RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621817.1

FAM58A-209, Transcript of Cyclin-related protein FAM58A, humanhuman

TSL 3

Gene FAM58A, Length 916 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58A-209ENST00000621817 NISCHQ9Y2I1 1504 aa72.19■■■■■ 9.15
FAM58A-209ENST00000621817 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa64.62■■■■■ 7.94
FAM58A-209ENST00000621817 ABCC9O60706 1549 aa63.91■■■■■ 7.82
FAM58A-209ENST00000621817 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa61.16■■■■■ 7.38
FAM58A-209ENST00000621817 NACADO15069 1562 aa60.91■■■■■ 7.34
FAM58A-209ENST00000621817 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.37■■■■■ 7.25
FAM58A-209ENST00000621817 MYO15BQ96JP2 1530 aa60.34■■■■■ 7.25
FAM58A-209ENST00000621817 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP59.98■■■■■ 7.19
FAM58A-209ENST00000621817 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.89■■■■■ 7.18
FAM58A-209ENST00000621817 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.75■■■■■ 7.15
FAM58A-209ENST00000621817 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP59.52■■■■■ 7.12
FAM58A-209ENST00000621817 DNAJC5BQ9UF47 199 aa59.5■■■■■ 7.12
FAM58A-209ENST00000621817 BICRAQ9NZM4 1560 aa59.44■■■■■ 7.11
FAM58A-209ENST00000621817 SCRIBQ14160 1630 aa58.8■■■■■ 7
FAM58A-209ENST00000621817 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa58.71■■■■■ 6.99
FAM58A-209ENST00000621817 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57.88■■■■■ 6.86
FAM58A-209ENST00000621817 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.85■■■■■ 6.85
FAM58A-209ENST00000621817 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.54■■■■■ 6.8
FAM58A-209ENST00000621817 SMARCA4P51532 1647 aa56.22■■■■■ 6.59
FAM58A-209ENST00000621817 NCAPD3P42695 1498 aa56.21■■■■■ 6.59
FAM58A-209ENST00000621817 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.1■■■■■ 6.57
FAM58A-209ENST00000621817 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP55.99■■■■■ 6.55
FAM58A-209ENST00000621817 SMARCA2P51531 1590 aa55.98■■■■■ 6.55
FAM58A-209ENST00000621817 HMGXB3Q12766 1538 aa55.88■■■■■ 6.54
FAM58A-209ENST00000621817 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.74■■■■■ 6.51
FAM58A-209ENST00000621817 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.62■■■■■ 6.49
FAM58A-209ENST00000621817 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55.54■■■■■ 6.48
FAM58A-209ENST00000621817 NESP48681 1621 aa55.1■■■■■ 6.41
FAM58A-209ENST00000621817 ERCC6Q03468 1493 aa55.1■■■■■ 6.41
FAM58A-209ENST00000621817 WIZO95785 1651 aa54.98■■■■■ 6.39
FAM58A-209ENST00000621817 CUX2O14529 1486 aa54.94■■■■■ 6.39
FAM58A-209ENST00000621817 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.86■■■■■ 6.37
FAM58A-209ENST00000621817 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP54.65■■■■■ 6.34
FAM58A-209ENST00000621817 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP54.54■■■■■ 6.32
FAM58A-209ENST00000621817 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.48■■■■■ 6.31
FAM58A-209ENST00000621817 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.48■■■■■ 6.31
FAM58A-209ENST00000621817 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.44■■■■■ 6.31
FAM58A-209ENST00000621817 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.34■■■■■ 6.29
FAM58A-209ENST00000621817 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.21■■■■■ 6.27
FAM58A-209ENST00000621817 CFTRP13569 1480 aa54.03■■■■■ 6.24
FAM58A-209ENST00000621817 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.98■■■■■ 6.23
FAM58A-209ENST00000621817 WDR62O43379 1518 aa53.89■■■■■ 6.22
FAM58A-209ENST00000621817 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.85■■■■■ 6.21
FAM58A-209ENST00000621817 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.85■■■■■ 6.21
FAM58A-209ENST00000621817 CCDC88BA6NC98 1476 aa53.68■■■■■ 6.18
FAM58A-209ENST00000621817 PRDM2Q13029 1718 aa53.62■■■■■ 6.17
FAM58A-209ENST00000621817 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53.42■■■■■ 6.14
FAM58A-209ENST00000621817 TOPBP1Q92547 1522 aa52.93■■■■■ 6.06
