RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.51■■■■■ 5.52
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.58■■■■■ 4.57
CSAG3-202ENST00000617158 ABCC9O60706 1549 aa41.85■■■■■ 4.29
CSAG3-202ENST00000617158 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
CSAG3-202ENST00000617158 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.97■■■■■ 4.15
CSAG3-202ENST00000617158 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.89■■■■■ 4.14
CSAG3-202ENST00000617158 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.79■■■■■ 4.12
CSAG3-202ENST00000617158 NACADO15069 1562 aa40.74■■■■■ 4.11
CSAG3-202ENST00000617158 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.55■■■■■ 4.08
CSAG3-202ENST00000617158 SCRIBQ14160 1630 aa39.89■■■■□ 3.98
CSAG3-202ENST00000617158 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.83■■■■□ 3.97
CSAG3-202ENST00000617158 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.66■■■■□ 3.94
CSAG3-202ENST00000617158 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.48■■■■□ 3.91
CSAG3-202ENST00000617158 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.27■■■■□ 3.88
CSAG3-202ENST00000617158 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.55■■■■□ 3.76
CSAG3-202ENST00000617158 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
CSAG3-202ENST00000617158 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.24■■■■□ 3.71
CSAG3-202ENST00000617158 SMARCA4P51532 1647 aa38.23■■■■□ 3.71
CSAG3-202ENST00000617158 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.23■■■■□ 3.71
CSAG3-202ENST00000617158 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
CSAG3-202ENST00000617158 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.9■■■■□ 3.66
CSAG3-202ENST00000617158 WIZO95785 1651 aa37.86■■■■□ 3.65
CSAG3-202ENST00000617158 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.85■■■■□ 3.65
CSAG3-202ENST00000617158 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.8■■■■□ 3.64
CSAG3-202ENST00000617158 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.75■■■■□ 3.63
CSAG3-202ENST00000617158 SMARCA2P51531 1590 aa37.72■■■■□ 3.63
CSAG3-202ENST00000617158 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
CSAG3-202ENST00000617158 NCAPD3P42695 1498 aa37.62■■■■□ 3.61
CSAG3-202ENST00000617158 HMGXB3Q12766 1538 aa37.5■■■■□ 3.59
CSAG3-202ENST00000617158 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.47■■■■□ 3.59
CSAG3-202ENST00000617158 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.44■■■■□ 3.58
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.04■■■■□ 3.52
CSAG3-202ENST00000617158 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.54■■■■□ 3.44
CSAG3-202ENST00000617158 NESP48681 1621 aa36.54■■■■□ 3.44
CSAG3-202ENST00000617158 CFTRP13569 1480 aa36.54■■■■□ 3.44
CSAG3-202ENST00000617158 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.44■■■■□ 3.42
CSAG3-202ENST00000617158 PRDM2Q13029 1718 aa36.35■■■■□ 3.41
CSAG3-202ENST00000617158 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.14■■■■□ 3.38
CSAG3-202ENST00000617158 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.11■■■■□ 3.37
CSAG3-202ENST00000617158 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.11■■■■□ 3.37
CSAG3-202ENST00000617158 ABCC8Q09428 1581 aa35.98■■■■□ 3.35
CSAG3-202ENST00000617158 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.97■■■■□ 3.35
CSAG3-202ENST00000617158 ERCC6Q03468 1493 aa35.87■■■■□ 3.33
CSAG3-202ENST00000617158 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
CSAG3-202ENST00000617158 CUX1P39880 1505 aa35.8■■■■□ 3.32
CSAG3-202ENST00000617158 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.8■■■■□ 3.32
CSAG3-202ENST00000617158 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.78■■■■□ 3.32
CSAG3-202ENST00000617158 SYNJ1O43426 1573 aa35.77■■■■□ 3.32
CSAG3-202ENST00000617158 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
CSAG3-202ENST00000617158 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.76■■■■□ 3.32
CSAG3-202ENST00000617158 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.7■■■■□ 3.31
CSAG3-202ENST00000617158 TOPBP1Q92547 1522 aa35.7■■■■□ 3.31
CSAG3-202ENST00000617158 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.68■■■■□ 3.3
CSAG3-202ENST00000617158 TOP2BQ02880 1626 aa35.67■■■■□ 3.3
CSAG3-202ENST00000617158 WDR62O43379 1518 aa35.65■■■■□ 3.3
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM41Q8WV44 630 aa35.5■■■■□ 3.27
CSAG3-202ENST00000617158 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.48■■■■□ 3.27
CSAG3-202ENST00000617158 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
CSAG3-202ENST00000617158 CUX2O14529 1486 aa35.39■■■■□ 3.26
CSAG3-202ENST00000617158 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.33■■■■□ 3.25
CSAG3-202ENST00000617158 SOGA1O94964 1423 aa35.28■■■■□ 3.24
CSAG3-202ENST00000617158 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
CSAG3-202ENST00000617158 WDR97A6NE52 1622 aa35.21■■■■□ 3.23
CSAG3-202ENST00000617158 IFT140Q96RY7 1462 aa35.18■■■■□ 3.22
CSAG3-202ENST00000617158 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.17■■■■□ 3.22
CSAG3-202ENST00000617158 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.1■■■■□ 3.21
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.21
CSAG3-202ENST00000617158 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
CSAG3-202ENST00000617158 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.99■■■■□ 3.19
CSAG3-202ENST00000617158 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.95■■■■□ 3.19
CSAG3-202ENST00000617158 KIF27Q86VH2 1401 aa34.94■■■■□ 3.18
CSAG3-202ENST00000617158 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
CSAG3-202ENST00000617158 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.88■■■■□ 3.17
CSAG3-202ENST00000617158 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
CSAG3-202ENST00000617158 EEA1Q15075 1411 aa34.82■■■■□ 3.17
CSAG3-202ENST00000617158 PBRM1Q86U86 1689 aa34.8■■■■□ 3.16
CSAG3-202ENST00000617158 IGF1RP08069 1367 aa34.79■■■■□ 3.16
CSAG3-202ENST00000617158 GRIN2BQ13224 1484 aa34.74■■■■□ 3.15
CSAG3-202ENST00000617158 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.73■■■■□ 3.15
CSAG3-202ENST00000617158 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.72■■■■□ 3.15
CSAG3-202ENST00000617158 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.62■■■■□ 3.13
CSAG3-202ENST00000617158 PRXQ9BXM0 1461 aa34.59■■■■□ 3.13
CSAG3-202ENST00000617158 ADAMTS12P58397 1594 aa34.57■■■■□ 3.13
CSAG3-202ENST00000617158 CUL7Q14999 1698 aa34.57■■■■□ 3.13
CSAG3-202ENST00000617158 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.55■■■■□ 3.12
CSAG3-202ENST00000617158 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
CSAG3-202ENST00000617158 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.5■■■■□ 3.11
CSAG3-202ENST00000617158 KIF21BO75037 1637 aa34.5■■■■□ 3.11
CSAG3-202ENST00000617158 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.45■■■■□ 3.1
CSAG3-202ENST00000617158 SYNJ2O15056 1496 aa34.42■■■■□ 3.1
CSAG3-202ENST00000617158 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.35■■■■□ 3.09
CSAG3-202ENST00000617158 CHD1O14646 1710 aa34.35■■■■□ 3.09
CSAG3-202ENST00000617158 GRIN2AQ12879 1464 aa34.33■■■■□ 3.09
CSAG3-202ENST00000617158 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.32■■■■□ 3.08
CSAG3-202ENST00000617158 GOLGA3Q08378 1498 aa34.32■■■■□ 3.08
CSAG3-202ENST00000617158 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
CSAG3-202ENST00000617158 FBLN2P98095 1184 aa34.23■■■■□ 3.07
CSAG3-202ENST00000617158 CEP170Q5SW79 1584 aa34.19■■■■□ 3.06
CSAG3-202ENST00000617158 NUP160Q12769 1436 aa34.16■■■■□ 3.06
CSAG3-202ENST00000617158 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.7 ms