RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606074.1

SLC9A3-AS1-202, SLC9A3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC9A3-AS1, Length 1,067 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.74■■■■■ 5.39
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.44■■■■■ 4.55
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ABCC9O60706 1549 aa42.91■■■■■ 4.46
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.06■■■■■ 4.16
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 NACADO15069 1562 aa40.97■■■■■ 4.15
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.76■■■■■ 4.12
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.7■■■■■ 4.11
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.55■■■■■ 4.08
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.39■■■■■ 4.06
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.16■■■■■ 4.02
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.97■■■■□ 3.99
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.9■■■■□ 3.98
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.79■■■■□ 3.96
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 SCRIBQ14160 1630 aa39.54■■■■□ 3.92
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.49■■■■□ 3.91
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.82■■■■□ 3.81
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.64■■■■□ 3.78
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 SMARCA4P51532 1647 aa37.84■■■■□ 3.65
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 NCAPD3P42695 1498 aa37.84■■■■□ 3.65
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.77■■■■□ 3.64
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 SMARCA2P51531 1590 aa37.72■■■■□ 3.63
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 HMGXB3Q12766 1538 aa37.59■■■■□ 3.61
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.55■■■■□ 3.6
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.51■■■■□ 3.6
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ERCC6Q03468 1493 aa37.07■■■■□ 3.53
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 WIZO95785 1651 aa37.03■■■■□ 3.52
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CUX2O14529 1486 aa36.94■■■■□ 3.5
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 NESP48681 1621 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.83■■■■□ 3.49
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.7■■■■□ 3.47
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.64■■■■□ 3.46
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.62■■■■□ 3.45
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.45
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.56■■■■□ 3.44
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CFTRP13569 1480 aa36.42■■■■□ 3.42
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.28■■■■□ 3.4
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.25■■■■□ 3.39
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.24■■■■□ 3.39
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.23■■■■□ 3.39
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 WDR62O43379 1518 aa36.13■■■■□ 3.38
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 PRDM2Q13029 1718 aa35.95■■■■□ 3.35
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.88■■■■□ 3.33
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ABCC8Q09428 1581 aa35.68■■■■□ 3.3
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 TOPBP1Q92547 1522 aa35.62■■■■□ 3.29
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.55■■■■□ 3.28
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 IFT140Q96RY7 1462 aa35.51■■■■□ 3.28
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 OSCARQ8IYS5 282 aa35.22■■■■□ 3.23
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CUX1P39880 1505 aa35.22■■■■□ 3.23
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 SOGA1O94964 1423 aa35.16■■■■□ 3.22
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.16■■■■□ 3.22
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 TRIM41Q8WV44 630 aa35.12■■■■□ 3.21
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.11■■■■□ 3.21
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.08■■■■□ 3.21
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 WDR97A6NE52 1622 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.93■■■■□ 3.18
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CHD1O14646 1710 aa34.89■■■■□ 3.18
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.85■■■■□ 3.17
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.84■■■■□ 3.17
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.84■■■■□ 3.17
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 TOP2BQ02880 1626 aa34.84■■■■□ 3.17
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.84■■■■□ 3.17
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.83■■■■□ 3.17
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 GRIN2BQ13224 1484 aa34.81■■■■□ 3.16
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 SYNJ1O43426 1573 aa34.78■■■■□ 3.16
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.76■■■■□ 3.15
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.15
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.75■■■■□ 3.15
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ARHGEF11O15085 1522 aa34.71■■■■□ 3.15
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 FBLN2P98095 1184 aa34.7■■■■□ 3.15
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.68■■■■□ 3.14
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 SYNJ2O15056 1496 aa34.62■■■■□ 3.13
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.61■■■■□ 3.13
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 PBRM1Q86U86 1689 aa34.58■■■■□ 3.13
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.42■■■■□ 3.1
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.42■■■■□ 3.1
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ADAMTS12P58397 1594 aa34.37■■■■□ 3.09
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.37■■■■□ 3.09
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.37■■■■□ 3.09
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 ARAP1Q96P48 1450 aa34.36■■■■□ 3.09
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 GRIN2AQ12879 1464 aa34.34■■■■□ 3.09
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 KIF27Q86VH2 1401 aa34.24■■■■□ 3.07
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 NUP160Q12769 1436 aa34.23■■■■□ 3.07
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 IGF1RP08069 1367 aa34.13■■■■□ 3.05
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CEP170Q5SW79 1584 aa34.13■■■■□ 3.05
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CUL7Q14999 1698 aa34■■■■□ 3.03
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 SHROOM2Q13796 1616 aa33.95■■■■□ 3.03
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.91■■■■□ 3.02
SLC9A3-AS1-202ENST00000606074 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms