RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604556.1

CHST8-205, Transcript of carbohydrate sulfotransferase 8, humanhuman

TSL 3

Gene CHST8, Length 683 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST8-205ENST00000604556 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.52■■■■■ 5.84
CHST8-205ENST00000604556 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.37■■■■■ 5.01
CHST8-205ENST00000604556 ABCC9O60706 1549 aa46.21■■■■■ 4.99
CHST8-205ENST00000604556 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.1■■■■■ 4.65
CHST8-205ENST00000604556 NACADO15069 1562 aa43.8■■■■■ 4.6
CHST8-205ENST00000604556 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.34■■■■■ 4.53
CHST8-205ENST00000604556 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.27■■■■■ 4.52
CHST8-205ENST00000604556 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.27■■■■■ 4.52
CHST8-205ENST00000604556 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.1■■■■■ 4.49
CHST8-205ENST00000604556 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.93■■■■■ 4.46
CHST8-205ENST00000604556 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.79■■■■■ 4.44
CHST8-205ENST00000604556 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
CHST8-205ENST00000604556 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.66■■■■■ 4.42
CHST8-205ENST00000604556 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.36■■■■■ 4.37
CHST8-205ENST00000604556 SCRIBQ14160 1630 aa42.08■■■■■ 4.33
CHST8-205ENST00000604556 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.82■■■■■ 4.29
CHST8-205ENST00000604556 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
CHST8-205ENST00000604556 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.68■■■■■ 4.26
CHST8-205ENST00000604556 NCAPD3P42695 1498 aa40.41■■■■■ 4.06
CHST8-205ENST00000604556 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.24■■■■■ 4.03
CHST8-205ENST00000604556 SMARCA4P51532 1647 aa40.22■■■■■ 4.03
CHST8-205ENST00000604556 SMARCA2P51531 1590 aa40.18■■■■■ 4.02
CHST8-205ENST00000604556 HMGXB3Q12766 1538 aa40.15■■■■■ 4.02
CHST8-205ENST00000604556 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
CHST8-205ENST00000604556 CUX2O14529 1486 aa39.99■■■■□ 3.99
CHST8-205ENST00000604556 ERCC6Q03468 1493 aa39.94■■■■□ 3.98
CHST8-205ENST00000604556 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.92■■■■□ 3.98
CHST8-205ENST00000604556 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.9■■■■□ 3.98
CHST8-205ENST00000604556 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.85■■■■□ 3.97
CHST8-205ENST00000604556 NESP48681 1621 aa39.68■■■■□ 3.94
CHST8-205ENST00000604556 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.65■■■■□ 3.94
CHST8-205ENST00000604556 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.55■■■■□ 3.92
CHST8-205ENST00000604556 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.41■■■■□ 3.9
CHST8-205ENST00000604556 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.26■■■■□ 3.88
CHST8-205ENST00000604556 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.25■■■■□ 3.87
CHST8-205ENST00000604556 WIZO95785 1651 aa39.17■■■■□ 3.86
CHST8-205ENST00000604556 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.13■■■■□ 3.85
CHST8-205ENST00000604556 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.92■■■■□ 3.82
CHST8-205ENST00000604556 WDR62O43379 1518 aa38.86■■■■□ 3.81
CHST8-205ENST00000604556 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.81■■■■□ 3.8
CHST8-205ENST00000604556 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.75■■■■□ 3.79
CHST8-205ENST00000604556 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
CHST8-205ENST00000604556 CFTRP13569 1480 aa38.72■■■■□ 3.79
CHST8-205ENST00000604556 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.68■■■■□ 3.78
CHST8-205ENST00000604556 PRDM2Q13029 1718 aa38.41■■■■□ 3.74
CHST8-205ENST00000604556 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.37■■■■□ 3.73
CHST8-205ENST00000604556 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.23■■■■□ 3.71
