RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604095.1

FBXW7-209, Transcript of F-box and WD repeat domain containing 7, humanhuman

TSL 3

Gene FBXW7, Length 755 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW7-209ENST00000604095 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.55■■■□□ 2.64
FBXW7-209ENST00000604095 ABCC9O60706 1549 aa28.32■■■□□ 2.12
FBXW7-209ENST00000604095 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.21■■■□□ 2.11
FBXW7-209ENST00000604095 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.96■■□□□ 1.91
FBXW7-209ENST00000604095 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.92■■□□□ 1.9
FBXW7-209ENST00000604095 NACADO15069 1562 aa26.71■■□□□ 1.87
FBXW7-209ENST00000604095 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.48■■□□□ 1.83
FBXW7-209ENST00000604095 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
FBXW7-209ENST00000604095 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.28■■□□□ 1.8
FBXW7-209ENST00000604095 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.22■■□□□ 1.79
FBXW7-209ENST00000604095 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
FBXW7-209ENST00000604095 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.03■■□□□ 1.76
FBXW7-209ENST00000604095 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.98■■□□□ 1.75
FBXW7-209ENST00000604095 SCRIBQ14160 1630 aa25.83■■□□□ 1.73
FBXW7-209ENST00000604095 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.67■■□□□ 1.7
FBXW7-209ENST00000604095 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.51■■□□□ 1.67
FBXW7-209ENST00000604095 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.47■■□□□ 1.67
FBXW7-209ENST00000604095 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
FBXW7-209ENST00000604095 NCAPD3P42695 1498 aa24.66■■□□□ 1.54
FBXW7-209ENST00000604095 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.61■■□□□ 1.53
FBXW7-209ENST00000604095 SMARCA4P51532 1647 aa24.58■■□□□ 1.53
FBXW7-209ENST00000604095 SMARCA2P51531 1590 aa24.56■■□□□ 1.52
FBXW7-209ENST00000604095 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
FBXW7-209ENST00000604095 ERCC6Q03468 1493 aa24.5■■□□□ 1.51
FBXW7-209ENST00000604095 HMGXB3Q12766 1538 aa24.44■■□□□ 1.5
FBXW7-209ENST00000604095 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
FBXW7-209ENST00000604095 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.33■■□□□ 1.48
FBXW7-209ENST00000604095 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.3■■□□□ 1.48
FBXW7-209ENST00000604095 NESP48681 1621 aa24.3■■□□□ 1.48
FBXW7-209ENST00000604095 CUX2O14529 1486 aa24.29■■□□□ 1.48
FBXW7-209ENST00000604095 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.27■■□□□ 1.48
FBXW7-209ENST00000604095 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.1■■□□□ 1.45
FBXW7-209ENST00000604095 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.05■■□□□ 1.44
FBXW7-209ENST00000604095 WIZO95785 1651 aa24.05■■□□□ 1.44
FBXW7-209ENST00000604095 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.98■■□□□ 1.43
FBXW7-209ENST00000604095 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.94■■□□□ 1.42
FBXW7-209ENST00000604095 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
FBXW7-209ENST00000604095 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
FBXW7-209ENST00000604095 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.78■■□□□ 1.4
FBXW7-209ENST00000604095 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.73■■□□□ 1.39
FBXW7-209ENST00000604095 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
FBXW7-209ENST00000604095 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.7■■□□□ 1.38
FBXW7-209ENST00000604095 WDR62O43379 1518 aa23.66■■□□□ 1.38
FBXW7-209ENST00000604095 CFTRP13569 1480 aa23.66■■□□□ 1.38
FBXW7-209ENST00000604095 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.5■■□□□ 1.35
FBXW7-209ENST00000604095 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
FBXW7-209ENST00000604095 TRIM41Q8WV44 630 aa23.42■■□□□ 1.34
