RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622887.1

HUWE1-215, Transcript of HECT, UBA and WWE domain containing 1, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene HUWE1, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HUWE1-215	ENST00000622887	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		55.62	■■■■■ 6.49
HUWE1-215	ENST00000622887	ABCC9	O60706	1549 aa		49.84	■■■■■ 5.57
HUWE1-215	ENST00000622887	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		49.81	■■■■■ 5.56
HUWE1-215	ENST00000622887	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.43	■■■■■ 5.18
HUWE1-215	ENST00000622887	NACAD	O15069	1562 aa		47.14	■■■■■ 5.14
HUWE1-215	ENST00000622887	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		46.98	■■■■■ 5.11
HUWE1-215	ENST00000622887	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.76	■■■■■ 5.08
HUWE1-215	ENST00000622887	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.53	■■■■■ 5.04
HUWE1-215	ENST00000622887	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.45	■■■■■ 5.03
HUWE1-215	ENST00000622887	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.26	■■■■■ 5
HUWE1-215	ENST00000622887	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	46.1	■■■■■ 4.97
HUWE1-215	ENST00000622887	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		46.05	■■■■■ 4.96
HUWE1-215	ENST00000622887	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		45.94	■■■■■ 4.95
HUWE1-215	ENST00000622887	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.45	■■■■■ 4.87
HUWE1-215	ENST00000622887	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.41	■■■■■ 4.86
HUWE1-215	ENST00000622887	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.99	■■■■■ 4.79
HUWE1-215	ENST00000622887	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.91	■■■■■ 4.78
HUWE1-215	ENST00000622887	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.9	■■■■■ 4.78
HUWE1-215	ENST00000622887	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.56	■■■■■ 4.56
HUWE1-215	ENST00000622887	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.43	■■■■■ 4.54
HUWE1-215	ENST00000622887	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.33	■■■■■ 4.53
HUWE1-215	ENST00000622887	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.27	■■■■■ 4.52
HUWE1-215	ENST00000622887	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.18	■■■■■ 4.5
HUWE1-215	ENST00000622887	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.16	■■■■■ 4.5
HUWE1-215	ENST00000622887	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.01	■■■■■ 4.48
HUWE1-215	ENST00000622887	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
HUWE1-215	ENST00000622887	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		42.94	■■■■■ 4.46
HUWE1-215	ENST00000622887	CUX2	O14529	1486 aa		42.93	■■■■■ 4.46
HUWE1-215	ENST00000622887	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.9	■■■■■ 4.46
HUWE1-215	ENST00000622887	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		42.86	■■■■■ 4.45
HUWE1-215	ENST00000622887	NES	P48681	1621 aa		42.82	■■■■■ 4.45
HUWE1-215	ENST00000622887	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.51	■■■■■ 4.4
HUWE1-215	ENST00000622887	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.33	■■■■■ 4.37
HUWE1-215	ENST00000622887	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.31	■■■■■ 4.36
HUWE1-215	ENST00000622887	WIZ	O95785	1651 aa		42.3	■■■■■ 4.36
HUWE1-215	ENST00000622887	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.25	■■■■■ 4.35
HUWE1-215	ENST00000622887	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.19	■■■■■ 4.34
HUWE1-215	ENST00000622887	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	42.02	■■■■■ 4.32
HUWE1-215	ENST00000622887	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.92	■■■■■ 4.3
HUWE1-215	ENST00000622887	WDR62	O43379	1518 aa		41.8	■■■■■ 4.28
HUWE1-215	ENST00000622887	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	41.8	■■■■■ 4.28
HUWE1-215	ENST00000622887	CFTR	P13569	1480 aa		41.76	■■■■■ 4.28
HUWE1-215	ENST00000622887	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.76	■■■■■ 4.28
HUWE1-215	ENST00000622887	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.73	■■■■■ 4.27
HUWE1-215	ENST00000622887	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.39	■■■■■ 4.22
HUWE1-215	ENST00000622887	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.36	■■■■■ 4.21
HUWE1-215	ENST00000622887	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.2	■■■■■ 4.19
HUWE1-215	ENST00000622887	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.04	■■■■■ 4.16
HUWE1-215	ENST00000622887	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.02	■■■■■ 4.16
HUWE1-215	ENST00000622887	TOPBP1	Q92547	1522 aa		40.95	■■■■■ 4.15
HUWE1-215	ENST00000622887	IFT140	Q96RY7	1462 aa		40.94	■■■■■ 4.14
HUWE1-215	ENST00000622887	ABCC8	Q09428	1581 aa		40.87	■■■■■ 4.13
HUWE1-215	ENST00000622887	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.87	■■■■■ 4.13
HUWE1-215	ENST00000622887	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.78	■■■■■ 4.12
HUWE1-215	ENST00000622887	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.59	■■■■■ 4.09
HUWE1-215	ENST00000622887	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.55	■■■■■ 4.08
HUWE1-215	ENST00000622887	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
HUWE1-215	ENST00000622887	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.52	■■■■■ 4.08	6e-6	■■■■□ 25.1
HUWE1-215	ENST00000622887	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.39	■■■■■ 4.06
HUWE1-215	ENST00000622887	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.39	■■■■■ 4.06
HUWE1-215	ENST00000622887	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.39	■■■■■ 4.06
HUWE1-215	ENST00000622887	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.39	■■■■■ 4.06
HUWE1-215	ENST00000622887	SOGA1	O94964	1423 aa		40.38	■■■■■ 4.05
HUWE1-215	ENST00000622887	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.31	■■■■■ 4.04
HUWE1-215	ENST00000622887	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.3	■■■■■ 4.04
HUWE1-215	ENST00000622887	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.29	■■■■■ 4.04
HUWE1-215	ENST00000622887	FBLN2	P98095	1184 aa		40.27	■■■■■ 4.04
HUWE1-215	ENST00000622887	CUX1	P39880	1505 aa		40.25	■■■■■ 4.03
HUWE1-215	ENST00000622887	CHD1	O14646	1710 aa		40.25	■■■■■ 4.03
HUWE1-215	ENST00000622887	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	40.23	■■■■■ 4.03
HUWE1-215	ENST00000622887	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.13	■■■■■ 4.02
HUWE1-215	ENST00000622887	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.08	■■■■■ 4.01
HUWE1-215	ENST00000622887	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		40.07	■■■■■ 4.01
HUWE1-215	ENST00000622887	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40	■■■■□ 3.99
HUWE1-215	ENST00000622887	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	39.99	■■■■□ 3.99
HUWE1-215	ENST00000622887	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	39.99	■■■■□ 3.99
HUWE1-215	ENST00000622887	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.92	■■■■□ 3.98
HUWE1-215	ENST00000622887	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		39.87	■■■■□ 3.97
HUWE1-215	ENST00000622887	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.86	■■■■□ 3.97
HUWE1-215	ENST00000622887	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.85	■■■■□ 3.97
HUWE1-215	ENST00000622887	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		39.84	■■■■□ 3.97
HUWE1-215	ENST00000622887	SYNJ1	O43426	1573 aa		39.83	■■■■□ 3.97
HUWE1-215	ENST00000622887	PBRM1	Q86U86	1689 aa		39.75	■■■■□ 3.95
HUWE1-215	ENST00000622887	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.73	■■■■□ 3.95
HUWE1-215	ENST00000622887	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	39.71	■■■■□ 3.95
HUWE1-215	ENST00000622887	TOP2B	Q02880	1626 aa		39.6	■■■■□ 3.93
HUWE1-215	ENST00000622887	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.59	■■■■□ 3.93
HUWE1-215	ENST00000622887	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		39.58	■■■■□ 3.93
HUWE1-215	ENST00000622887	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.48	■■■■□ 3.91
HUWE1-215	ENST00000622887	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.42	■■■■□ 3.9
HUWE1-215	ENST00000622887	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.38	■■■■□ 3.89
HUWE1-215	ENST00000622887	NUP160	Q12769	1436 aa		39.37	■■■■□ 3.89
HUWE1-215	ENST00000622887	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.33	■■■■□ 3.89
HUWE1-215	ENST00000622887	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.31	■■■■□ 3.88
HUWE1-215	ENST00000622887	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.24	■■■■□ 3.87
HUWE1-215	ENST00000622887	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.13	■■■■□ 3.85
HUWE1-215	ENST00000622887	JPH4	Q96JJ6	628 aa		39.01	■■■■□ 3.84
HUWE1-215	ENST00000622887	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	38.98	■■■■□ 3.83
HUWE1-215	ENST00000622887	IGF1R	P08069	1367 aa		38.9	■■■■□ 3.82
HUWE1-215	ENST00000622887	KIF27	Q86VH2	1401 aa		38.89	■■■■□ 3.82

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