RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608879.1

SYT6-204, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 5

Gene SYT6, Length 611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-204ENST00000608879 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.21■■■■■ 7.39
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SYT6-204ENST00000608879 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.69■■■■■ 5.86
SYT6-204ENST00000608879 NACADO15069 1562 aa51.5■■■■■ 5.84
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SYT6-204ENST00000608879 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.57■■■■■ 5.53
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SYT6-204ENST00000608879 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.78■■■■■ 5.4
SYT6-204ENST00000608879 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.54■■■■■ 5.36
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SYT6-204ENST00000608879 SMARCA2P51531 1590 aa47.41■■■■■ 5.18
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SYT6-204ENST00000608879 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.16■■■■■ 5.14
SYT6-204ENST00000608879 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.14■■■■■ 5.14
SYT6-204ENST00000608879 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
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SYT6-204ENST00000608879 NESP48681 1621 aa46.53■■■■■ 5.04
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SYT6-204ENST00000608879 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.98■■■■■ 4.95
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SYT6-204ENST00000608879 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.62■■■■■ 4.89
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SYT6-204ENST00000608879 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.59■■■■■ 4.89
SYT6-204ENST00000608879 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.57■■■■■ 4.89
SYT6-204ENST00000608879 WDR62O43379 1518 aa45.48■■■■■ 4.87
SYT6-204ENST00000608879 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.38■■■■■ 4.86
SYT6-204ENST00000608879 PRDM2Q13029 1718 aa45.37■■■■■ 4.85
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SYT6-204ENST00000608879 TOPBP1Q92547 1522 aa44.8■■■■■ 4.76
SYT6-204ENST00000608879 ABCC8Q09428 1581 aa44.78■■■■■ 4.76
SYT6-204ENST00000608879 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.71■■■■■ 4.75
SYT6-204ENST00000608879 IFT140Q96RY7 1462 aa44.65■■■■■ 4.74
SYT6-204ENST00000608879 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
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SYT6-204ENST00000608879 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.21■■■■■ 4.67
SYT6-204ENST00000608879 SOGA1O94964 1423 aa44.21■■■■■ 4.67
SYT6-204ENST00000608879 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.2■■■■■ 4.67
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SYT6-204ENST00000608879 WDR97A6NE52 1622 aa43.99■■■■■ 4.63
SYT6-204ENST00000608879 CHD1O14646 1710 aa43.84■■■■■ 4.61
SYT6-204ENST00000608879 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.82■■■■■ 4.6
SYT6-204ENST00000608879 TOP2BQ02880 1626 aa43.77■■■■■ 4.6
SYT6-204ENST00000608879 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.77■■■■■ 4.6
SYT6-204ENST00000608879 FBLN2P98095 1184 aa43.77■■■■■ 4.6
SYT6-204ENST00000608879 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.76■■■■■ 4.6
SYT6-204ENST00000608879 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.76■■■■■ 4.6
SYT6-204ENST00000608879 GRIN2BQ13224 1484 aa43.76■■■■■ 4.6
SYT6-204ENST00000608879 SYNJ1O43426 1573 aa43.73■■■■■ 4.59
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SYT6-204ENST00000608879 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.63■■■■■ 4.58
SYT6-204ENST00000608879 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.58■■■■■ 4.57
SYT6-204ENST00000608879 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.58■■■■■ 4.57
SYT6-204ENST00000608879 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.58■■■■■ 4.57
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SYT6-204ENST00000608879 NUP160Q12769 1436 aa43■■■■■ 4.47
SYT6-204ENST00000608879 CEP170Q5SW79 1584 aa42.99■■■■■ 4.47
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SYT6-204ENST00000608879 IGF1RP08069 1367 aa42.82■■■■■ 4.45
SYT6-204ENST00000608879 CUL7Q14999 1698 aa42.76■■■■■ 4.44
SYT6-204ENST00000608879 SHROOM2Q13796 1616 aa42.74■■■■■ 4.43
SYT6-204ENST00000608879 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.69■■■■■ 4.43
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SYT6-204ENST00000608879 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.57■■■■■ 4.41
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