RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619377.1

MCRIP2-208, Transcript of MAPK regulated corepressor interacting protein 2, human

TSL 2

Gene MCRIP2, Length 727 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MCRIP2-208	ENST00000619377	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		45.66	■■■■■ 4.9
MCRIP2-208	ENST00000619377	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		40.7	■■■■■ 4.11
MCRIP2-208	ENST00000619377	ABCC9	O60706	1549 aa		39.79	■■■■□ 3.96
MCRIP2-208	ENST00000619377	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		38.34	■■■■□ 3.73
MCRIP2-208	ENST00000619377	NACAD	O15069	1562 aa		38.28	■■■■□ 3.72
MCRIP2-208	ENST00000619377	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		38.14	■■■■□ 3.7
MCRIP2-208	ENST00000619377	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		38.06	■■■■□ 3.68
MCRIP2-208	ENST00000619377	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	38.01	■■■■□ 3.67
MCRIP2-208	ENST00000619377	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		37.84	■■■■□ 3.65
MCRIP2-208	ENST00000619377	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		37.4	■■■■□ 3.58
MCRIP2-208	ENST00000619377	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	37.14	■■■■□ 3.54
MCRIP2-208	ENST00000619377	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		37.09	■■■■□ 3.53
MCRIP2-208	ENST00000619377	SCRIB	Q14160	1630 aa		37.03	■■■■□ 3.52
MCRIP2-208	ENST00000619377	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		36.85	■■■■□ 3.49
MCRIP2-208	ENST00000619377	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		36.53	■■■■□ 3.44
MCRIP2-208	ENST00000619377	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	36.16	■■■■□ 3.38
MCRIP2-208	ENST00000619377	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		36.02	■■■■□ 3.36
MCRIP2-208	ENST00000619377	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.8	■■■■□ 3.32
MCRIP2-208	ENST00000619377	SMARCA4	P51532	1647 aa		35.45	■■■■□ 3.27
MCRIP2-208	ENST00000619377	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	35.43	■■■■□ 3.26
MCRIP2-208	ENST00000619377	NCAPD3	P42695	1498 aa		35.29	■■■■□ 3.24
MCRIP2-208	ENST00000619377	SMARCA2	P51531	1590 aa		35.29	■■■■□ 3.24
MCRIP2-208	ENST00000619377	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		35.27	■■■■□ 3.24
MCRIP2-208	ENST00000619377	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		35.13	■■■■□ 3.21
MCRIP2-208	ENST00000619377	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		35.13	■■■■□ 3.21
MCRIP2-208	ENST00000619377	HMGXB3	Q12766	1538 aa		35.13	■■■■□ 3.21
MCRIP2-208	ENST00000619377	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	35.01	■■■■□ 3.19
MCRIP2-208	ENST00000619377	WIZ	O95785	1651 aa		34.76	■■■■□ 3.15
MCRIP2-208	ENST00000619377	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	34.72	■■■■□ 3.15
MCRIP2-208	ENST00000619377	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	34.44	■■■■□ 3.1
MCRIP2-208	ENST00000619377	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		34.4	■■■■□ 3.1
MCRIP2-208	ENST00000619377	NES	P48681	1621 aa		34.38	■■■■□ 3.09
MCRIP2-208	ENST00000619377	ERCC6	Q03468	1493 aa		34.38	■■■■□ 3.09
MCRIP2-208	ENST00000619377	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		34.25	■■■■□ 3.07
MCRIP2-208	ENST00000619377	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		34.19	■■■■□ 3.06
MCRIP2-208	ENST00000619377	CUX2	O14529	1486 aa		34.07	■■■■□ 3.05
MCRIP2-208	ENST00000619377	CFTR	P13569	1480 aa		34.03	■■■■□ 3.04
MCRIP2-208	ENST00000619377	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		34.03	■■■■□ 3.04
MCRIP2-208	ENST00000619377	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		34	■■■■□ 3.03
MCRIP2-208	ENST00000619377	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.94	■■■■□ 3.02
MCRIP2-208	ENST00000619377	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		33.85	■■■■□ 3.01
MCRIP2-208	ENST00000619377	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		33.84	■■■■□ 3.01
MCRIP2-208	ENST00000619377	PRDM2	Q13029	1718 aa		33.81	■■■■□ 3
MCRIP2-208	ENST00000619377	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		33.81	■■■■□ 3
MCRIP2-208	ENST00000619377	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33.75	■■■□□ 2.99
MCRIP2-208	ENST00000619377	WDR62	O43379	1518 aa		33.69	■■■□□ 2.98
MCRIP2-208	ENST00000619377	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
MCRIP2-208	ENST00000619377	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.45	■■■□□ 2.95
MCRIP2-208	ENST00000619377	ABCC8	Q09428	1581 aa		33.38	■■■□□ 2.93
MCRIP2-208	ENST00000619377	TOPBP1	Q92547	1522 aa		33.29	■■■□□ 2.92
MCRIP2-208	ENST00000619377	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		33.27	■■■□□ 2.92
MCRIP2-208	ENST00000619377	IFT140	Q96RY7	1462 aa		33.15	■■■□□ 2.9
MCRIP2-208	ENST00000619377	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
MCRIP2-208	ENST00000619377	CUX1	P39880	1505 aa		32.98	■■■□□ 2.87
MCRIP2-208	ENST00000619377	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
MCRIP2-208	ENST00000619377	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
MCRIP2-208	ENST00000619377	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.9	■■■□□ 2.86
MCRIP2-208	ENST00000619377	SOGA1	O94964	1423 aa		32.87	■■■□□ 2.85
MCRIP2-208	ENST00000619377	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
MCRIP2-208	ENST00000619377	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MCRIP2-208	ENST00000619377	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	32.78	■■■□□ 2.84
MCRIP2-208	ENST00000619377	WDR97	A6NE52	1622 aa		32.77	■■■□□ 2.84
MCRIP2-208	ENST00000619377	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	32.73	■■■□□ 2.83
MCRIP2-208	ENST00000619377	TOP2B	Q02880	1626 aa		32.73	■■■□□ 2.83
MCRIP2-208	ENST00000619377	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		32.73	■■■□□ 2.83
MCRIP2-208	ENST00000619377	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
MCRIP2-208	ENST00000619377	SYNJ1	O43426	1573 aa		32.66	■■■□□ 2.82
MCRIP2-208	ENST00000619377	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MCRIP2-208	ENST00000619377	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		32.61	■■■□□ 2.81
MCRIP2-208	ENST00000619377	GRIN2B	Q13224	1484 aa		32.53	■■■□□ 2.8
MCRIP2-208	ENST00000619377	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		32.51	■■■□□ 2.79
MCRIP2-208	ENST00000619377	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		32.48	■■■□□ 2.79
MCRIP2-208	ENST00000619377	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
MCRIP2-208	ENST00000619377	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		32.45	■■■□□ 2.79
MCRIP2-208	ENST00000619377	PBRM1	Q86U86	1689 aa		32.44	■■■□□ 2.78
MCRIP2-208	ENST00000619377	CHD1	O14646	1710 aa		32.43	■■■□□ 2.78
MCRIP2-208	ENST00000619377	FBLN2	P98095	1184 aa		32.38	■■■□□ 2.77
MCRIP2-208	ENST00000619377	SYNJ2	O15056	1496 aa		32.33	■■■□□ 2.77
MCRIP2-208	ENST00000619377	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
MCRIP2-208	ENST00000619377	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		32.25	■■■□□ 2.75
MCRIP2-208	ENST00000619377	ADAMTS12	P58397	1594 aa		32.17	■■■□□ 2.74
MCRIP2-208	ENST00000619377	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		32.15	■■■□□ 2.74
MCRIP2-208	ENST00000619377	KIF27	Q86VH2	1401 aa		32.13	■■■□□ 2.73
MCRIP2-208	ENST00000619377	GRIN2A	Q12879	1464 aa		32.09	■■■□□ 2.73
MCRIP2-208	ENST00000619377	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		32.08	■■■□□ 2.73
MCRIP2-208	ENST00000619377	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MCRIP2-208	ENST00000619377	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MCRIP2-208	ENST00000619377	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32.07	■■■□□ 2.72
MCRIP2-208	ENST00000619377	ARHGEF11	O15085	1522 aa		32.06	■■■□□ 2.72
MCRIP2-208	ENST00000619377	CUL7	Q14999	1698 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MCRIP2-208	ENST00000619377	IGF1R	P08069	1367 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MCRIP2-208	ENST00000619377	NUP160	Q12769	1436 aa		31.95	■■■□□ 2.71
MCRIP2-208	ENST00000619377	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.94	■■■□□ 2.7
MCRIP2-208	ENST00000619377	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.9	■■■□□ 2.7
MCRIP2-208	ENST00000619377	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		31.8	■■■□□ 2.68
MCRIP2-208	ENST00000619377	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.78	■■■□□ 2.68
MCRIP2-208	ENST00000619377	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.75	■■■□□ 2.67
MCRIP2-208	ENST00000619377	SHROOM2	Q13796	1616 aa		31.72	■■■□□ 2.67
MCRIP2-208	ENST00000619377	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		31.7	■■■□□ 2.66
MCRIP2-208	ENST00000619377	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		31.65	■■■□□ 2.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.2 ms