RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621456.2

SLC38A3-208, Transcript of solute carrier family 38 member 3, human

TSL 5

Gene SLC38A3, Length 635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A3-208	ENST00000621456	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.29	■■■■■ 4.52
SLC38A3-208	ENST00000621456	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		38.71	■■■■□ 3.79
SLC38A3-208	ENST00000621456	ABCC9	O60706	1549 aa		38.16	■■■■□ 3.7
SLC38A3-208	ENST00000621456	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		36.61	■■■■□ 3.45
SLC38A3-208	ENST00000621456	NACAD	O15069	1562 aa		36.49	■■■■□ 3.43
SLC38A3-208	ENST00000621456	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.29	■■■■□ 3.4
SLC38A3-208	ENST00000621456	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.16	■■■■□ 3.38
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.99	■■■■□ 3.35
SLC38A3-208	ENST00000621456	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.85	■■■■□ 3.33
SLC38A3-208	ENST00000621456	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		35.74	■■■■□ 3.31
SLC38A3-208	ENST00000621456	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	35.57	■■■■□ 3.28
SLC38A3-208	ENST00000621456	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		35.45	■■■■□ 3.27
SLC38A3-208	ENST00000621456	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.31	■■■■□ 3.24
SLC38A3-208	ENST00000621456	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.22	■■■■□ 3.23
SLC38A3-208	ENST00000621456	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.17	■■■■□ 3.22
SLC38A3-208	ENST00000621456	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	34.58	■■■■□ 3.13
SLC38A3-208	ENST00000621456	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		34.52	■■■■□ 3.12
SLC38A3-208	ENST00000621456	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.37	■■■■□ 3.09
SLC38A3-208	ENST00000621456	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.68	■■■□□ 2.98
SLC38A3-208	ENST00000621456	NCAPD3	P42695	1498 aa		33.64	■■■□□ 2.98
SLC38A3-208	ENST00000621456	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.62	■■■□□ 2.97
SLC38A3-208	ENST00000621456	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		33.58	■■■□□ 2.97
SLC38A3-208	ENST00000621456	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.58	■■■□□ 2.97
SLC38A3-208	ENST00000621456	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.47	■■■□□ 2.95
SLC38A3-208	ENST00000621456	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.38	■■■□□ 2.93
SLC38A3-208	ENST00000621456	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SLC38A3-208	ENST00000621456	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
SLC38A3-208	ENST00000621456	ERCC6	Q03468	1493 aa		32.99	■■■□□ 2.87
SLC38A3-208	ENST00000621456	WIZ	O95785	1651 aa		32.94	■■■□□ 2.86
SLC38A3-208	ENST00000621456	NES	P48681	1621 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SLC38A3-208	ENST00000621456	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SLC38A3-208	ENST00000621456	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
SLC38A3-208	ENST00000621456	CUX2	O14529	1486 aa		32.79	■■■□□ 2.84
SLC38A3-208	ENST00000621456	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SLC38A3-208	ENST00000621456	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SLC38A3-208	ENST00000621456	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SLC38A3-208	ENST00000621456	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
SLC38A3-208	ENST00000621456	CFTR	P13569	1480 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SLC38A3-208	ENST00000621456	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.3	■■■□□ 2.76
SLC38A3-208	ENST00000621456	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.28	■■■□□ 2.76
SLC38A3-208	ENST00000621456	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.26	■■■□□ 2.75
SLC38A3-208	ENST00000621456	WDR62	O43379	1518 aa		32.21	■■■□□ 2.75
SLC38A3-208	ENST00000621456	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.2	■■■□□ 2.75
SLC38A3-208	ENST00000621456	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SLC38A3-208	ENST00000621456	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SLC38A3-208	ENST00000621456	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
SLC38A3-208	ENST00000621456	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.74	■■■□□ 2.67
SLC38A3-208	ENST00000621456	TOPBP1	Q92547	1522 aa		31.7	■■■□□ 2.66
