RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612430.3

PCBP1-AS1-267, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 374 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.48■■■■□ 3.27
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 NACADO15069 1562 aa30.34■■■□□ 2.45
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.28■■■□□ 2.44
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.71■■■□□ 2.35
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.22■■■□□ 2.27
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.2■■■□□ 2.26
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 SCRIBQ14160 1630 aa29.2■■■□□ 2.26
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 SMARCA2P51531 1590 aa27.8■■■□□ 2.04
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 SMARCA4P51532 1647 aa27.78■■■□□ 2.04
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 HMGXB3Q12766 1538 aa27.76■■■□□ 2.03
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 NESP48681 1621 aa27.69■■■□□ 2.02
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.14■■□□□ 1.94
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 WDR62O43379 1518 aa27.01■■□□□ 1.91
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.93■■□□□ 1.9
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 CFTRP13569 1480 aa26.74■■□□□ 1.87
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 OSCARQ8IYS5 282 aa26.73■■□□□ 1.87
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.4■■□□□ 1.82
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.4■■□□□ 1.82
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 IFT140Q96RY7 1462 aa26.38■■□□□ 1.81
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.16■■□□□ 1.78
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 CHD1O14646 1710 aa26.14■■□□□ 1.77
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 FBLN2P98095 1184 aa26.12■■□□□ 1.77
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 ARAP1Q96P48 1450 aa25.96■■□□□ 1.75
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.93■■□□□ 1.74
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 SOGA1O94964 1423 aa25.91■■□□□ 1.74
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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PCBP1-AS1-267ENST00000612430 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.81■■□□□ 1.72
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 WDR97A6NE52 1622 aa25.79■■□□□ 1.72
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 SYNJ1O43426 1573 aa25.78■■□□□ 1.72
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.75■■□□□ 1.71
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 GRIN2BQ13224 1484 aa25.72■■□□□ 1.71
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 CUX1P39880 1505 aa25.71■■□□□ 1.71
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 SYNJ2O15056 1496 aa25.66■■□□□ 1.7
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 PBRM1Q86U86 1689 aa25.63■■□□□ 1.69
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.59■■□□□ 1.69
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.47■■□□□ 1.67
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.47■■□□□ 1.67
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 GRIN2AQ12879 1464 aa25.38■■□□□ 1.65
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.35■■□□□ 1.65
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 ADAMTS12P58397 1594 aa25.31■■□□□ 1.64
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 CEP170Q5SW79 1584 aa25.3■■□□□ 1.64
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 NUP160Q12769 1436 aa25.26■■□□□ 1.63
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.23■■□□□ 1.63
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.23■■□□□ 1.63
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 TOP2BQ02880 1626 aa25.22■■□□□ 1.63
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 SHROOM2Q13796 1616 aa25.2■■□□□ 1.62
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.16■■□□□ 1.62
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.1■■□□□ 1.61
PCBP1-AS1-267ENST00000612430 JPH4Q96JJ6 628 aa25.07■■□□□ 1.6
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