RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619976.1

SYNRG-227, Transcript of synergin gamma, humanhuman

TSL 2

Gene SYNRG, Length 1,375 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRG-227ENST00000619976 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.41■■■■■ 8.54
SYNRG-227ENST00000619976 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa61.06■■■■■ 7.36
SYNRG-227ENST00000619976 ABCC9O60706 1549 aa60.27■■■■■ 7.24
SYNRG-227ENST00000619976 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.72■■■■■ 6.83
SYNRG-227ENST00000619976 NACADO15069 1562 aa57.53■■■■■ 6.8
SYNRG-227ENST00000619976 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.41■■■■■ 6.78
SYNRG-227ENST00000619976 MYO15BQ96JP2 1530 aa57■■■■■ 6.71
SYNRG-227ENST00000619976 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP56.86■■■■■ 6.69
SYNRG-227ENST00000619976 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.56■■■■■ 6.64
SYNRG-227ENST00000619976 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.45■■■■■ 6.63
SYNRG-227ENST00000619976 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.24■■■■■ 6.59
SYNRG-227ENST00000619976 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.01■■■■■ 6.56
SYNRG-227ENST00000619976 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.82■■■■■ 6.53
SYNRG-227ENST00000619976 SCRIBQ14160 1630 aa55.68■■■■■ 6.5
SYNRG-227ENST00000619976 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.33■■■■■ 6.45
SYNRG-227ENST00000619976 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.57■■■■■ 6.33
SYNRG-227ENST00000619976 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.49■■■■■ 6.31
SYNRG-227ENST00000619976 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.21■■■■■ 6.27
SYNRG-227ENST00000619976 SMARCA4P51532 1647 aa53.2■■■■■ 6.11
SYNRG-227ENST00000619976 NCAPD3P42695 1498 aa53.09■■■■■ 6.09
SYNRG-227ENST00000619976 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.06■■■■■ 6.08
SYNRG-227ENST00000619976 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.05■■■■■ 6.08
SYNRG-227ENST00000619976 SMARCA2P51531 1590 aa52.95■■■■■ 6.07
SYNRG-227ENST00000619976 HMGXB3Q12766 1538 aa52.77■■■■■ 6.04
SYNRG-227ENST00000619976 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.72■■■■■ 6.03
SYNRG-227ENST00000619976 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.67■■■■■ 6.02
SYNRG-227ENST00000619976 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.58■■■■■ 6.01
SYNRG-227ENST00000619976 WIZO95785 1651 aa52.14■■■■■ 5.94
SYNRG-227ENST00000619976 NESP48681 1621 aa52.01■■■■■ 5.92
SYNRG-227ENST00000619976 ERCC6Q03468 1493 aa51.99■■■■■ 5.91
SYNRG-227ENST00000619976 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51.91■■■■■ 5.9
SYNRG-227ENST00000619976 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.78■■■■■ 5.88
SYNRG-227ENST00000619976 CUX2O14529 1486 aa51.62■■■■■ 5.85
SYNRG-227ENST00000619976 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.53■■■■■ 5.84
SYNRG-227ENST00000619976 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.52■■■■■ 5.84
SYNRG-227ENST00000619976 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.46■■■■■ 5.83
SYNRG-227ENST00000619976 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.38■■■■■ 5.82
SYNRG-227ENST00000619976 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.32■■■■■ 5.81
SYNRG-227ENST00000619976 CFTRP13569 1480 aa51.1■■■■■ 5.77
SYNRG-227ENST00000619976 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.95■■■■■ 5.75
SYNRG-227ENST00000619976 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.95■■■■■ 5.75
SYNRG-227ENST00000619976 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.93■■■■■ 5.74
SYNRG-227ENST00000619976 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.92■■■■■ 5.74
SYNRG-227ENST00000619976 WDR62O43379 1518 aa50.8■■■■■ 5.72
SYNRG-227ENST00000619976 PRDM2Q13029 1718 aa50.69■■■■■ 5.71
SYNRG-227ENST00000619976 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.68■■■■■ 5.7
SYNRG-227ENST00000619976 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.46■■■■■ 5.67
