RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619957.1

HOTTIP_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene HOTTIP_3, Length 337 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 NISCHQ9Y2I1 1504 aa14.01□□□□□ -0.17
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ABCC9O60706 1549 aa12.61□□□□□ -0.39
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa12.51□□□□□ -0.41
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.96□□□□□ -0.5
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 DCAF8L2P0C7V8 631 aa11.91□□□□□ -0.5
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 NACADO15069 1562 aa11.88□□□□□ -0.51
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11.84□□□□□ -0.51
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.77□□□□□ -0.53
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 MYO15BQ96JP2 1530 aa11.7□□□□□ -0.54
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.6□□□□□ -0.55
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.59□□□□□ -0.55
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa11.55□□□□□ -0.56
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SCRIBQ14160 1630 aa11.46□□□□□ -0.58
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa11.45□□□□□ -0.58
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.36□□□□□ -0.59
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.35□□□□□ -0.59
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 NCAPD3P42695 1498 aa10.99□□□□□ -0.65
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.95□□□□□ -0.66
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SMARCA4P51532 1647 aa10.91□□□□□ -0.66
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SMARCA2P51531 1590 aa10.9□□□□□ -0.66
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ERCC6Q03468 1493 aa10.89□□□□□ -0.67
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa10.88□□□□□ -0.67
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HMGXB3Q12766 1538 aa10.88□□□□□ -0.67
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.87□□□□□ -0.67
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CUX2O14529 1486 aa10.85□□□□□ -0.67
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 NESP48681 1621 aa10.82□□□□□ -0.68
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 MROH2BQ7Z745 1585 aa10.81□□□□□ -0.68
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.8□□□□□ -0.68
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.7□□□□□ -0.7
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PDS5BQ9NTI5 1447 aa10.69□□□□□ -0.7
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CADPSQ9ULU8 1353 aa10.67□□□□□ -0.7
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 WIZO95785 1651 aa10.64□□□□□ -0.71
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.61□□□□□ -0.71
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 MRC2Q9UBG0 1479 aa10.59□□□□□ -0.71
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 WDR62O43379 1518 aa10.55□□□□□ -0.72
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CEP164Q9UPV0 1460 aa10.55□□□□□ -0.72
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 FANCD2Q9BXW9 1451 aa10.54□□□□□ -0.72
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CFTRP13569 1480 aa10.53□□□□□ -0.72
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CCDC88BA6NC98 1476 aa10.42□□□□□ -0.74
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TRIM41Q8WV44 630 aa10.42□□□□□ -0.74
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 OSCARQ8IYS5 282 aa10.39□□□□□ -0.75
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 IFT140Q96RY7 1462 aa10.35□□□□□ -0.75
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TOPBP1Q92547 1522 aa10.33□□□□□ -0.76
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PRDM2Q13029 1718 aa10.31□□□□□ -0.76
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ABCC8Q09428 1581 aa10.3□□□□□ -0.76
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.27□□□□□ -0.76
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 FBLN2P98095 1184 aa10.21□□□□□ -0.77
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SOGA1O94964 1423 aa10.2□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.2□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.19□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.19□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.19□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ARHGEF11O15085 1522 aa10.18□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 FGD5Q6ZNL6 1462 aa10.17□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CYB5RLQ6IPT4 315 aa10.16□□□□□ -0.78
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CUX1P39880 1505 aa10.14□□□□□ -0.79
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.13□□□□□ -0.79
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CHD1O14646 1710 aa10.13□□□□□ -0.79
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 WDR97A6NE52 1622 aa10.1□□□□□ -0.79
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 GRIN2BQ13224 1484 aa10.1□□□□□ -0.79
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ARAP1Q96P48 1450 aa10.09□□□□□ -0.79
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SYNJ2O15056 1496 aa10.06□□□□□ -0.8
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 GAPVD1Q14C86 1478 aa10.06□□□□□ -0.8
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.05□□□□□ -0.8
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SYNJ1O43426 1573 aa10.05□□□□□ -0.8
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.04□□□□□ -0.8
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa10□□□□□ -0.81
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PBRM1Q86U86 1689 aa9.99□□□□□ -0.81
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 GRIN2AQ12879 1464 aa9.97□□□□□ -0.81
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TOP2BQ02880 1626 aa9.96□□□□□ -0.81
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.94□□□□□ -0.82
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ADAMTS12P58397 1594 aa9.94□□□□□ -0.82
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.94□□□□□ -0.82
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 NUP160Q12769 1436 aa9.93□□□□□ -0.82
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CEP170Q5SW79 1584 aa9.91□□□□□ -0.82
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.9□□□□□ -0.82
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.9□□□□□ -0.82
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 JPH4Q96JJ6 628 aa9.86□□□□□ -0.83
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SHROOM2Q13796 1616 aa9.85□□□□□ -0.83
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 KIF27Q86VH2 1401 aa9.82□□□□□ -0.84
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 IGF1RP08069 1367 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms