RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613876.1

CCL23-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

TSL 3

Gene CCL23, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-202ENST00000613876 NISCHQ9Y2I1 1504 aa12.21□□□□□ -0.46
CCL23-202ENST00000613876 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa10.66□□□□□ -0.7
CCL23-202ENST00000613876 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CCL23-202ENST00000613876 ABCC9O60706 1549 aa10.16□□□□□ -0.78
CCL23-202ENST00000613876 DCAF8L2P0C7V8 631 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL23-202ENST00000613876 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa10.09□□□□□ -0.79
CCL23-202ENST00000613876 MYO15BQ96JP2 1530 aa10□□□□□ -0.81
CCL23-202ENST00000613876 NACADO15069 1562 aa9.96□□□□□ -0.82
CCL23-202ENST00000613876 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.91□□□□□ -0.82
CCL23-202ENST00000613876 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.88□□□□□ -0.83
CCL23-202ENST00000613876 SCRIBQ14160 1630 aa9.79□□□□□ -0.84
CCL23-202ENST00000613876 UNC13AQ9UPW8 1703 aa9.68□□□□□ -0.86
CCL23-202ENST00000613876 BICRAQ9NZM4 1560 aa9.6□□□□□ -0.87
CCL23-202ENST00000613876 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
CCL23-202ENST00000613876 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
CCL23-202ENST00000613876 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.5□□□□□ -0.89
CCL23-202ENST00000613876 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
CCL23-202ENST00000613876 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.43□□□□□ -0.9
CCL23-202ENST00000613876 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CCL23-202ENST00000613876 SMARCA4P51532 1647 aa9.39□□□□□ -0.91
CCL23-202ENST00000613876 WIZO95785 1651 aa9.35□□□□□ -0.91
CCL23-202ENST00000613876 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
CCL23-202ENST00000613876 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.28□□□□□ -0.92
CCL23-202ENST00000613876 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.27□□□□□ -0.93
CCL23-202ENST00000613876 SMARCA2P51531 1590 aa9.24□□□□□ -0.93
CCL23-202ENST00000613876 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
CCL23-202ENST00000613876 NCAPD3P42695 1498 aa9.21□□□□□ -0.94
CCL23-202ENST00000613876 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
CCL23-202ENST00000613876 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa9.19□□□□□ -0.94
CCL23-202ENST00000613876 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.17□□□□□ -0.94
CCL23-202ENST00000613876 HMGXB3Q12766 1538 aa9.16□□□□□ -0.94
CCL23-202ENST00000613876 CHIC1Q5VXU3 224 aa9.1□□□□□ -0.95
CCL23-202ENST00000613876 DNAJC5BQ9UF47 199 aa9.08□□□□□ -0.96
CCL23-202ENST00000613876 CFTRP13569 1480 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL23-202ENST00000613876 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.98□□□□□ -0.97
CCL23-202ENST00000613876 TRIM41Q8WV44 630 aa8.96□□□□□ -0.98
CCL23-202ENST00000613876 ABCC8Q09428 1581 aa8.93□□□□□ -0.98
CCL23-202ENST00000613876 NESP48681 1621 aa8.91□□□□□ -0.98
CCL23-202ENST00000613876 PRDM2Q13029 1718 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL23-202ENST00000613876 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.89□□□□□ -0.99
CCL23-202ENST00000613876 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP8.88□□□□□ -0.99
CCL23-202ENST00000613876 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL23-202ENST00000613876 SYNJ1O43426 1573 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL23-202ENST00000613876 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.83□□□□□ -1
CCL23-202ENST00000613876 CUX1P39880 1505 aa8.82□□□□□ -1
CCL23-202ENST00000613876 TOP2BQ02880 1626 aa8.81□□□□□ -1
CCL23-202ENST00000613876 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa8.8□□□□□ -1
CCL23-202ENST00000613876 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.79□□□□□ -1
CCL23-202ENST00000613876 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
CCL23-202ENST00000613876 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.78□□□□□ -1
CCL23-202ENST00000613876 SOGA1O94964 1423 aa8.76□□□□□ -1.01
CCL23-202ENST00000613876 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
CCL23-202ENST00000613876 DNMBPQ6XZF7 1577 aa8.75□□□□□ -1.01
CCL23-202ENST00000613876 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.75□□□□□ -1.01
CCL23-202ENST00000613876 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.75□□□□□ -1.01
CCL23-202ENST00000613876 TOPBP1Q92547 1522 aa8.75□□□□□ -1.01
CCL23-202ENST00000613876 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.73□□□□□ -1.01
CCL23-202ENST00000613876 EEA1Q15075 1411 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL23-202ENST00000613876 CSRNP3Q8WYN3 585 aa8.72□□□□□ -1.01
CCL23-202ENST00000613876 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.71□□□□□ -1.01
CCL23-202ENST00000613876 ERCC6Q03468 1493 aa8.7□□□□□ -1.02
CCL23-202ENST00000613876 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CCL23-202ENST00000613876 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa8.69□□□□□ -1.02
CCL23-202ENST00000613876 KIF27Q86VH2 1401 aa8.67□□□□□ -1.02
CCL23-202ENST00000613876 WDR62O43379 1518 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL23-202ENST00000613876 CUX2O14529 1486 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL23-202ENST00000613876 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.66□□□□□ -1.02
CCL23-202ENST00000613876 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa8.65□□□□□ -1.02
CCL23-202ENST00000613876 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
CCL23-202ENST00000613876 IGF1RP08069 1367 aa8.63□□□□□ -1.03
CCL23-202ENST00000613876 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CCL23-202ENST00000613876 WDR97A6NE52 1622 aa8.62□□□□□ -1.03
CCL23-202ENST00000613876 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CCL23-202ENST00000613876 IFT140Q96RY7 1462 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL23-202ENST00000613876 PRXQ9BXM0 1461 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL23-202ENST00000613876 KIF21BO75037 1637 aa8.6□□□□□ -1.03
CCL23-202ENST00000613876 UBTFP17480 764 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CCL23-202ENST00000613876 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa8.59□□□□□ -1.03
CCL23-202ENST00000613876 GOLGA3Q08378 1498 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL23-202ENST00000613876 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL23-202ENST00000613876 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL23-202ENST00000613876 TNIKQ9UKE5 1360 aa8.58□□□□□ -1.04
CCL23-202ENST00000613876 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.57□□□□□ -1.04
CCL23-202ENST00000613876 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
CCL23-202ENST00000613876 ERICH3Q5RHP9 1530 aa8.55□□□□□ -1.04
CCL23-202ENST00000613876 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CCL23-202ENST00000613876 CUL7Q14999 1698 aa8.53□□□□□ -1.04
CCL23-202ENST00000613876 GRIN2BQ13224 1484 aa8.52□□□□□ -1.05
CCL23-202ENST00000613876 PBRM1Q86U86 1689 aa8.51□□□□□ -1.05
CCL23-202ENST00000613876 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CCL23-202ENST00000613876 CEP162Q5TB80 1403 aa8.5□□□□□ -1.05
CCL23-202ENST00000613876 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.49□□□□□ -1.05
CCL23-202ENST00000613876 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CCL23-202ENST00000613876 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa8.46□□□□□ -1.05
CCL23-202ENST00000613876 ADAMTS12P58397 1594 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL23-202ENST00000613876 CLIP1P30622 1438 aa8.46□□□□□ -1.06
CCL23-202ENST00000613876 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CCL23-202ENST00000613876 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CCL23-202ENST00000613876 SYNJ2O15056 1496 aa8.42□□□□□ -1.06
CCL23-202ENST00000613876 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa8.41□□□□□ -1.06
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