SYNRG-227ENST00000619976 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP50.23■■■■■ 5.63
SYNRG-227ENST00000619976 TOPBP1Q92547 1522 aa50.06■■■■■ 5.6
SYNRG-227ENST00000619976 ABCC8Q09428 1581 aa50.01■■■■■ 5.6
SYNRG-227ENST00000619976 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.96■■■■■ 5.59
SYNRG-227ENST00000619976 IFT140Q96RY7 1462 aa49.86■■■■■ 5.57
SYNRG-227ENST00000619976 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.7■■■■■ 5.55
SYNRG-227ENST00000619976 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.6■■■■■ 5.53
SYNRG-227ENST00000619976 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.56■■■■■ 5.52
SYNRG-227ENST00000619976 CUX1P39880 1505 aa49.49■■■■■ 5.51
SYNRG-227ENST00000619976 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.48■■■■■ 5.51
SYNRG-227ENST00000619976 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.41■■■■■ 5.5
SYNRG-227ENST00000619976 OSCARQ8IYS5 282 aa49.41■■■■■ 5.5
SYNRG-227ENST00000619976 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.4■■■■■ 5.5
SYNRG-227ENST00000619976 SOGA1O94964 1423 aa49.4■■■■■ 5.5
SYNRG-227ENST00000619976 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.36■■■■■ 5.495e-8■■■□□ 18.8
SYNRG-227ENST00000619976 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.47
SYNRG-227ENST00000619976 WDR97A6NE52 1622 aa49.12■■■■■ 5.45
SYNRG-227ENST00000619976 CHD1O14646 1710 aa48.98■■■■■ 5.43
SYNRG-227ENST00000619976 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.97■■■■■ 5.43
SYNRG-227ENST00000619976 TOP2BQ02880 1626 aa48.92■■■■■ 5.42
SYNRG-227ENST00000619976 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.92■■■■■ 5.42
SYNRG-227ENST00000619976 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.9■■■■■ 5.42
SYNRG-227ENST00000619976 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.89■■■■■ 5.42
SYNRG-227ENST00000619976 FBLN2P98095 1184 aa48.89■■■■■ 5.42
SYNRG-227ENST00000619976 SYNJ1O43426 1573 aa48.88■■■■■ 5.42
SYNRG-227ENST00000619976 GRIN2BQ13224 1484 aa48.88■■■■■ 5.42
SYNRG-227ENST00000619976 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.81■■■■■ 5.4
SYNRG-227ENST00000619976 TRIM41Q8WV44 630 aa48.8■■■■■ 5.4
SYNRG-227ENST00000619976 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.8■■■■■ 5.4
SYNRG-227ENST00000619976 PBRM1Q86U86 1689 aa48.75■■■■■ 5.39
SYNRG-227ENST00000619976 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.75■■■■■ 5.39
SYNRG-227ENST00000619976 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.67■■■■■ 5.38
SYNRG-227ENST00000619976 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.67■■■■■ 5.38
SYNRG-227ENST00000619976 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.67■■■■■ 5.38
SYNRG-227ENST00000619976 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.66■■■■■ 5.38
SYNRG-227ENST00000619976 SYNJ2O15056 1496 aa48.61■■■■■ 5.37
SYNRG-227ENST00000619976 ARHGEF11O15085 1522 aa48.6■■■■■ 5.37
SYNRG-227ENST00000619976 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.42■■■■■ 5.34
SYNRG-227ENST00000619976 ADAMTS12P58397 1594 aa48.32■■■■■ 5.33
SYNRG-227ENST00000619976 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.3■■■■■ 5.32
SYNRG-227ENST00000619976 GRIN2AQ12879 1464 aa48.24■■■■■ 5.31
SYNRG-227ENST00000619976 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.22■■■■■ 5.31
SYNRG-227ENST00000619976 CYB5RLQ6IPT4 315 aa48.2■■■■■ 5.31
SYNRG-227ENST00000619976 ARAP1Q96P48 1450 aa48.18■■■■■ 5.3
SYNRG-227ENST00000619976 NUP160Q12769 1436 aa48.05■■■■■ 5.28
SYNRG-227ENST00000619976 CEP170Q5SW79 1584 aa48.03■■■■■ 5.28
SYNRG-227ENST00000619976 KIF27Q86VH2 1401 aa47.99■■■■■ 5.27
SYNRG-227ENST00000619976 IGF1RP08069 1367 aa47.87■■■■■ 5.25
SYNRG-227ENST00000619976 CUL7Q14999 1698 aa47.76■■■■■ 5.24
SYNRG-227ENST00000619976 SHROOM2Q13796 1616 aa47.75■■■■■ 5.23
SYNRG-227ENST00000619976 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.73■■■■■ 5.23
SYNRG-227ENST00000619976 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.62■■■■■ 5.21
SYNRG-227ENST00000619976 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.57■■■■■ 5.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms