RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613110.4

LYNX1-202, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, humanhuman

TSL 2

Gene LYNX1, Length 639 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1-202ENST00000613110 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.26■■■■■ 7.4
LYNX1-202ENST00000613110 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.84■■■■■ 6.37
LYNX1-202ENST00000613110 ABCC9O60706 1549 aa54.75■■■■■ 6.35
LYNX1-202ENST00000613110 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.16■■■■■ 5.94
LYNX1-202ENST00000613110 NACADO15069 1562 aa51.87■■■■■ 5.89
LYNX1-202ENST00000613110 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.54■■■■■ 5.84
LYNX1-202ENST00000613110 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.32■■■■■ 5.81
LYNX1-202ENST00000613110 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.28■■■■■ 5.8
LYNX1-202ENST00000613110 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.01■■■■■ 5.76
LYNX1-202ENST00000613110 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.88■■■■■ 5.74
LYNX1-202ENST00000613110 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.82■■■■■ 5.73
LYNX1-202ENST00000613110 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.68■■■■■ 5.7
LYNX1-202ENST00000613110 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.64■■■■■ 5.7
LYNX1-202ENST00000613110 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.06■■■■■ 5.6
LYNX1-202ENST00000613110 SCRIBQ14160 1630 aa49.96■■■■■ 5.59
LYNX1-202ENST00000613110 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.45■■■■■ 5.51
LYNX1-202ENST00000613110 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.41■■■■■ 5.5
LYNX1-202ENST00000613110 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.32■■■■■ 5.49
LYNX1-202ENST00000613110 NCAPD3P42695 1498 aa47.94■■■■■ 5.26
LYNX1-202ENST00000613110 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.79■■■■■ 5.24
LYNX1-202ENST00000613110 SMARCA4P51532 1647 aa47.72■■■■■ 5.23
LYNX1-202ENST00000613110 SMARCA2P51531 1590 aa47.62■■■■■ 5.21
LYNX1-202ENST00000613110 HMGXB3Q12766 1538 aa47.56■■■■■ 5.2
LYNX1-202ENST00000613110 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.52■■■■■ 5.2
LYNX1-202ENST00000613110 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.32■■■■■ 5.17
LYNX1-202ENST00000613110 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
LYNX1-202ENST00000613110 ERCC6Q03468 1493 aa47.23■■■■■ 5.15
LYNX1-202ENST00000613110 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.2■■■■■ 5.15
LYNX1-202ENST00000613110 CUX2O14529 1486 aa47.17■■■■■ 5.14
LYNX1-202ENST00000613110 NESP48681 1621 aa47.08■■■■■ 5.13
LYNX1-202ENST00000613110 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.02■■■■■ 5.12
LYNX1-202ENST00000613110 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.77■■■■■ 5.08
LYNX1-202ENST00000613110 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
LYNX1-202ENST00000613110 WIZO95785 1651 aa46.56■■■■■ 5.04
LYNX1-202ENST00000613110 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.52■■■■■ 5.04
LYNX1-202ENST00000613110 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.47■■■■■ 5.03
LYNX1-202ENST00000613110 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.39■■■■■ 5.02
LYNX1-202ENST00000613110 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.29■■■■■ 5
LYNX1-202ENST00000613110 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.11■■■■■ 4.97
LYNX1-202ENST00000613110 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
LYNX1-202ENST00000613110 WDR62O43379 1518 aa46■■■■■ 4.95
LYNX1-202ENST00000613110 CFTRP13569 1480 aa45.98■■■■■ 4.95
LYNX1-202ENST00000613110 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.93■■■■■ 4.94
LYNX1-202ENST00000613110 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.91■■■■■ 4.94
LYNX1-202ENST00000613110 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.54■■■■■ 4.88
LYNX1-202ENST00000613110 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.54■■■■■ 4.88
LYNX1-202ENST00000613110 PRDM2Q13029 1718 aa45.34■■■■■ 4.85
LYNX1-202ENST00000613110 TOPBP1Q92547 1522 aa45.06■■■■■ 4.8
LYNX1-202ENST00000613110 IFT140Q96RY7 1462 aa45.04■■■■■ 4.8
LYNX1-202ENST00000613110 OSCARQ8IYS5 282 aa45.03■■■■■ 4.8
LYNX1-202ENST00000613110 ABCC8Q09428 1581 aa44.96■■■■■ 4.79
LYNX1-202ENST00000613110 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.95■■■■■ 4.79
LYNX1-202ENST00000613110 TRIM41Q8WV44 630 aa44.92■■■■■ 4.78
LYNX1-202ENST00000613110 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.88■■■■■ 4.78
LYNX1-202ENST00000613110 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.66■■■■■ 4.74
LYNX1-202ENST00000613110 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
LYNX1-202ENST00000613110 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.62■■■■■ 4.73
LYNX1-202ENST00000613110 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.55■■■■■ 4.72
LYNX1-202ENST00000613110 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.44■■■■■ 4.7
LYNX1-202ENST00000613110 SOGA1O94964 1423 aa44.41■■■■■ 4.7
LYNX1-202ENST00000613110 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.38■■■■■ 4.69
LYNX1-202ENST00000613110 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.38■■■■■ 4.69
LYNX1-202ENST00000613110 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.38■■■■■ 4.69
LYNX1-202ENST00000613110 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.34■■■■■ 4.69
LYNX1-202ENST00000613110 CUX1P39880 1505 aa44.33■■■■■ 4.69
LYNX1-202ENST00000613110 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
LYNX1-202ENST00000613110 ARHGEF11O15085 1522 aa44.3■■■■■ 4.68
LYNX1-202ENST00000613110 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.24■■■■■ 4.67
LYNX1-202ENST00000613110 CHD1O14646 1710 aa44.23■■■■■ 4.67
LYNX1-202ENST00000613110 WDR97A6NE52 1622 aa44.2■■■■■ 4.67
LYNX1-202ENST00000613110 FBLN2P98095 1184 aa44.16■■■■■ 4.66
LYNX1-202ENST00000613110 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.09■■■■■ 4.65
LYNX1-202ENST00000613110 GRIN2BQ13224 1484 aa44.01■■■■■ 4.64
LYNX1-202ENST00000613110 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
LYNX1-202ENST00000613110 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.94■■■■■ 4.62
LYNX1-202ENST00000613110 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
LYNX1-202ENST00000613110 ARAP1Q96P48 1450 aa43.89■■■■■ 4.62
LYNX1-202ENST00000613110 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.88■■■■■ 4.61
LYNX1-202ENST00000613110 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.86■■■■■ 4.61
LYNX1-202ENST00000613110 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.85■■■■■ 4.61
LYNX1-202ENST00000613110 SYNJ2O15056 1496 aa43.85■■■■■ 4.61
LYNX1-202ENST00000613110 SYNJ1O43426 1573 aa43.79■■■■■ 4.6
LYNX1-202ENST00000613110 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.76■■■■■ 4.6
LYNX1-202ENST00000613110 PBRM1Q86U86 1689 aa43.73■■■■■ 4.59
LYNX1-202ENST00000613110 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.7■■■■■ 4.59
LYNX1-202ENST00000613110 TOP2BQ02880 1626 aa43.63■■■■■ 4.58
LYNX1-202ENST00000613110 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.61■■■■■ 4.57
LYNX1-202ENST00000613110 GRIN2AQ12879 1464 aa43.45■■■■■ 4.55
LYNX1-202ENST00000613110 ADAMTS12P58397 1594 aa43.41■■■■■ 4.54
LYNX1-202ENST00000613110 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.37■■■■■ 4.53
LYNX1-202ENST00000613110 NUP160Q12769 1436 aa43.34■■■■■ 4.53
LYNX1-202ENST00000613110 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.33■■■■■ 4.53
LYNX1-202ENST00000613110 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.31■■■■■ 4.52
LYNX1-202ENST00000613110 CEP170Q5SW79 1584 aa43.27■■■■■ 4.52
LYNX1-202ENST00000613110 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.16■■■■■ 4.5
LYNX1-202ENST00000613110 SHROOM2Q13796 1616 aa43.08■■■■■ 4.49
LYNX1-202ENST00000613110 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
LYNX1-202ENST00000613110 JPH4Q96JJ6 628 aa42.85■■■■■ 4.45
LYNX1-202ENST00000613110 IGF1RP08069 1367 aa42.82■■■■■ 4.45
LYNX1-202ENST00000613110 KIF27Q86VH2 1401 aa42.8■■■■■ 4.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms