RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619337.4

YTHDF3-211, Transcript of YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene YTHDF3, Length 545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3-211ENST00000619337 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.07■■■■■ 6.73
YTHDF3-211ENST00000619337 ABCC9O60706 1549 aa51.26■■■■■ 5.8
YTHDF3-211ENST00000619337 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.74■■■■■ 5.71
YTHDF3-211ENST00000619337 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.65■■■■■ 5.38
YTHDF3-211ENST00000619337 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.53■■■■■ 5.36
YTHDF3-211ENST00000619337 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.19■■■■■ 5.3
YTHDF3-211ENST00000619337 NACADO15069 1562 aa48.03■■■■■ 5.28
YTHDF3-211ENST00000619337 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.58■■■■■ 5.21
YTHDF3-211ENST00000619337 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.45■■■■■ 5.19
YTHDF3-211ENST00000619337 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
YTHDF3-211ENST00000619337 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.28■■■■■ 5.16
YTHDF3-211ENST00000619337 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.15■■■■■ 5.14
YTHDF3-211ENST00000619337 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.07■■■■■ 5.13
YTHDF3-211ENST00000619337 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.52■■■■■ 5.04
YTHDF3-211ENST00000619337 SCRIBQ14160 1630 aa46.39■■■■■ 5.02
YTHDF3-211ENST00000619337 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.29■■■■■ 5
YTHDF3-211ENST00000619337 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.27■■■■■ 5
YTHDF3-211ENST00000619337 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
YTHDF3-211ENST00000619337 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.29■■■■■ 4.84
YTHDF3-211ENST00000619337 CUX2O14529 1486 aa44.57■■■■■ 4.73
YTHDF3-211ENST00000619337 ERCC6Q03468 1493 aa44.37■■■■■ 4.69
YTHDF3-211ENST00000619337 NCAPD3P42695 1498 aa44.35■■■■■ 4.69
YTHDF3-211ENST00000619337 SMARCA4P51532 1647 aa44.29■■■■■ 4.68
YTHDF3-211ENST00000619337 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.26■■■■■ 4.68
YTHDF3-211ENST00000619337 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.21■■■■■ 4.67
YTHDF3-211ENST00000619337 SMARCA2P51531 1590 aa44.13■■■■■ 4.65
YTHDF3-211ENST00000619337 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.97■■■■■ 4.63
YTHDF3-211ENST00000619337 HMGXB3Q12766 1538 aa43.97■■■■■ 4.63
YTHDF3-211ENST00000619337 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
YTHDF3-211ENST00000619337 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.81■■■■■ 4.6
YTHDF3-211ENST00000619337 NESP48681 1621 aa43.81■■■■■ 4.6
YTHDF3-211ENST00000619337 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.55■■■■■ 4.56
YTHDF3-211ENST00000619337 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.46■■■■■ 4.55
YTHDF3-211ENST00000619337 WIZO95785 1651 aa43.46■■■■■ 4.55
YTHDF3-211ENST00000619337 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
YTHDF3-211ENST00000619337 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.26■■■■■ 4.52
YTHDF3-211ENST00000619337 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.19■■■■■ 4.5
YTHDF3-211ENST00000619337 CADPSQ9ULU8 1353 aa43■■■■■ 4.47
YTHDF3-211ENST00000619337 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
YTHDF3-211ENST00000619337 TRIM41Q8WV44 630 aa42.98■■■■■ 4.47
YTHDF3-211ENST00000619337 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.92■■■■■ 4.46
YTHDF3-211ENST00000619337 WDR62O43379 1518 aa42.83■■■■■ 4.45
YTHDF3-211ENST00000619337 CFTRP13569 1480 aa42.6■■■■■ 4.41
YTHDF3-211ENST00000619337 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.6■■■■■ 4.41
YTHDF3-211ENST00000619337 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.56■■■■■ 4.4
YTHDF3-211ENST00000619337 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.47■■■■■ 4.39
YTHDF3-211ENST00000619337 OSCARQ8IYS5 282 aa42.36■■■■■ 4.37
YTHDF3-211ENST00000619337 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
