RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609579.1

SGMS1-AS1-202, SGMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene SGMS1-AS1, Length 929 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.76■■■■■ 4.76
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SGMS1-AS1-202ENST00000609579 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.74■■■■□ 3.79
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.69■■■■□ 3.78
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 NACADO15069 1562 aa38.31■■■■□ 3.72
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.02■■■■□ 3.68
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.87■■■■□ 3.65
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SGMS1-AS1-202ENST00000609579 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.6■■■■□ 3.61
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.05■■■■□ 3.52
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.96■■■■□ 3.51
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.95■■■■□ 3.5
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.87■■■■□ 3.49
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 SCRIBQ14160 1630 aa36.85■■■■□ 3.49
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.76■■■■□ 3.48
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.87■■■■□ 3.33
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CUX2O14529 1486 aa35.44■■■■□ 3.26
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 NCAPD3P42695 1498 aa35.32■■■■□ 3.24
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ERCC6Q03468 1493 aa35.32■■■■□ 3.24
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.16■■■■□ 3.22
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 HMGXB3Q12766 1538 aa35.11■■■■□ 3.21
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 SMARCA4P51532 1647 aa35.1■■■■□ 3.21
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 SMARCA2P51531 1590 aa35.08■■■■□ 3.21
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 NESP48681 1621 aa34.99■■■■□ 3.19
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
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SGMS1-AS1-202ENST00000609579 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.74■■■■□ 3.15
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.7■■■■□ 3.14
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.66■■■■□ 3.14
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.5■■■■□ 3.11
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.4■■■■□ 3.1
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.21■■■■□ 3.07
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.19■■■■□ 3.06
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 WDR62O43379 1518 aa34.19■■■■□ 3.06
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 WIZO95785 1651 aa34.12■■■■□ 3.05
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 TRIM41Q8WV44 630 aa34.12■■■■□ 3.05
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.98■■■■□ 3.03
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.88■■■■□ 3.01
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CFTRP13569 1480 aa33.75■■■□□ 2.99
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 PRDM2Q13029 1718 aa33.61■■■□□ 2.97
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 OSCARQ8IYS5 282 aa33.59■■■□□ 2.97
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.43■■■□□ 2.94
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.43■■■□□ 2.94
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.43■■■□□ 2.94
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.31■■■□□ 2.92
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 IFT140Q96RY7 1462 aa33.28■■■□□ 2.92
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ARHGEF11O15085 1522 aa33.23■■■□□ 2.91
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.21■■■□□ 2.91
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 TOPBP1Q92547 1522 aa33.2■■■□□ 2.91
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.18■■■□□ 2.9
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CHD1O14646 1710 aa33.09■■■□□ 2.89
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.07■■■□□ 2.88
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ABCC8Q09428 1581 aa33.03■■■□□ 2.88
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.9■■■□□ 2.86
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ARAP1Q96P48 1450 aa32.86■■■□□ 2.85
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.86■■■□□ 2.85
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SGMS1-AS1-202ENST00000609579 FBLN2P98095 1184 aa32.71■■■□□ 2.83
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.69■■■□□ 2.82
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.67■■■□□ 2.82
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 WDR97A6NE52 1622 aa32.62■■■□□ 2.81
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.61■■■□□ 2.81
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.61■■■□□ 2.81
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.58■■■□□ 2.81
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 SOGA1O94964 1423 aa32.58■■■□□ 2.81
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.55■■■□□ 2.8
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 SYNJ1O43426 1573 aa32.53■■■□□ 2.8
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CUX1P39880 1505 aa32.46■■■□□ 2.79
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 PBRM1Q86U86 1689 aa32.43■■■□□ 2.78
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 GRIN2BQ13224 1484 aa32.41■■■□□ 2.78
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 SYNJ2O15056 1496 aa32.38■■■□□ 2.77
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.23■■■□□ 2.75
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.23■■■□□ 2.75
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.14■■■□□ 2.74
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.07■■■□□ 2.72
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.72
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 GRIN2AQ12879 1464 aa32.03■■■□□ 2.72
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ADAMTS12P58397 1594 aa32.02■■■□□ 2.72
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 CEP170Q5SW79 1584 aa31.99■■■□□ 2.71
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 SHROOM2Q13796 1616 aa31.93■■■□□ 2.7
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 NUP160Q12769 1436 aa31.92■■■□□ 2.7
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.88■■■□□ 2.69
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.85■■■□□ 2.69
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.84■■■□□ 2.69
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 TOP2BQ02880 1626 aa31.82■■■□□ 2.69
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.77■■■□□ 2.68
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.74■■■□□ 2.67
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.61■■■□□ 2.65
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.6■■■□□ 2.65
SGMS1-AS1-202ENST00000609579 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
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