RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612370.4

COPZ2-209, Transcript of coatomer protein complex subunit zeta 2, humanhuman

TSL 3

Gene COPZ2, Length 528 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2-209ENST00000612370 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.31■■■■■ 8.37
COPZ2-209ENST00000612370 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.19■■■■■ 7.23
COPZ2-209ENST00000612370 ABCC9O60706 1549 aa59.56■■■■■ 7.13
COPZ2-209ENST00000612370 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.01■■■■■ 6.72
COPZ2-209ENST00000612370 NACADO15069 1562 aa56.75■■■■■ 6.67
COPZ2-209ENST00000612370 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.63■■■■■ 6.66
COPZ2-209ENST00000612370 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.14■■■■■ 6.58
COPZ2-209ENST00000612370 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.91■■■■■ 6.54
COPZ2-209ENST00000612370 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.68■■■■■ 6.5
COPZ2-209ENST00000612370 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.65■■■■■ 6.5
COPZ2-209ENST00000612370 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.53■■■■■ 6.48
COPZ2-209ENST00000612370 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.23■■■■■ 6.43
COPZ2-209ENST00000612370 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.23■■■■■ 6.43
COPZ2-209ENST00000612370 SCRIBQ14160 1630 aa54.86■■■■■ 6.37
COPZ2-209ENST00000612370 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.64■■■■■ 6.34
COPZ2-209ENST00000612370 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.87■■■■■ 6.21
COPZ2-209ENST00000612370 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.84■■■■■ 6.21
COPZ2-209ENST00000612370 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.6■■■■■ 6.17
COPZ2-209ENST00000612370 SMARCA4P51532 1647 aa52.4■■■■■ 5.98
COPZ2-209ENST00000612370 NCAPD3P42695 1498 aa52.34■■■■■ 5.97
COPZ2-209ENST00000612370 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.26■■■■■ 5.96
COPZ2-209ENST00000612370 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.25■■■■■ 5.95
COPZ2-209ENST00000612370 SMARCA2P51531 1590 aa52.21■■■■■ 5.95
COPZ2-209ENST00000612370 HMGXB3Q12766 1538 aa52.04■■■■■ 5.92
COPZ2-209ENST00000612370 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.87■■■■■ 5.89
COPZ2-209ENST00000612370 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.85■■■■■ 5.89
COPZ2-209ENST00000612370 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.85■■■■■ 5.89
COPZ2-209ENST00000612370 ERCC6Q03468 1493 aa51.44■■■■■ 5.83
COPZ2-209ENST00000612370 NESP48681 1621 aa51.31■■■■■ 5.8
COPZ2-209ENST00000612370 WIZO95785 1651 aa51.29■■■■■ 5.8
COPZ2-209ENST00000612370 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.11■■■■■ 5.77
COPZ2-209ENST00000612370 CUX2O14529 1486 aa51.1■■■■■ 5.77
COPZ2-209ENST00000612370 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP51■■■■■ 5.75
COPZ2-209ENST00000612370 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.81■■■■■ 5.72
COPZ2-209ENST00000612370 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.8■■■■■ 5.72
COPZ2-209ENST00000612370 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.72■■■■■ 5.71
COPZ2-209ENST00000612370 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.7■■■■■ 5.71
COPZ2-209ENST00000612370 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.68■■■■■ 5.7
COPZ2-209ENST00000612370 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.34■■■■■ 5.65
COPZ2-209ENST00000612370 CFTRP13569 1480 aa50.33■■■■■ 5.65
COPZ2-209ENST00000612370 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.32■■■■■ 5.65
COPZ2-209ENST00000612370 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.25■■■■■ 5.63
COPZ2-209ENST00000612370 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.23■■■■■ 5.63
COPZ2-209ENST00000612370 WDR62O43379 1518 aa50.15■■■■■ 5.62
COPZ2-209ENST00000612370 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.1■■■■■ 5.61
COPZ2-209ENST00000612370 PRDM2Q13029 1718 aa49.96■■■■■ 5.59
COPZ2-209ENST00000612370 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.74■■■■■ 5.55
COPZ2-209ENST00000612370 TOPBP1Q92547 1522 aa49.34■■■■■ 5.49
COPZ2-209ENST00000612370 ABCC8Q09428 1581 aa49.33■■■■■ 5.49
COPZ2-209ENST00000612370 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
COPZ2-209ENST00000612370 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.24■■■■■ 5.47
COPZ2-209ENST00000612370 IFT140Q96RY7 1462 aa49.22■■■■■ 5.47
COPZ2-209ENST00000612370 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.02■■■■■ 5.44
COPZ2-209ENST00000612370 OSCARQ8IYS5 282 aa48.9■■■■■ 5.42
COPZ2-209ENST00000612370 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.86■■■■■ 5.41
COPZ2-209ENST00000612370 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.84■■■■■ 5.41
COPZ2-209ENST00000612370 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
COPZ2-209ENST00000612370 CUX1P39880 1505 aa48.69■■■■■ 5.39
COPZ2-209ENST00000612370 SOGA1O94964 1423 aa48.69■■■■■ 5.39
COPZ2-209ENST00000612370 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.68■■■■■ 5.38
COPZ2-209ENST00000612370 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.67■■■■■ 5.38
COPZ2-209ENST00000612370 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.66■■■■■ 5.38
COPZ2-209ENST00000612370 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.49■■■■■ 5.35
COPZ2-209ENST00000612370 WDR97A6NE52 1622 aa48.45■■■■■ 5.35
COPZ2-209ENST00000612370 TRIM41Q8WV44 630 aa48.45■■■■■ 5.35
COPZ2-209ENST00000612370 CHD1O14646 1710 aa48.37■■■■■ 5.33
COPZ2-209ENST00000612370 FBLN2P98095 1184 aa48.32■■■■■ 5.33
COPZ2-209ENST00000612370 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.22■■■■■ 5.31
COPZ2-209ENST00000612370 GRIN2BQ13224 1484 aa48.2■■■■■ 5.31
COPZ2-209ENST00000612370 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.16■■■■■ 5.3
COPZ2-209ENST00000612370 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.16■■■■■ 5.3
COPZ2-209ENST00000612370 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.16■■■■■ 5.3
COPZ2-209ENST00000612370 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP48.15■■■■■ 5.3
COPZ2-209ENST00000612370 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.15■■■■■ 5.3
COPZ2-209ENST00000612370 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.14■■■■■ 5.3
COPZ2-209ENST00000612370 TOP2BQ02880 1626 aa48.11■■■■■ 5.29
COPZ2-209ENST00000612370 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa48.11■■■■■ 5.29
COPZ2-209ENST00000612370 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.1■■■■■ 5.29
COPZ2-209ENST00000612370 PBRM1Q86U86 1689 aa48.07■■■■■ 5.29
COPZ2-209ENST00000612370 ARHGEF11O15085 1522 aa48.07■■■■■ 5.29
COPZ2-209ENST00000612370 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.06■■■■■ 5.28
COPZ2-209ENST00000612370 SYNJ1O43426 1573 aa48.05■■■■■ 5.28
COPZ2-209ENST00000612370 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.01■■■■■ 5.28
COPZ2-209ENST00000612370 SYNJ2O15056 1496 aa47.97■■■■■ 5.27
COPZ2-209ENST00000612370 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.78■■■■■ 5.24
COPZ2-209ENST00000612370 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.7■■■■■ 5.23
COPZ2-209ENST00000612370 ADAMTS12P58397 1594 aa47.62■■■■■ 5.21
COPZ2-209ENST00000612370 ARAP1Q96P48 1450 aa47.61■■■■■ 5.21
COPZ2-209ENST00000612370 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.57■■■■■ 5.21
COPZ2-209ENST00000612370 GRIN2AQ12879 1464 aa47.56■■■■■ 5.2
COPZ2-209ENST00000612370 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.52■■■■■ 5.2
COPZ2-209ENST00000612370 NUP160Q12769 1436 aa47.35■■■■■ 5.17
COPZ2-209ENST00000612370 CEP170Q5SW79 1584 aa47.35■■■■■ 5.17
COPZ2-209ENST00000612370 KIF27Q86VH2 1401 aa47.22■■■■■ 5.15
COPZ2-209ENST00000612370 SHROOM2Q13796 1616 aa47.09■■■■■ 5.13
COPZ2-209ENST00000612370 IGF1RP08069 1367 aa47.07■■■■■ 5.13
COPZ2-209ENST00000612370 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.06■■■■■ 5.12
COPZ2-209ENST00000612370 CUL7Q14999 1698 aa47.03■■■■■ 5.12
COPZ2-209ENST00000612370 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.03■■■■■ 5.12
COPZ2-209ENST00000612370 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.93■■■■■ 5.1
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