RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611464.1

SAP25-202, Transcript of Sin3A associated protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SAP25, Length 668 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP25-202ENST00000611464 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.99■■■■□ 3.03
SAP25-202ENST00000611464 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.4■■■□□ 2.46
SAP25-202ENST00000611464 ABCC9O60706 1549 aa29.98■■■□□ 2.39
SAP25-202ENST00000611464 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.71■■■□□ 2.19
SAP25-202ENST00000611464 NACADO15069 1562 aa28.58■■■□□ 2.17
SAP25-202ENST00000611464 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.39■■■□□ 2.14
SAP25-202ENST00000611464 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.3■■■□□ 2.12
SAP25-202ENST00000611464 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SAP25-202ENST00000611464 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.16■■■□□ 2.1
SAP25-202ENST00000611464 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.1■■■□□ 2.09
SAP25-202ENST00000611464 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.9■■■□□ 2.06
SAP25-202ENST00000611464 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.9■■■□□ 2.06
SAP25-202ENST00000611464 SCRIBQ14160 1630 aa27.75■■■□□ 2.03
SAP25-202ENST00000611464 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.7■■■□□ 2.02
SAP25-202ENST00000611464 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.51■■■□□ 2
SAP25-202ENST00000611464 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
SAP25-202ENST00000611464 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.12■■□□□ 1.93
SAP25-202ENST00000611464 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.94■■□□□ 1.9
SAP25-202ENST00000611464 SMARCA4P51532 1647 aa26.49■■□□□ 1.83
SAP25-202ENST00000611464 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
SAP25-202ENST00000611464 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.36■■□□□ 1.81
SAP25-202ENST00000611464 NCAPD3P42695 1498 aa26.35■■□□□ 1.81
SAP25-202ENST00000611464 SMARCA2P51531 1590 aa26.31■■□□□ 1.8
SAP25-202ENST00000611464 HMGXB3Q12766 1538 aa26.26■■□□□ 1.79
SAP25-202ENST00000611464 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.23■■□□□ 1.79
SAP25-202ENST00000611464 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.2■■□□□ 1.79
SAP25-202ENST00000611464 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SAP25-202ENST00000611464 WIZO95785 1651 aa25.96■■□□□ 1.75
SAP25-202ENST00000611464 NESP48681 1621 aa25.88■■□□□ 1.73
SAP25-202ENST00000611464 ERCC6Q03468 1493 aa25.84■■□□□ 1.73
SAP25-202ENST00000611464 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SAP25-202ENST00000611464 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.74■■□□□ 1.71
SAP25-202ENST00000611464 CUX2O14529 1486 aa25.66■■□□□ 1.7
SAP25-202ENST00000611464 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SAP25-202ENST00000611464 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.62■■□□□ 1.69
SAP25-202ENST00000611464 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
SAP25-202ENST00000611464 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.55■■□□□ 1.68
SAP25-202ENST00000611464 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.51■■□□□ 1.67
SAP25-202ENST00000611464 CFTRP13569 1480 aa25.38■■□□□ 1.65
SAP25-202ENST00000611464 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.34■■□□□ 1.65
SAP25-202ENST00000611464 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.32■■□□□ 1.64
SAP25-202ENST00000611464 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.31■■□□□ 1.64
SAP25-202ENST00000611464 WDR62O43379 1518 aa25.3■■□□□ 1.64
SAP25-202ENST00000611464 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.29■■□□□ 1.64
SAP25-202ENST00000611464 PRDM2Q13029 1718 aa25.29■■□□□ 1.64
SAP25-202ENST00000611464 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SAP25-202ENST00000611464 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.1■■□□□ 1.61
