■■■ 4.49
RNF114-208ENST00000625177 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.07■■■■■ 4.48
RNF114-208ENST00000625177 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
RNF114-208ENST00000625177 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.98■■■■■ 4.47
RNF114-208ENST00000625177 OSCARQ8IYS5 282 aa42.97■■■■■ 4.47
RNF114-208ENST00000625177 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
RNF114-208ENST00000625177 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.76■■■■■ 4.44
RNF114-208ENST00000625177 TRIM41Q8WV44 630 aa42.76■■■■■ 4.44
RNF114-208ENST00000625177 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
RNF114-208ENST00000625177 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.66■■■■■ 4.423e-7■■■■■ 34.4
RNF114-208ENST00000625177 SOGA1O94964 1423 aa42.63■■■■■ 4.41
RNF114-208ENST00000625177 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.62■■■■■ 4.41
RNF114-208ENST00000625177 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.57■■■■■ 4.41
RNF114-208ENST00000625177 CUX1P39880 1505 aa42.56■■■■■ 4.4
RNF114-208ENST00000625177 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
RNF114-208ENST00000625177 FBLN2P98095 1184 aa42.43■■■■■ 4.38
RNF114-208ENST00000625177 CHD1O14646 1710 aa42.37■■■■■ 4.37
RNF114-208ENST00000625177 WDR97A6NE52 1622 aa42.35■■■■■ 4.37
RNF114-208ENST00000625177 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.3■■■■■ 4.36
RNF114-208ENST00000625177 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.3■■■■■ 4.36
RNF114-208ENST00000625177 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.3■■■■■ 4.36
RNF114-208ENST00000625177 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.25■■■■■ 4.35
RNF114-208ENST00000625177 ARHGEF11O15085 1522 aa42.21■■■■■ 4.35
RNF114-208ENST00000625177 GRIN2BQ13224 1484 aa42.2■■■■■ 4.35
RNF114-208ENST00000625177 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
RNF114-208ENST00000625177 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
RNF114-208ENST00000625177 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.1■■■■■ 4.33
RNF114-208ENST00000625177 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.09■■■■■ 4.33
RNF114-208ENST00000625177 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.05■■■■■ 4.32
RNF114-208ENST00000625177 PBRM1Q86U86 1689 aa42.03■■■■■ 4.32
RNF114-208ENST00000625177 SYNJ2O15056 1496 aa42■■■■■ 4.31
RNF114-208ENST00000625177 TOP2BQ02880 1626 aa41.99■■■■■ 4.31
RNF114-208ENST00000625177 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.98■■■■■ 4.31
RNF114-208ENST00000625177 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.97■■■■■ 4.31
RNF114-208ENST00000625177 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.96■■■■■ 4.31
RNF114-208ENST00000625177 SYNJ1O43426 1573 aa41.96■■■■■ 4.31
RNF114-208ENST00000625177 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.87■■■■■ 4.29
RNF114-208ENST00000625177 ARAP1Q96P48 1450 aa41.82■■■■■ 4.29
RNF114-208ENST00000625177 ADAMTS12P58397 1594 aa41.65■■■■■ 4.26
RNF114-208ENST00000625177 GRIN2AQ12879 1464 aa41.64■■■■■ 4.26
RNF114-208ENST00000625177 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.59■■■■■ 4.25
RNF114-208ENST00000625177 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.58■■■■■ 4.25
RNF114-208ENST00000625177 NUP160Q12769 1436 aa41.45■■■■■ 4.23
RNF114-208ENST00000625177 CEP170Q5SW79 1584 aa41.44■■■■■ 4.22
RNF114-208ENST00000625177 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
RNF114-208ENST00000625177 KIF27Q86VH2 1401 aa41.26■■■■■ 4.19
RNF114-208ENST00000625177 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.25■■■■■ 4.19
RNF114-208ENST00000625177 SHROOM2Q13796 1616 aa41.2■■■■■ 4.19
RNF114-208ENST00000625177 IGF1RP08069 1367 aa41.13■■■■■ 4.18
RNF114-208ENST00000625177 JPH4Q96JJ6 628 aa41.1■■■■■ 4.17
RNF114-208ENST00000625177 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140.1 ms