RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619214.4

PRSS1-207, Transcript of serine protease 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PRSS1, Length 787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS1-207ENST00000619214 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.02■■■□□ 2.24
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PRSS1-207ENST00000619214 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.59■■□□□ 1.53
PRSS1-207ENST00000619214 NACADO15069 1562 aa24.51■■□□□ 1.51
PRSS1-207ENST00000619214 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.32■■□□□ 1.48
PRSS1-207ENST00000619214 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.31■■□□□ 1.48
PRSS1-207ENST00000619214 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PRSS1-207ENST00000619214 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.09■■□□□ 1.45
PRSS1-207ENST00000619214 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.96■■□□□ 1.43
PRSS1-207ENST00000619214 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
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PRSS1-207ENST00000619214 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.67■■□□□ 1.38
PRSS1-207ENST00000619214 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.57■■□□□ 1.36
PRSS1-207ENST00000619214 SCRIBQ14160 1630 aa23.56■■□□□ 1.36
PRSS1-207ENST00000619214 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
PRSS1-207ENST00000619214 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.13■■□□□ 1.29
PRSS1-207ENST00000619214 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.03■■□□□ 1.28
PRSS1-207ENST00000619214 NCAPD3P42695 1498 aa22.58■■□□□ 1.2
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PRSS1-207ENST00000619214 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PRSS1-207ENST00000619214 SMARCA2P51531 1590 aa22.55■■□□□ 1.2
PRSS1-207ENST00000619214 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.51■■□□□ 1.19
PRSS1-207ENST00000619214 HMGXB3Q12766 1538 aa22.47■■□□□ 1.19
PRSS1-207ENST00000619214 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.4■■□□□ 1.18
PRSS1-207ENST00000619214 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PRSS1-207ENST00000619214 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.29■■□□□ 1.16
PRSS1-207ENST00000619214 ERCC6Q03468 1493 aa22.12■■□□□ 1.13
PRSS1-207ENST00000619214 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.06■■□□□ 1.12
PRSS1-207ENST00000619214 WIZO95785 1651 aa22.04■■□□□ 1.12
PRSS1-207ENST00000619214 CUX2O14529 1486 aa22.03■■□□□ 1.12
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PRSS1-207ENST00000619214 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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PRSS1-207ENST00000619214 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.9■■□□□ 1.1
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PRSS1-207ENST00000619214 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.66■■□□□ 1.06
PRSS1-207ENST00000619214 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.65■■□□□ 1.06
PRSS1-207ENST00000619214 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.63■■□□□ 1.05
PRSS1-207ENST00000619214 PRDM2Q13029 1718 aa21.6■■□□□ 1.05
PRSS1-207ENST00000619214 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.6■■□□□ 1.05
PRSS1-207ENST00000619214 WDR62O43379 1518 aa21.59■■□□□ 1.05
PRSS1-207ENST00000619214 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.56■■□□□ 1.04
PRSS1-207ENST00000619214 ABCC8Q09428 1581 aa21.37■■□□□ 1.01
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PRSS1-207ENST00000619214 TOPBP1Q92547 1522 aa21.24■□□□□ 0.99
PRSS1-207ENST00000619214 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.23■□□□□ 0.99
PRSS1-207ENST00000619214 IFT140Q96RY7 1462 aa21.22■□□□□ 0.99
PRSS1-207ENST00000619214 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
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PRSS1-207ENST00000619214 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
PRSS1-207ENST00000619214 CHD1O14646 1710 aa20.79■□□□□ 0.92
PRSS1-207ENST00000619214 GRIN2BQ13224 1484 aa20.79■□□□□ 0.92
PRSS1-207ENST00000619214 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.78■□□□□ 0.92
PRSS1-207ENST00000619214 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PRSS1-207ENST00000619214 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.78■□□□□ 0.92
PRSS1-207ENST00000619214 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.77■□□□□ 0.92
PRSS1-207ENST00000619214 TOP2BQ02880 1626 aa20.76■□□□□ 0.91
PRSS1-207ENST00000619214 FBLN2P98095 1184 aa20.75■□□□□ 0.91
PRSS1-207ENST00000619214 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.74■□□□□ 0.91
PRSS1-207ENST00000619214 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.72■□□□□ 0.91
PRSS1-207ENST00000619214 PBRM1Q86U86 1689 aa20.7■□□□□ 0.91
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PRSS1-207ENST00000619214 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.67■□□□□ 0.9
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PRSS1-207ENST00000619214 SHROOM2Q13796 1616 aa20.28■□□□□ 0.84
PRSS1-207ENST00000619214 JPH4Q96JJ6 628 aa20.22■□□□□ 0.83
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PRSS1-207ENST00000619214 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.19■□□□□ 0.82
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