SLC38A3-208	ENST00000621456	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
SLC38A3-208	ENST00000621456	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SLC38A3-208	ENST00000621456	IFT140	Q96RY7	1462 aa		31.62	■■■□□ 2.65
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
SLC38A3-208	ENST00000621456	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
SLC38A3-208	ENST00000621456	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
SLC38A3-208	ENST00000621456	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.34	■■■□□ 2.61
SLC38A3-208	ENST00000621456	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.34	■■■□□ 2.61
SLC38A3-208	ENST00000621456	CUX1	P39880	1505 aa		31.29	■■■□□ 2.6
SLC38A3-208	ENST00000621456	SOGA1	O94964	1423 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SLC38A3-208	ENST00000621456	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.27	■■■□□ 2.6
SLC38A3-208	ENST00000621456	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.23	■■■□□ 2.59	7e-7	■■■■■ 29.6
SLC38A3-208	ENST00000621456	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.23	■■■□□ 2.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	CHD1	O14646	1710 aa		31.02	■■■□□ 2.56
SLC38A3-208	ENST00000621456	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.98	■■■□□ 2.55
SLC38A3-208	ENST00000621456	GRIN2B	Q13224	1484 aa		30.97	■■■□□ 2.55
SLC38A3-208	ENST00000621456	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		30.97	■■■□□ 2.55
SLC38A3-208	ENST00000621456	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.96	■■■□□ 2.55
SLC38A3-208	ENST00000621456	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.96	■■■□□ 2.55
SLC38A3-208	ENST00000621456	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		30.95	■■■□□ 2.55
SLC38A3-208	ENST00000621456	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	30.95	■■■□□ 2.55
SLC38A3-208	ENST00000621456	FBLN2	P98095	1184 aa		30.95	■■■□□ 2.55
SLC38A3-208	ENST00000621456	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.93	■■■□□ 2.54
SLC38A3-208	ENST00000621456	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		30.92	■■■□□ 2.54
SLC38A3-208	ENST00000621456	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.89	■■■□□ 2.54
SLC38A3-208	ENST00000621456	PBRM1	Q86U86	1689 aa		30.87	■■■□□ 2.53
SLC38A3-208	ENST00000621456	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		30.87	■■■□□ 2.53
SLC38A3-208	ENST00000621456	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		30.85	■■■□□ 2.53
SLC38A3-208	ENST00000621456	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		30.85	■■■□□ 2.53
SLC38A3-208	ENST00000621456	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		30.85	■■■□□ 2.53
SLC38A3-208	ENST00000621456	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	30.83	■■■□□ 2.53
SLC38A3-208	ENST00000621456	SYNJ2	O15056	1496 aa		30.82	■■■□□ 2.52
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARHGEF11	O15085	1522 aa		30.81	■■■□□ 2.52
SLC38A3-208	ENST00000621456	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		30.68	■■■□□ 2.5
SLC38A3-208	ENST00000621456	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.61	■■■□□ 2.49
SLC38A3-208	ENST00000621456	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.61	■■■□□ 2.49
SLC38A3-208	ENST00000621456	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.57	■■■□□ 2.48
SLC38A3-208	ENST00000621456	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.56	■■■□□ 2.48
SLC38A3-208	ENST00000621456	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.53	■■■□□ 2.48
SLC38A3-208	ENST00000621456	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.52	■■■□□ 2.48
SLC38A3-208	ENST00000621456	NUP160	Q12769	1436 aa		30.44	■■■□□ 2.46
SLC38A3-208	ENST00000621456	KIF27	Q86VH2	1401 aa		30.4	■■■□□ 2.46
SLC38A3-208	ENST00000621456	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.4	■■■□□ 2.46
SLC38A3-208	ENST00000621456	CUL7	Q14999	1698 aa		30.27	■■■□□ 2.44
SLC38A3-208	ENST00000621456	IGF1R	P08069	1367 aa		30.27	■■■□□ 2.44
SLC38A3-208	ENST00000621456	SHROOM2	Q13796	1616 aa		30.26	■■■□□ 2.44
SLC38A3-208	ENST00000621456	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		30.16	■■■□□ 2.42
SLC38A3-208	ENST00000621456	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.16	■■■□□ 2.42
SLC38A3-208	ENST00000621456	JPH4	Q96JJ6	628 aa		30.11	■■■□□ 2.41

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