RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615847.2

LINC01547-203, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1547, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC01547, Length 1,595 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547-203ENST00000615847 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.89■■■■■ 6.22
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LINC01547-203ENST00000615847 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.15■■■■■ 4.82
LINC01547-203ENST00000615847 NACADO15069 1562 aa45.07■■■■■ 4.81
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LINC01547-203ENST00000615847 SCRIBQ14160 1630 aa43.78■■■■■ 4.6
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LINC01547-203ENST00000615847 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.28■■■■■ 4.52
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LINC01547-203ENST00000615847 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.52■■■■■ 4.4
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LINC01547-203ENST00000615847 SMARCA2P51531 1590 aa41.56■■■■■ 4.24
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LINC01547-203ENST00000615847 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.4■■■■■ 4.22
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LINC01547-203ENST00000615847 NESP48681 1621 aa40.7■■■■■ 4.11
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LINC01547-203ENST00000615847 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.41■■■■■ 4.06
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LINC01547-203ENST00000615847 PRDM2Q13029 1718 aa39.79■■■■□ 3.96
LINC01547-203ENST00000615847 WDR62O43379 1518 aa39.72■■■■□ 3.95
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LINC01547-203ENST00000615847 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.71■■■■□ 3.79
LINC01547-203ENST00000615847 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.71■■■■□ 3.79
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LINC01547-203ENST00000615847 TOP2BQ02880 1626 aa38.61■■■■□ 3.77
LINC01547-203ENST00000615847 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.59■■■■□ 3.77
LINC01547-203ENST00000615847 WDR97A6NE52 1622 aa38.52■■■■□ 3.76
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LINC01547-203ENST00000615847 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.36■■■■□ 3.73
LINC01547-203ENST00000615847 GRIN2BQ13224 1484 aa38.35■■■■□ 3.73
LINC01547-203ENST00000615847 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.33■■■■□ 3.73
LINC01547-203ENST00000615847 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.32■■■■□ 3.72
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LINC01547-203ENST00000615847 CHD1O14646 1710 aa38.27■■■■□ 3.72
LINC01547-203ENST00000615847 PBRM1Q86U86 1689 aa38.26■■■■□ 3.72
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LINC01547-203ENST00000615847 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.9■■■■□ 3.66
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LINC01547-203ENST00000615847 CEP170Q5SW79 1584 aa37.69■■■■□ 3.62
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LINC01547-203ENST00000615847 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.37■■■■□ 3.57
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