RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619337.4

YTHDF3-211, Transcript of YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene YTHDF3, Length 545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3-211ENST00000619337 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.07■■■■■ 6.73
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YTHDF3-211ENST00000619337 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.53■■■■■ 5.36
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YTHDF3-211ENST00000619337 SCRIBQ14160 1630 aa46.39■■■■■ 5.02
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YTHDF3-211ENST00000619337 SMARCA2P51531 1590 aa44.13■■■■■ 4.65
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YTHDF3-211ENST00000619337 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
YTHDF3-211ENST00000619337 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.26■■■■■ 4.52
YTHDF3-211ENST00000619337 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.19■■■■■ 4.5
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YTHDF3-211ENST00000619337 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.92■■■■■ 4.46
YTHDF3-211ENST00000619337 WDR62O43379 1518 aa42.83■■■■■ 4.45
YTHDF3-211ENST00000619337 CFTRP13569 1480 aa42.6■■■■■ 4.41
YTHDF3-211ENST00000619337 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.6■■■■■ 4.41
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YTHDF3-211ENST00000619337 OSCARQ8IYS5 282 aa42.36■■■■■ 4.37
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YTHDF3-211ENST00000619337 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.85■■■■■ 4.29
YTHDF3-211ENST00000619337 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.85■■■■■ 4.29
YTHDF3-211ENST00000619337 IFT140Q96RY7 1462 aa41.79■■■■■ 4.28
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YTHDF3-211ENST00000619337 ARHGEF11O15085 1522 aa41.68■■■■■ 4.26
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YTHDF3-211ENST00000619337 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.21■■■■■ 4.19
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YTHDF3-211ENST00000619337 FBLN2P98095 1184 aa41.13■■■■■ 4.17
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YTHDF3-211ENST00000619337 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.83■■■■■ 4.13
YTHDF3-211ENST00000619337 TOP2BQ02880 1626 aa40.81■■■■■ 4.12
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YTHDF3-211ENST00000619337 GRIN2BQ13224 1484 aa40.77■■■■■ 4.12
YTHDF3-211ENST00000619337 SYNJ1O43426 1573 aa40.77■■■■■ 4.12
YTHDF3-211ENST00000619337 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.75■■■■■ 4.11
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YTHDF3-211ENST00000619337 GRIN2AQ12879 1464 aa40.2■■■■■ 4.03
YTHDF3-211ENST00000619337 KIF27Q86VH2 1401 aa40.19■■■■■ 4.02
YTHDF3-211ENST00000619337 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.07■■■■■ 4.01
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YTHDF3-211ENST00000619337 NUP160Q12769 1436 aa40.03■■■■■ 4
YTHDF3-211ENST00000619337 CEP170Q5SW79 1584 aa40.01■■■■■ 4
YTHDF3-211ENST00000619337 SHROOM2Q13796 1616 aa39.9■■■■□ 3.98
YTHDF3-211ENST00000619337 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.84■■■■□ 3.97
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