CHST8-205ENST00000604556 OSCARQ8IYS5 282 aa38.05■■■■□ 3.68
CHST8-205ENST00000604556 TRIM41Q8WV44 630 aa38.02■■■■□ 3.68
CHST8-205ENST00000604556 IFT140Q96RY7 1462 aa38■■■■□ 3.67
CHST8-205ENST00000604556 TOPBP1Q92547 1522 aa37.96■■■■□ 3.67
CHST8-205ENST00000604556 ABCC8Q09428 1581 aa37.95■■■■□ 3.67
CHST8-205ENST00000604556 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
CHST8-205ENST00000604556 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.85■■■■□ 3.65
CHST8-205ENST00000604556 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
CHST8-205ENST00000604556 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
CHST8-205ENST00000604556 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.6■■■■□ 3.61
CHST8-205ENST00000604556 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.6■■■■□ 3.61
CHST8-205ENST00000604556 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.6■■■■□ 3.61
CHST8-205ENST00000604556 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
CHST8-205ENST00000604556 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.49■■■■□ 3.59
CHST8-205ENST00000604556 ARHGEF11O15085 1522 aa37.48■■■■□ 3.59
CHST8-205ENST00000604556 CHD1O14646 1710 aa37.45■■■■□ 3.59
CHST8-205ENST00000604556 WDR97A6NE52 1622 aa37.39■■■■□ 3.58
CHST8-205ENST00000604556 SOGA1O94964 1423 aa37.36■■■■□ 3.57
CHST8-205ENST00000604556 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.35■■■■□ 3.57
CHST8-205ENST00000604556 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.31■■■■□ 3.56
CHST8-205ENST00000604556 CUX1P39880 1505 aa37.26■■■■□ 3.56
CHST8-205ENST00000604556 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.25■■■■□ 3.55
CHST8-205ENST00000604556 FBLN2P98095 1184 aa37.19■■■■□ 3.54
CHST8-205ENST00000604556 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.15■■■■□ 3.54
CHST8-205ENST00000604556 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
CHST8-205ENST00000604556 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.54
CHST8-205ENST00000604556 GRIN2BQ13224 1484 aa37.09■■■■□ 3.53
CHST8-205ENST00000604556 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.09■■■■□ 3.53
CHST8-205ENST00000604556 ARAP1Q96P48 1450 aa37.08■■■■□ 3.53
CHST8-205ENST00000604556 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.05■■■■□ 3.52
CHST8-205ENST00000604556 SYNJ1O43426 1573 aa37.02■■■■□ 3.52
CHST8-205ENST00000604556 SYNJ2O15056 1496 aa36.99■■■■□ 3.51
CHST8-205ENST00000604556 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.98■■■■□ 3.51
CHST8-205ENST00000604556 PBRM1Q86U86 1689 aa36.96■■■■□ 3.51
CHST8-205ENST00000604556 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.93■■■■□ 3.5
CHST8-205ENST00000604556 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.93■■■■□ 3.5
CHST8-205ENST00000604556 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.89■■■■□ 3.5
CHST8-205ENST00000604556 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.74■■■■□ 3.47
CHST8-205ENST00000604556 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.74■■■■□ 3.47
CHST8-205ENST00000604556 TOP2BQ02880 1626 aa36.71■■■■□ 3.47
CHST8-205ENST00000604556 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.68■■■■□ 3.46
CHST8-205ENST00000604556 GRIN2AQ12879 1464 aa36.61■■■■□ 3.45
CHST8-205ENST00000604556 ADAMTS12P58397 1594 aa36.6■■■■□ 3.45
CHST8-205ENST00000604556 NUP160Q12769 1436 aa36.51■■■■□ 3.43
CHST8-205ENST00000604556 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.49■■■■□ 3.43
CHST8-205ENST00000604556 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.48■■■■□ 3.43
CHST8-205ENST00000604556 CEP170Q5SW79 1584 aa36.47■■■■□ 3.43
CHST8-205ENST00000604556 SHROOM2Q13796 1616 aa36.39■■■■□ 3.42
CHST8-205ENST00000604556 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.36■■■■□ 3.41
CHST8-205ENST00000604556 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.1■■■■□ 3.37
CHST8-205ENST00000604556 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CHST8-205ENST00000604556 JPH4Q96JJ6 628 aa36.04■■■■□ 3.36
CHST8-205ENST00000604556 CUL7Q14999 1698 aa35.97■■■■□ 3.35
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