RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619252.4

CU633967.1-201, humanhuman

TSL 2

Gene CU633967.1, Length 549 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633967.1-201ENST00000619252 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.86■■□□□ 1.57
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa22.46■■□□□ 1.19
CU633967.1-201ENST00000619252 ABCC9O60706 1549 aa22.29■■□□□ 1.16
CU633967.1-201ENST00000619252 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.33■■□□□ 1.01
CU633967.1-201ENST00000619252 NACADO15069 1562 aa21.17■□□□□ 0.98
CU633967.1-201ENST00000619252 MYO15BQ96JP2 1530 aa20.88■□□□□ 0.93
CU633967.1-201ENST00000619252 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.87■□□□□ 0.93
CU633967.1-201ENST00000619252 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.81■□□□□ 0.92
CU633967.1-201ENST00000619252 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.78■□□□□ 0.92
CU633967.1-201ENST00000619252 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.63■□□□□ 0.89
CU633967.1-201ENST00000619252 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
CU633967.1-201ENST00000619252 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CU633967.1-201ENST00000619252 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa20.6■□□□□ 0.89
CU633967.1-201ENST00000619252 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.5■□□□□ 0.87
CU633967.1-201ENST00000619252 SCRIBQ14160 1630 aa20.35■□□□□ 0.85
CU633967.1-201ENST00000619252 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.2■□□□□ 0.82
CU633967.1-201ENST00000619252 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CU633967.1-201ENST00000619252 CECR2Q9BXF3 1484 aa20.11■□□□□ 0.81
CU633967.1-201ENST00000619252 NCAPD3P42695 1498 aa19.47■□□□□ 0.71
CU633967.1-201ENST00000619252 SMARCA2P51531 1590 aa19.44■□□□□ 0.7
CU633967.1-201ENST00000619252 SMARCA4P51532 1647 aa19.43■□□□□ 0.7
CU633967.1-201ENST00000619252 HMGXB3Q12766 1538 aa19.42■□□□□ 0.7
CU633967.1-201ENST00000619252 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa19.4■□□□□ 0.7
CU633967.1-201ENST00000619252 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
CU633967.1-201ENST00000619252 CUX2O14529 1486 aa19.33■□□□□ 0.68
CU633967.1-201ENST00000619252 ERCC6Q03468 1493 aa19.31■□□□□ 0.68
CU633967.1-201ENST00000619252 PEG3Q9GZU2 1588 aa19.27■□□□□ 0.68
CU633967.1-201ENST00000619252 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
CU633967.1-201ENST00000619252 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa19.19■□□□□ 0.66
CU633967.1-201ENST00000619252 NESP48681 1621 aa19.12■□□□□ 0.65
CU633967.1-201ENST00000619252 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa19.11■□□□□ 0.65
CU633967.1-201ENST00000619252 MROH2BQ7Z745 1585 aa19.1■□□□□ 0.65
CU633967.1-201ENST00000619252 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
CU633967.1-201ENST00000619252 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19■□□□□ 0.63
CU633967.1-201ENST00000619252 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.95■□□□□ 0.62
CU633967.1-201ENST00000619252 WIZO95785 1651 aa18.91■□□□□ 0.62
CU633967.1-201ENST00000619252 CADPSQ9ULU8 1353 aa18.85■□□□□ 0.61
CU633967.1-201ENST00000619252 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.8■□□□□ 0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 WDR62O43379 1518 aa18.78■□□□□ 0.6
CU633967.1-201ENST00000619252 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.73■□□□□ 0.59
CU633967.1-201ENST00000619252 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CU633967.1-201ENST00000619252 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CU633967.1-201ENST00000619252 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.67■□□□□ 0.58
CU633967.1-201ENST00000619252 PRDM2Q13029 1718 aa18.66■□□□□ 0.58
CU633967.1-201ENST00000619252 CFTRP13569 1480 aa18.66■□□□□ 0.58
CU633967.1-201ENST00000619252 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CU633967.1-201ENST00000619252 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.41■□□□□ 0.54