YTHDF3-211ENST00000619337 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
YTHDF3-211ENST00000619337 PRDM2Q13029 1718 aa42.05■■■■■ 4.32
YTHDF3-211ENST00000619337 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.85■■■■■ 4.29
YTHDF3-211ENST00000619337 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.85■■■■■ 4.29
YTHDF3-211ENST00000619337 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.85■■■■■ 4.29
YTHDF3-211ENST00000619337 IFT140Q96RY7 1462 aa41.79■■■■■ 4.28
YTHDF3-211ENST00000619337 ABCC8Q09428 1581 aa41.76■■■■■ 4.27
YTHDF3-211ENST00000619337 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
YTHDF3-211ENST00000619337 TOPBP1Q92547 1522 aa41.71■■■■■ 4.27
YTHDF3-211ENST00000619337 ARHGEF11O15085 1522 aa41.68■■■■■ 4.26
YTHDF3-211ENST00000619337 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.61■■■■■ 4.25
YTHDF3-211ENST00000619337 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
YTHDF3-211ENST00000619337 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.38■■■■■ 4.21
YTHDF3-211ENST00000619337 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
YTHDF3-211ENST00000619337 SOGA1O94964 1423 aa41.28■■■■■ 4.2
YTHDF3-211ENST00000619337 CUX1P39880 1505 aa41.26■■■■■ 4.2
YTHDF3-211ENST00000619337 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.25■■■■■ 4.191e-8■■■■■ 44.7
YTHDF3-211ENST00000619337 CHD1O14646 1710 aa41.24■■■■■ 4.19
YTHDF3-211ENST00000619337 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
YTHDF3-211ENST00000619337 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.21■■■■■ 4.19
YTHDF3-211ENST00000619337 ARAP1Q96P48 1450 aa41.21■■■■■ 4.19
YTHDF3-211ENST00000619337 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.21■■■■■ 4.19
YTHDF3-211ENST00000619337 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
YTHDF3-211ENST00000619337 FBLN2P98095 1184 aa41.13■■■■■ 4.17
YTHDF3-211ENST00000619337 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
YTHDF3-211ENST00000619337 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.99■■■■■ 4.15
YTHDF3-211ENST00000619337 WDR97A6NE52 1622 aa40.85■■■■■ 4.13
YTHDF3-211ENST00000619337 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.85■■■■■ 4.13
YTHDF3-211ENST00000619337 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.83■■■■■ 4.13
YTHDF3-211ENST00000619337 TOP2BQ02880 1626 aa40.81■■■■■ 4.12
YTHDF3-211ENST00000619337 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.78■■■■■ 4.12
YTHDF3-211ENST00000619337 GRIN2BQ13224 1484 aa40.77■■■■■ 4.12
YTHDF3-211ENST00000619337 SYNJ1O43426 1573 aa40.77■■■■■ 4.12
YTHDF3-211ENST00000619337 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.75■■■■■ 4.11
YTHDF3-211ENST00000619337 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.75■■■■■ 4.11
YTHDF3-211ENST00000619337 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
YTHDF3-211ENST00000619337 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
YTHDF3-211ENST00000619337 SYNJ2O15056 1496 aa40.61■■■■■ 4.09
YTHDF3-211ENST00000619337 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.54■■■■■ 4.08
YTHDF3-211ENST00000619337 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
YTHDF3-211ENST00000619337 PBRM1Q86U86 1689 aa40.5■■■■■ 4.07
YTHDF3-211ENST00000619337 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.28■■■■■ 4.04
YTHDF3-211ENST00000619337 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.27■■■■■ 4.04
YTHDF3-211ENST00000619337 ADAMTS12P58397 1594 aa40.21■■■■■ 4.03
YTHDF3-211ENST00000619337 GRIN2AQ12879 1464 aa40.2■■■■■ 4.03
YTHDF3-211ENST00000619337 KIF27Q86VH2 1401 aa40.19■■■■■ 4.02
YTHDF3-211ENST00000619337 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.07■■■■■ 4.01
YTHDF3-211ENST00000619337 IGF1RP08069 1367 aa40.05■■■■■ 4
YTHDF3-211ENST00000619337 NUP160Q12769 1436 aa40.03■■■■■ 4
YTHDF3-211ENST00000619337 CEP170Q5SW79 1584 aa40.01■■■■■ 4
YTHDF3-211ENST00000619337 SHROOM2Q13796 1616 aa39.9■■■■□ 3.98
YTHDF3-211ENST00000619337 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.84■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.1 ms