RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612509.4

SEMA3B-211, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,061 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SEMA3B-211ENST00000612509 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.02■■■■□ 3.04
SEMA3B-211ENST00000612509 HMGXB3Q12766 1538 aa34.01■■■■□ 3.04
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SEMA3B-211ENST00000612509 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.98■■■□□ 2.87
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SEMA3B-211ENST00000612509 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.74■■■□□ 2.83
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SEMA3B-211ENST00000612509 ABCC8Q09428 1581 aa32.19■■■□□ 2.74
SEMA3B-211ENST00000612509 IFT140Q96RY7 1462 aa32.03■■■□□ 2.72
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SEMA3B-211ENST00000612509 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.79■■■□□ 2.68
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SEMA3B-211ENST00000612509 SYNJ1O43426 1573 aa31.7■■■□□ 2.67
SEMA3B-211ENST00000612509 WDR97A6NE52 1622 aa31.7■■■□□ 2.66
SEMA3B-211ENST00000612509 TOP2BQ02880 1626 aa31.7■■■□□ 2.66
SEMA3B-211ENST00000612509 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.66■■■□□ 2.663e-9■■■■□ 26.6
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SEMA3B-211ENST00000612509 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.56■■■□□ 2.64
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SEMA3B-211ENST00000612509 PBRM1Q86U86 1689 aa31.47■■■□□ 2.63
SEMA3B-211ENST00000612509 CHD1O14646 1710 aa31.44■■■□□ 2.62
SEMA3B-211ENST00000612509 GRIN2BQ13224 1484 aa31.44■■■□□ 2.62
SEMA3B-211ENST00000612509 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.44■■■□□ 2.62
SEMA3B-211ENST00000612509 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.43■■■□□ 2.62
SEMA3B-211ENST00000612509 OSCARQ8IYS5 282 aa31.4■■■□□ 2.62
SEMA3B-211ENST00000612509 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.39■■■□□ 2.62
SEMA3B-211ENST00000612509 SYNJ2O15056 1496 aa31.26■■■□□ 2.59
SEMA3B-211ENST00000612509 FBLN2P98095 1184 aa31.23■■■□□ 2.59
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SEMA3B-211ENST00000612509 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.19■■■□□ 2.58
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SEMA3B-211ENST00000612509 NUP160Q12769 1436 aa30.92■■■□□ 2.54
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SEMA3B-211ENST00000612509 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.61■■■□□ 2.49
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