RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612104.1

5S_rRNA.20-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 118 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.68■□□□□ 0.58
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.55■□□□□ 0.24
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ABCC9O60706 1549 aa16.09■□□□□ 0.17
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.45■□□□□ 0.06
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 NACADO15069 1562 aa15.42■□□□□ 0.06
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa15.41■□□□□ 0.06
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.4■□□□□ 0.06
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.34■□□□□ 0.05
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.31■□□□□ 0.04
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SCRIBQ14160 1630 aa15.19■□□□□ 0.02
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.07■□□□□ 0
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP15.03■□□□□ -0
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.96□□□□□ -0.01
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.82□□□□□ -0.04
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.6□□□□□ -0.07
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa14.57□□□□□ -0.08
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SMARCA4P51532 1647 aa14.51□□□□□ -0.09
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.47□□□□□ -0.09
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 WIZO95785 1651 aa14.38□□□□□ -0.11
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.31□□□□□ -0.12
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PEG3Q9GZU2 1588 aa14.3□□□□□ -0.12
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SMARCA2P51531 1590 aa14.26□□□□□ -0.13
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 HMGXB3Q12766 1538 aa14.21□□□□□ -0.13
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 NCAPD3P42695 1498 aa14.21□□□□□ -0.13
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CCDC88BA6NC98 1476 aa13.97□□□□□ -0.17
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 NESP48681 1621 aa13.96□□□□□ -0.17
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PRDM2Q13029 1718 aa13.88□□□□□ -0.19
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa13.87□□□□□ -0.19
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa13.84□□□□□ -0.19
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ERCC6Q03468 1493 aa13.8□□□□□ -0.2
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CADPSQ9ULU8 1353 aa13.8□□□□□ -0.2
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CFTRP13569 1480 aa13.8□□□□□ -0.2
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 FANCD2Q9BXW9 1451 aa13.7□□□□□ -0.22
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PDS5BQ9NTI5 1447 aa13.68□□□□□ -0.22
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CUX2O14529 1486 aa13.65□□□□□ -0.22
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CEP164Q9UPV0 1460 aa13.65□□□□□ -0.22
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ABCC8Q09428 1581 aa13.62□□□□□ -0.23
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MRC2Q9UBG0 1479 aa13.6□□□□□ -0.23
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 WDR62O43379 1518 aa13.58□□□□□ -0.24
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CUX1P39880 1505 aa13.55□□□□□ -0.24
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SYNJ1O43426 1573 aa13.54□□□□□ -0.24
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TOPBP1Q92547 1522 aa13.54□□□□□ -0.24
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 DNMBPQ6XZF7 1577 aa13.54□□□□□ -0.24
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa13.5□□□□□ -0.25
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TOP2BQ02880 1626 aa13.46□□□□□ -0.25
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 FGD5Q6ZNL6 1462 aa13.44□□□□□ -0.26
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 WDR97A6NE52 1622 aa13.42□□□□□ -0.26
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa13.41□□□□□ -0.26
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 IFT140Q96RY7 1462 aa13.32□□□□□ -0.28
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SOGA1O94964 1423 aa13.31□□□□□ -0.28
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa13.3□□□□□ -0.28
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PBRM1Q86U86 1689 aa13.3□□□□□ -0.28
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa13.28□□□□□ -0.28
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP13.27□□□□□ -0.29
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.26□□□□□ -0.29
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.26□□□□□ -0.29
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.23□□□□□ -0.29
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TRIM41Q8WV44 630 aa13.21□□□□□ -0.29
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CHD1O14646 1710 aa13.2□□□□□ -0.3
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 GAPVD1Q14C86 1478 aa13.18□□□□□ -0.3
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.16□□□□□ -0.3
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ADAMTS12P58397 1594 aa13.15□□□□□ -0.3
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 GRIN2BQ13224 1484 aa13.14□□□□□ -0.31
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ERICH3Q5RHP9 1530 aa13.11□□□□□ -0.31
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KIF27Q86VH2 1401 aa13.11□□□□□ -0.31
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CUL7Q14999 1698 aa13.08□□□□□ -0.32
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 IGF1RP08069 1367 aa13.06□□□□□ -0.32
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 OSCARQ8IYS5 282 aa13.04□□□□□ -0.32
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SYNJ2O15056 1496 aa13.04□□□□□ -0.32
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 FBLN2P98095 1184 aa13.03□□□□□ -0.32
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CEP170Q5SW79 1584 aa13.02□□□□□ -0.33
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 FHAD1B1AJZ9 1412 aa13.01□□□□□ -0.33
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 GRIN2AQ12879 1464 aa13.01□□□□□ -0.33
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.98□□□□□ -0.33
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.98□□□□□ -0.33
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.98□□□□□ -0.33
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.97□□□□□ -0.33
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PRXQ9BXM0 1461 aa12.97□□□□□ -0.33
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.96□□□□□ -0.33
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa12.96□□□□□ -0.34
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.96□□□□□ -0.34
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 EEA1Q15075 1411 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms