RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609706.1

ANKRD54-212, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

Gene ANKRD54, Length 1,140 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-212ENST00000609706 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.59■■■■□ 3.93
ANKRD54-212ENST00000609706 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.46■■■■□ 3.27
ANKRD54-212ENST00000609706 ABCC9O60706 1549 aa35.11■■■■□ 3.21
ANKRD54-212ENST00000609706 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.57■■■□□ 2.96
ANKRD54-212ENST00000609706 NACADO15069 1562 aa33.41■■■□□ 2.94
ANKRD54-212ENST00000609706 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.1■■■□□ 2.89
ANKRD54-212ENST00000609706 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.07■■■□□ 2.88
ANKRD54-212ENST00000609706 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.93■■■□□ 2.86
ANKRD54-212ENST00000609706 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.82■■■□□ 2.85
ANKRD54-212ENST00000609706 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.75■■■□□ 2.83
ANKRD54-212ENST00000609706 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.65■■■□□ 2.82
ANKRD54-212ENST00000609706 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.6■■■□□ 2.81
ANKRD54-212ENST00000609706 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.59■■■□□ 2.81
ANKRD54-212ENST00000609706 SCRIBQ14160 1630 aa32.31■■■□□ 2.76
ANKRD54-212ENST00000609706 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.23■■■□□ 2.75
ANKRD54-212ENST00000609706 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
ANKRD54-212ENST00000609706 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.75■■■□□ 2.67
ANKRD54-212ENST00000609706 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.6■■■□□ 2.65
ANKRD54-212ENST00000609706 SMARCA4P51532 1647 aa30.85■■■□□ 2.53
ANKRD54-212ENST00000609706 NCAPD3P42695 1498 aa30.81■■■□□ 2.52
ANKRD54-212ENST00000609706 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.78■■■□□ 2.52
ANKRD54-212ENST00000609706 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
ANKRD54-212ENST00000609706 SMARCA2P51531 1590 aa30.71■■■□□ 2.51
ANKRD54-212ENST00000609706 HMGXB3Q12766 1538 aa30.68■■■□□ 2.5
ANKRD54-212ENST00000609706 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.57■■■□□ 2.48
ANKRD54-212ENST00000609706 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.51■■■□□ 2.47
ANKRD54-212ENST00000609706 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
ANKRD54-212ENST00000609706 ERCC6Q03468 1493 aa30.29■■■□□ 2.44
ANKRD54-212ENST00000609706 NESP48681 1621 aa30.25■■■□□ 2.43
ANKRD54-212ENST00000609706 CUX2O14529 1486 aa30.17■■■□□ 2.42
ANKRD54-212ENST00000609706 WIZO95785 1651 aa30.15■■■□□ 2.42
ANKRD54-212ENST00000609706 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.1■■■□□ 2.41
ANKRD54-212ENST00000609706 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ANKRD54-212ENST00000609706 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
ANKRD54-212ENST00000609706 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.9■■■□□ 2.38
ANKRD54-212ENST00000609706 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD54-212ENST00000609706 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.87■■■□□ 2.37
ANKRD54-212ENST00000609706 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
ANKRD54-212ENST00000609706 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.7■■■□□ 2.35
ANKRD54-212ENST00000609706 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.65■■■□□ 2.34
ANKRD54-212ENST00000609706 CFTRP13569 1480 aa29.62■■■□□ 2.33
ANKRD54-212ENST00000609706 WDR62O43379 1518 aa29.6■■■□□ 2.33
ANKRD54-212ENST00000609706 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.59■■■□□ 2.33
ANKRD54-212ENST00000609706 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.57■■■□□ 2.32
ANKRD54-212ENST00000609706 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.42■■■□□ 2.3
ANKRD54-212ENST00000609706 PRDM2Q13029 1718 aa29.4■■■□□ 2.3
ANKRD54-212ENST00000609706 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
ANKRD54-212ENST00000609706 TOPBP1Q92547 1522 aa29.05■■■□□ 2.24
ANKRD54-212ENST00000609706 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.99■■■□□ 2.23
ANKRD54-212ENST00000609706 IFT140Q96RY7 1462 aa28.98■■■□□ 2.23
ANKRD54-212ENST00000609706 ABCC8Q09428 1581 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD54-212ENST00000609706 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
ANKRD54-212ENST00000609706 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
ANKRD54-212ENST00000609706 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
ANKRD54-212ENST00000609706 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
ANKRD54-212ENST00000609706 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
ANKRD54-212ENST00000609706 OSCARQ8IYS5 282 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD54-212ENST00000609706 CUX1P39880 1505 aa28.66■■■□□ 2.18
ANKRD54-212ENST00000609706 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.64■■■□□ 2.17
ANKRD54-212ENST00000609706 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.64■■■□□ 2.17
ANKRD54-212ENST00000609706 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.17
ANKRD54-212ENST00000609706 SOGA1O94964 1423 aa28.58■■■□□ 2.17
ANKRD54-212ENST00000609706 WDR97A6NE52 1622 aa28.54■■■□□ 2.16
ANKRD54-212ENST00000609706 TRIM41Q8WV44 630 aa28.52■■■□□ 2.16
ANKRD54-212ENST00000609706 CHD1O14646 1710 aa28.51■■■□□ 2.15
ANKRD54-212ENST00000609706 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
ANKRD54-212ENST00000609706 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD54-212ENST00000609706 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD54-212ENST00000609706 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.43■■■□□ 2.14
ANKRD54-212ENST00000609706 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.41■■■□□ 2.14
ANKRD54-212ENST00000609706 ARHGEF11O15085 1522 aa28.38■■■□□ 2.13
ANKRD54-212ENST00000609706 GRIN2BQ13224 1484 aa28.35■■■□□ 2.13
ANKRD54-212ENST00000609706 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ANKRD54-212ENST00000609706 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.33■■■□□ 2.13
ANKRD54-212ENST00000609706 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.31■■■□□ 2.12
ANKRD54-212ENST00000609706 PBRM1Q86U86 1689 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD54-212ENST00000609706 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD54-212ENST00000609706 FBLN2P98095 1184 aa28.3■■■□□ 2.12
ANKRD54-212ENST00000609706 TOP2BQ02880 1626 aa28.29■■■□□ 2.12
ANKRD54-212ENST00000609706 SYNJ1O43426 1573 aa28.28■■■□□ 2.12
ANKRD54-212ENST00000609706 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.27■■■□□ 2.12
ANKRD54-212ENST00000609706 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.26■■■□□ 2.12
ANKRD54-212ENST00000609706 SYNJ2O15056 1496 aa28.23■■■□□ 2.11
ANKRD54-212ENST00000609706 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.22■■■□□ 2.11
ANKRD54-212ENST00000609706 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
ANKRD54-212ENST00000609706 ARAP1Q96P48 1450 aa28.14■■■□□ 2.09
ANKRD54-212ENST00000609706 ADAMTS12P58397 1594 aa28.08■■■□□ 2.09
ANKRD54-212ENST00000609706 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.01■■■□□ 2.07
ANKRD54-212ENST00000609706 GRIN2AQ12879 1464 aa28.01■■■□□ 2.07
ANKRD54-212ENST00000609706 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.98■■■□□ 2.07
ANKRD54-212ENST00000609706 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.93■■■□□ 2.06
ANKRD54-212ENST00000609706 CEP170Q5SW79 1584 aa27.92■■■□□ 2.06
ANKRD54-212ENST00000609706 NUP160Q12769 1436 aa27.91■■■□□ 2.06
ANKRD54-212ENST00000609706 SHROOM2Q13796 1616 aa27.78■■■□□ 2.04
ANKRD54-212ENST00000609706 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.77■■■□□ 2.04
ANKRD54-212ENST00000609706 KIF27Q86VH2 1401 aa27.69■■■□□ 2.02
ANKRD54-212ENST00000609706 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.69■■■□□ 2.02
ANKRD54-212ENST00000609706 CUL7Q14999 1698 aa27.65■■■□□ 2.02
ANKRD54-212ENST00000609706 IGF1RP08069 1367 aa27.61■■■□□ 2.01
ANKRD54-212ENST00000609706 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
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