RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616237.1

LHX1-202, Transcript of LIM homeobox 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LHX1, Length 1,364 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1-202ENST00000616237 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.74■■■■■ 4.27
LHX1-202ENST00000616237 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.11■■■■□ 3.53
LHX1-202ENST00000616237 ABCC9O60706 1549 aa36.53■■■■□ 3.44
LHX1-202ENST00000616237 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35■■■■□ 3.19
LHX1-202ENST00000616237 NACADO15069 1562 aa34.94■■■■□ 3.18
LHX1-202ENST00000616237 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.92■■■■□ 3.18
LHX1-202ENST00000616237 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
LHX1-202ENST00000616237 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.69■■■■□ 3.14
LHX1-202ENST00000616237 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.5■■■■□ 3.11
LHX1-202ENST00000616237 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.25■■■■□ 3.07
LHX1-202ENST00000616237 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.14■■■■□ 3.06
LHX1-202ENST00000616237 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.04■■■■□ 3.04
LHX1-202ENST00000616237 SCRIBQ14160 1630 aa33.9■■■■□ 3.02
LHX1-202ENST00000616237 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.76■■■■□ 3
LHX1-202ENST00000616237 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.55■■■□□ 2.96
LHX1-202ENST00000616237 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
LHX1-202ENST00000616237 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.02■■■□□ 2.88
LHX1-202ENST00000616237 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.82■■■□□ 2.84
LHX1-202ENST00000616237 SMARCA4P51532 1647 aa32.41■■■□□ 2.78
LHX1-202ENST00000616237 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
LHX1-202ENST00000616237 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.29■■■□□ 2.76
LHX1-202ENST00000616237 NCAPD3P42695 1498 aa32.29■■■□□ 2.76
LHX1-202ENST00000616237 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.2■■■□□ 2.74
LHX1-202ENST00000616237 SMARCA2P51531 1590 aa32.18■■■□□ 2.74
LHX1-202ENST00000616237 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.09■■■□□ 2.73
LHX1-202ENST00000616237 HMGXB3Q12766 1538 aa32.07■■■□□ 2.72
LHX1-202ENST00000616237 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
LHX1-202ENST00000616237 WIZO95785 1651 aa31.83■■■□□ 2.69
LHX1-202ENST00000616237 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
LHX1-202ENST00000616237 NESP48681 1621 aa31.6■■■□□ 2.65
LHX1-202ENST00000616237 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
LHX1-202ENST00000616237 ERCC6Q03468 1493 aa31.43■■■□□ 2.62
LHX1-202ENST00000616237 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.41■■■□□ 2.62
LHX1-202ENST00000616237 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.33■■■□□ 2.61
LHX1-202ENST00000616237 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.2■■■□□ 2.59
LHX1-202ENST00000616237 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.16■■■□□ 2.58
LHX1-202ENST00000616237 CUX2O14529 1486 aa31.16■■■□□ 2.58
LHX1-202ENST00000616237 CFTRP13569 1480 aa31.12■■■□□ 2.57
LHX1-202ENST00000616237 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.12■■■□□ 2.57
LHX1-202ENST00000616237 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
LHX1-202ENST00000616237 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.96■■■□□ 2.55
LHX1-202ENST00000616237 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.92■■■□□ 2.54
LHX1-202ENST00000616237 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.92■■■□□ 2.54
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LHX1-202ENST00000616237 WDR62O43379 1518 aa30.83■■■□□ 2.53
LHX1-202ENST00000616237 PRDM2Q13029 1718 aa30.79■■■□□ 2.52
LHX1-202ENST00000616237 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.51
LHX1-202ENST00000616237 TOPBP1Q92547 1522 aa30.47■■■□□ 2.47
LHX1-202ENST00000616237 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.44■■■□□ 2.46
LHX1-202ENST00000616237 ABCC8Q09428 1581 aa30.39■■■□□ 2.45
LHX1-202ENST00000616237 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.39■■■□□ 2.45
LHX1-202ENST00000616237 IFT140Q96RY7 1462 aa30.27■■■□□ 2.44
LHX1-202ENST00000616237 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
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LHX1-202ENST00000616237 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
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LHX1-202ENST00000616237 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.11■■■□□ 2.41
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LHX1-202ENST00000616237 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
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LHX1-202ENST00000616237 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
LHX1-202ENST00000616237 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.93■■■□□ 2.38
LHX1-202ENST00000616237 SYNJ1O43426 1573 aa29.88■■■□□ 2.37
LHX1-202ENST00000616237 TOP2BQ02880 1626 aa29.86■■■□□ 2.37
LHX1-202ENST00000616237 OSCARQ8IYS5 282 aa29.86■■■□□ 2.37
LHX1-202ENST00000616237 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.85■■■□□ 2.37
LHX1-202ENST00000616237 WDR97A6NE52 1622 aa29.84■■■□□ 2.37
LHX1-202ENST00000616237 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.79■■■□□ 2.36
LHX1-202ENST00000616237 GRIN2BQ13224 1484 aa29.71■■■□□ 2.35
LHX1-202ENST00000616237 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.71■■■□□ 2.35
LHX1-202ENST00000616237 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.71■■■□□ 2.35
LHX1-202ENST00000616237 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.68■■■□□ 2.34
LHX1-202ENST00000616237 CHD1O14646 1710 aa29.68■■■□□ 2.34
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LHX1-202ENST00000616237 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
LHX1-202ENST00000616237 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.41■■■□□ 2.3
LHX1-202ENST00000616237 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.41■■■□□ 2.3
LHX1-202ENST00000616237 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.41■■■□□ 2.3
LHX1-202ENST00000616237 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.41■■■□□ 2.3
LHX1-202ENST00000616237 ADAMTS12P58397 1594 aa29.41■■■□□ 2.3
LHX1-202ENST00000616237 ARHGEF11O15085 1522 aa29.4■■■□□ 2.3
LHX1-202ENST00000616237 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.39■■■□□ 2.3
LHX1-202ENST00000616237 TRIM41Q8WV44 630 aa29.36■■■□□ 2.29
LHX1-202ENST00000616237 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.35■■■□□ 2.29
LHX1-202ENST00000616237 GRIN2AQ12879 1464 aa29.35■■■□□ 2.29
LHX1-202ENST00000616237 KIF27Q86VH2 1401 aa29.29■■■□□ 2.28
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LHX1-202ENST00000616237 NUP160Q12769 1436 aa29.24■■■□□ 2.27
LHX1-202ENST00000616237 CEP170Q5SW79 1584 aa29.23■■■□□ 2.27
LHX1-202ENST00000616237 ARAP1Q96P48 1450 aa29.18■■■□□ 2.26
LHX1-202ENST00000616237 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.14■■■□□ 2.26
LHX1-202ENST00000616237 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.09■■■□□ 2.25
LHX1-202ENST00000616237 CUL7Q14999 1698 aa29.09■■■□□ 2.25
LHX1-202ENST00000616237 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.04■■■□□ 2.24
LHX1-202ENST00000616237 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.03■■■□□ 2.24
LHX1-202ENST00000616237 SHROOM2Q13796 1616 aa29.01■■■□□ 2.24
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