CU633967.1-201ENST00000619252 IFT140Q96RY7 1462 aa18.35■□□□□ 0.53
CU633967.1-201ENST00000619252 ABCC8Q09428 1581 aa18.33■□□□□ 0.52
CU633967.1-201ENST00000619252 TOPBP1Q92547 1522 aa18.33■□□□□ 0.52
CU633967.1-201ENST00000619252 TRIM41Q8WV44 630 aa18.31■□□□□ 0.52
CU633967.1-201ENST00000619252 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.3■□□□□ 0.52
CU633967.1-201ENST00000619252 OSCARQ8IYS5 282 aa18.3■□□□□ 0.52
CU633967.1-201ENST00000619252 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CU633967.1-201ENST00000619252 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa18.18■□□□□ 0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa18.18■□□□□ 0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa18.18■□□□□ 0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 CHD1O14646 1710 aa18.15■□□□□ 0.5
CU633967.1-201ENST00000619252 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CU633967.1-201ENST00000619252 WDR97A6NE52 1622 aa18.11■□□□□ 0.49
CU633967.1-201ENST00000619252 ARHGEF11O15085 1522 aa18.1■□□□□ 0.49
CU633967.1-201ENST00000619252 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.06■□□□□ 0.48
CU633967.1-201ENST00000619252 FGD5Q6ZNL6 1462 aa18.01■□□□□ 0.47
CU633967.1-201ENST00000619252 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa18■□□□□ 0.47
CU633967.1-201ENST00000619252 SOGA1O94964 1423 aa17.99■□□□□ 0.47
CU633967.1-201ENST00000619252 CUX1P39880 1505 aa17.98■□□□□ 0.47
CU633967.1-201ENST00000619252 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa17.95■□□□□ 0.46
CU633967.1-201ENST00000619252 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CU633967.1-201ENST00000619252 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
CU633967.1-201ENST00000619252 SYNJ1O43426 1573 aa17.92■□□□□ 0.46
CU633967.1-201ENST00000619252 PBRM1Q86U86 1689 aa17.92■□□□□ 0.46
CU633967.1-201ENST00000619252 GRIN2BQ13224 1484 aa17.91■□□□□ 0.46
CU633967.1-201ENST00000619252 FBLN2P98095 1184 aa17.91■□□□□ 0.46
CU633967.1-201ENST00000619252 ARAP1Q96P48 1450 aa17.9■□□□□ 0.46
CU633967.1-201ENST00000619252 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.9■□□□□ 0.46
CU633967.1-201ENST00000619252 SYNJ2O15056 1496 aa17.86■□□□□ 0.45
CU633967.1-201ENST00000619252 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa17.85■□□□□ 0.45
CU633967.1-201ENST00000619252 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CU633967.1-201ENST00000619252 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.83■□□□□ 0.45
CU633967.1-201ENST00000619252 CYB5RLQ6IPT4 315 aa17.83■□□□□ 0.44
CU633967.1-201ENST00000619252 GAPVD1Q14C86 1478 aa17.82■□□□□ 0.44
CU633967.1-201ENST00000619252 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
CU633967.1-201ENST00000619252 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.77■□□□□ 0.44
CU633967.1-201ENST00000619252 TOP2BQ02880 1626 aa17.74■□□□□ 0.43
CU633967.1-201ENST00000619252 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.72■□□□□ 0.43
CU633967.1-201ENST00000619252 ADAMTS12P58397 1594 aa17.72■□□□□ 0.43
CU633967.1-201ENST00000619252 GRIN2AQ12879 1464 aa17.68■□□□□ 0.42
CU633967.1-201ENST00000619252 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
CU633967.1-201ENST00000619252 ERICH3Q5RHP9 1530 aa17.63■□□□□ 0.41
CU633967.1-201ENST00000619252 CEP170Q5SW79 1584 aa17.62■□□□□ 0.41
CU633967.1-201ENST00000619252 NUP160Q12769 1436 aa17.61■□□□□ 0.41
CU633967.1-201ENST00000619252 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.6■□□□□ 0.41
CU633967.1-201ENST00000619252 SHROOM2Q13796 1616 aa17.6■□□□□ 0.41
CU633967.1-201ENST00000619252 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.53■□□□□ 0.4
CU633967.1-201ENST00000619252 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.47■□□□□ 0.39
CU633967.1-201ENST00000619252 CUL7Q14999 1698 aa17.42■□□□□ 0.38
CU633967.1-201ENST00000619252 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
CU633967.1-201ENST00000619252 KIF13AQ9H1H9 1805 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.7 ms