FBXW7-209ENST00000604095 PRDM2Q13029 1718 aa23.37■■□□□ 1.33
FBXW7-209ENST00000604095 OSCARQ8IYS5 282 aa23.36■■□□□ 1.33
FBXW7-209ENST00000604095 IFT140Q96RY7 1462 aa23.24■■□□□ 1.31
FBXW7-209ENST00000604095 TOPBP1Q92547 1522 aa23.23■■□□□ 1.31
FBXW7-209ENST00000604095 ABCC8Q09428 1581 aa23.23■■□□□ 1.31
FBXW7-209ENST00000604095 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
FBXW7-209ENST00000604095 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.14■■□□□ 1.29
FBXW7-209ENST00000604095 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
FBXW7-209ENST00000604095 FBLN2P98095 1184 aa23.06■■□□□ 1.28
FBXW7-209ENST00000604095 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
FBXW7-209ENST00000604095 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
FBXW7-209ENST00000604095 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
FBXW7-209ENST00000604095 SOGA1O94964 1423 aa22.99■■□□□ 1.27
FBXW7-209ENST00000604095 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
FBXW7-209ENST00000604095 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.96■■□□□ 1.27
FBXW7-209ENST00000604095 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
FBXW7-209ENST00000604095 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.9■■□□□ 1.26
FBXW7-209ENST00000604095 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.9■■□□□ 1.26
FBXW7-209ENST00000604095 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.9■■□□□ 1.26
FBXW7-209ENST00000604095 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.89■■□□□ 1.25
FBXW7-209ENST00000604095 CHD1O14646 1710 aa22.85■■□□□ 1.25
FBXW7-209ENST00000604095 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.85■■□□□ 1.25
FBXW7-209ENST00000604095 CUX1P39880 1505 aa22.84■■□□□ 1.25
FBXW7-209ENST00000604095 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
FBXW7-209ENST00000604095 ARHGEF11O15085 1522 aa22.83■■□□□ 1.25
FBXW7-209ENST00000604095 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.77■■□□□ 1.24
FBXW7-209ENST00000604095 GRIN2BQ13224 1484 aa22.73■■□□□ 1.23
FBXW7-209ENST00000604095 WDR97A6NE52 1622 aa22.72■■□□□ 1.23
FBXW7-209ENST00000604095 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
FBXW7-209ENST00000604095 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.66■■□□□ 1.22
FBXW7-209ENST00000604095 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
FBXW7-209ENST00000604095 SYNJ2O15056 1496 aa22.63■■□□□ 1.21
FBXW7-209ENST00000604095 SYNJ1O43426 1573 aa22.63■■□□□ 1.21
FBXW7-209ENST00000604095 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.21
FBXW7-209ENST00000604095 ARAP1Q96P48 1450 aa22.6■■□□□ 1.21
FBXW7-209ENST00000604095 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.59■■□□□ 1.21
FBXW7-209ENST00000604095 PBRM1Q86U86 1689 aa22.58■■□□□ 1.21
FBXW7-209ENST00000604095 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.54■■□□□ 1.2
FBXW7-209ENST00000604095 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.51■■□□□ 1.19
FBXW7-209ENST00000604095 TOP2BQ02880 1626 aa22.49■■□□□ 1.19
FBXW7-209ENST00000604095 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.46■■□□□ 1.19
FBXW7-209ENST00000604095 GRIN2AQ12879 1464 aa22.41■■□□□ 1.18
FBXW7-209ENST00000604095 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.37■■□□□ 1.17
FBXW7-209ENST00000604095 ADAMTS12P58397 1594 aa22.36■■□□□ 1.17
FBXW7-209ENST00000604095 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.31■■□□□ 1.16
FBXW7-209ENST00000604095 CEP170Q5SW79 1584 aa22.29■■□□□ 1.16
FBXW7-209ENST00000604095 NUP160Q12769 1436 aa22.28■■□□□ 1.16
FBXW7-209ENST00000604095 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.25■■□□□ 1.15
FBXW7-209ENST00000604095 JPH4Q96JJ6 628 aa22.22■■□□□ 1.15
FBXW7-209ENST00000604095 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
FBXW7-209ENST00000604095 KIF27Q86VH2 1401 aa22.15■■□□□ 1.14
FBXW7-209ENST00000604095 SHROOM2Q13796 1616 aa22.14■■□□□ 1.14
FBXW7-209ENST00000604095 IGF1RP08069 1367 aa22.11■■□□□ 1.13
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