FAM58A-209ENST00000621817 ABCC8Q09428 1581 aa52.84■■■■■ 6.05
FAM58A-209ENST00000621817 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.81■■■■■ 6.04
FAM58A-209ENST00000621817 IFT140Q96RY7 1462 aa52.78■■■■■ 6.04
FAM58A-209ENST00000621817 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.65■■■■■ 6.02
FAM58A-209ENST00000621817 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52.48■■■■■ 5.99
FAM58A-209ENST00000621817 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52.43■■■■■ 5.98
FAM58A-209ENST00000621817 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52.42■■■■■ 5.98
FAM58A-209ENST00000621817 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP52.42■■■■■ 5.98
FAM58A-209ENST00000621817 OSCARQ8IYS5 282 aa52.39■■■■■ 5.98
FAM58A-209ENST00000621817 CUX1P39880 1505 aa52.24■■■■■ 5.95
FAM58A-209ENST00000621817 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52.19■■■■■ 5.95
FAM58A-209ENST00000621817 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52.18■■■■■ 5.94
FAM58A-209ENST00000621817 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52.16■■■■■ 5.94
FAM58A-209ENST00000621817 SOGA1O94964 1423 aa52.12■■■■■ 5.93
FAM58A-209ENST00000621817 WDR97A6NE52 1622 aa52■■■■■ 5.92
FAM58A-209ENST00000621817 CHD1O14646 1710 aa51.94■■■■■ 5.91
FAM58A-209ENST00000621817 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.93■■■■■ 5.9
FAM58A-209ENST00000621817 TRIM41Q8WV44 630 aa51.9■■■■■ 5.9
FAM58A-209ENST00000621817 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.78■■■■■ 5.88
FAM58A-209ENST00000621817 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.78■■■■■ 5.88
FAM58A-209ENST00000621817 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.78■■■■■ 5.88
FAM58A-209ENST00000621817 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.71■■■■■ 5.87
FAM58A-209ENST00000621817 ARHGEF11O15085 1522 aa51.66■■■■■ 5.86
FAM58A-209ENST00000621817 GRIN2BQ13224 1484 aa51.65■■■■■ 5.86
FAM58A-209ENST00000621817 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.64■■■■■ 5.86
FAM58A-209ENST00000621817 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.63■■■■■ 5.86
FAM58A-209ENST00000621817 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.6■■■■■ 5.85
FAM58A-209ENST00000621817 FBLN2P98095 1184 aa51.58■■■■■ 5.85
FAM58A-209ENST00000621817 TOP2BQ02880 1626 aa51.56■■■■■ 5.85
FAM58A-209ENST00000621817 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.56■■■■■ 5.84
FAM58A-209ENST00000621817 PBRM1Q86U86 1689 aa51.56■■■■■ 5.84
FAM58A-209ENST00000621817 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.54■■■■■ 5.84
FAM58A-209ENST00000621817 SYNJ1O43426 1573 aa51.51■■■■■ 5.84
FAM58A-209ENST00000621817 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.51■■■■■ 5.84
FAM58A-209ENST00000621817 SYNJ2O15056 1496 aa51.43■■■■■ 5.82
FAM58A-209ENST00000621817 CLASP1Q7Z460 1538 aa51.39■■■■■ 5.82
FAM58A-209ENST00000621817 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.35■■■■■ 5.81
FAM58A-209ENST00000621817 ARAP1Q96P48 1450 aa51.21■■■■■ 5.79
FAM58A-209ENST00000621817 ADAMTS12P58397 1594 aa51.11■■■■■ 5.77
FAM58A-209ENST00000621817 CYB5RLQ6IPT4 315 aa51.08■■■■■ 5.77
FAM58A-209ENST00000621817 GRIN2AQ12879 1464 aa51.01■■■■■ 5.76
FAM58A-209ENST00000621817 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51■■■■■ 5.75
FAM58A-209ENST00000621817 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.91■■■■■ 5.74
FAM58A-209ENST00000621817 NUP160Q12769 1436 aa50.86■■■■■ 5.73
FAM58A-209ENST00000621817 CEP170Q5SW79 1584 aa50.84■■■■■ 5.73
FAM58A-209ENST00000621817 SHROOM2Q13796 1616 aa50.62■■■■■ 5.69
FAM58A-209ENST00000621817 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.59■■■■■ 5.69
FAM58A-209ENST00000621817 KIF27Q86VH2 1401 aa50.47■■■■■ 5.67
FAM58A-209ENST00000621817 IGF1RP08069 1367 aa50.43■■■■■ 5.66
FAM58A-209ENST00000621817 CUL7Q14999 1698 aa50.38■■■■■ 5.65
FAM58A-209ENST00000621817 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.37■■■■■ 5.65
FAM58A-209ENST00000621817 TRHP20396 242 aaPredicted RBP50.26■■■■■ 5.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.9 ms