SAP25-202ENST00000611464 TOPBP1Q92547 1522 aa24.89■■□□□ 1.57
SAP25-202ENST00000611464 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.86■■□□□ 1.57
SAP25-202ENST00000611464 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SAP25-202ENST00000611464 ABCC8Q09428 1581 aa24.79■■□□□ 1.56
SAP25-202ENST00000611464 IFT140Q96RY7 1462 aa24.77■■□□□ 1.56
SAP25-202ENST00000611464 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SAP25-202ENST00000611464 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SAP25-202ENST00000611464 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
SAP25-202ENST00000611464 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SAP25-202ENST00000611464 CUX1P39880 1505 aa24.63■■□□□ 1.53
SAP25-202ENST00000611464 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.58■■□□□ 1.52
SAP25-202ENST00000611464 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.56■■□□□ 1.52
SAP25-202ENST00000611464 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
SAP25-202ENST00000611464 SOGA1O94964 1423 aa24.49■■□□□ 1.51
SAP25-202ENST00000611464 WDR97A6NE52 1622 aa24.47■■□□□ 1.51
SAP25-202ENST00000611464 CHD1O14646 1710 aa24.43■■□□□ 1.5
SAP25-202ENST00000611464 OSCARQ8IYS5 282 aa24.42■■□□□ 1.5
SAP25-202ENST00000611464 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
SAP25-202ENST00000611464 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.36■■□□□ 1.49
SAP25-202ENST00000611464 SYNJ1O43426 1573 aa24.36■■□□□ 1.49
SAP25-202ENST00000611464 TOP2BQ02880 1626 aa24.34■■□□□ 1.49
SAP25-202ENST00000611464 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.33■■□□□ 1.49
SAP25-202ENST00000611464 PBRM1Q86U86 1689 aa24.31■■□□□ 1.48
SAP25-202ENST00000611464 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
SAP25-202ENST00000611464 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.3■■□□□ 1.48
SAP25-202ENST00000611464 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.3■■□□□ 1.48
SAP25-202ENST00000611464 GRIN2BQ13224 1484 aa24.27■■□□□ 1.48
SAP25-202ENST00000611464 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
SAP25-202ENST00000611464 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
SAP25-202ENST00000611464 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.25■■□□□ 1.47
SAP25-202ENST00000611464 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SAP25-202ENST00000611464 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.23■■□□□ 1.47
SAP25-202ENST00000611464 FBLN2P98095 1184 aa24.2■■□□□ 1.46
SAP25-202ENST00000611464 TRIM41Q8WV44 630 aa24.2■■□□□ 1.46
SAP25-202ENST00000611464 ARHGEF11O15085 1522 aa24.19■■□□□ 1.46
SAP25-202ENST00000611464 SYNJ2O15056 1496 aa24.16■■□□□ 1.46
SAP25-202ENST00000611464 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.12■■□□□ 1.45
SAP25-202ENST00000611464 ADAMTS12P58397 1594 aa24.1■■□□□ 1.45
SAP25-202ENST00000611464 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SAP25-202ENST00000611464 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24■■□□□ 1.43
SAP25-202ENST00000611464 GRIN2AQ12879 1464 aa23.99■■□□□ 1.43
SAP25-202ENST00000611464 ARAP1Q96P48 1450 aa23.99■■□□□ 1.43
SAP25-202ENST00000611464 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.93■■□□□ 1.42
SAP25-202ENST00000611464 CEP170Q5SW79 1584 aa23.93■■□□□ 1.42
SAP25-202ENST00000611464 NUP160Q12769 1436 aa23.88■■□□□ 1.41
SAP25-202ENST00000611464 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.86■■□□□ 1.41
SAP25-202ENST00000611464 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.79■■□□□ 1.4
SAP25-202ENST00000611464 KIF27Q86VH2 1401 aa23.79■■□□□ 1.4
SAP25-202ENST00000611464 SHROOM2Q13796 1616 aa23.79■■□□□ 1.4
SAP25-202ENST00000611464 CUL7Q14999 1698 aa23.77■■□□□ 1.4
SAP25-202ENST00000611464 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.76■■□□□ 1.39
SAP25-202ENST00000611464 IGF1RP08069 1367 aa23.71■■□□□ 1.39
SAP25-202ENST00000611464 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.5 ms