RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602733.5

TCP11L1-211, Transcript of t-complex 11 like 1, humanhuman

TSL 4

Gene TCP11L1, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP11L1-211ENST00000602733 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.18■■■■■ 7.38
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TCP11L1-211ENST00000602733 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.91■■■■■ 6.38
TCP11L1-211ENST00000602733 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.28■■■■■ 5.96
TCP11L1-211ENST00000602733 NACADO15069 1562 aa51.9■■■■■ 5.9
TCP11L1-211ENST00000602733 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.88■■■■■ 5.9
TCP11L1-211ENST00000602733 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.65■■■■■ 5.86
TCP11L1-211ENST00000602733 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.35■■■■■ 5.81
TCP11L1-211ENST00000602733 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.28■■■■■ 5.8
TCP11L1-211ENST00000602733 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.12■■■■■ 5.77
TCP11L1-211ENST00000602733 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.94■■■■■ 5.74
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TCP11L1-211ENST00000602733 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.46■■■■■ 5.67
TCP11L1-211ENST00000602733 SCRIBQ14160 1630 aa50.11■■■■■ 5.61
TCP11L1-211ENST00000602733 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.95■■■■■ 5.59
TCP11L1-211ENST00000602733 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.76■■■■■ 5.56
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TCP11L1-211ENST00000602733 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.56■■■■■ 5.52
TCP11L1-211ENST00000602733 NCAPD3P42695 1498 aa47.94■■■■■ 5.26
TCP11L1-211ENST00000602733 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.82■■■■■ 5.25
TCP11L1-211ENST00000602733 SMARCA4P51532 1647 aa47.77■■■■■ 5.24
TCP11L1-211ENST00000602733 SMARCA2P51531 1590 aa47.59■■■■■ 5.21
TCP11L1-211ENST00000602733 HMGXB3Q12766 1538 aa47.56■■■■■ 5.2
TCP11L1-211ENST00000602733 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.53■■■■■ 5.2
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TCP11L1-211ENST00000602733 ERCC6Q03468 1493 aa47.42■■■■■ 5.18
TCP11L1-211ENST00000602733 CUX2O14529 1486 aa47.38■■■■■ 5.17
TCP11L1-211ENST00000602733 NESP48681 1621 aa47.35■■■■■ 5.17
TCP11L1-211ENST00000602733 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
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TCP11L1-211ENST00000602733 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.21■■■■■ 5.15
TCP11L1-211ENST00000602733 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.86■■■■■ 5.09
TCP11L1-211ENST00000602733 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.85■■■■■ 5.09
TCP11L1-211ENST00000602733 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.74■■■■■ 5.07
TCP11L1-211ENST00000602733 WIZO95785 1651 aa46.68■■■■■ 5.06
TCP11L1-211ENST00000602733 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.53■■■■■ 5.04
TCP11L1-211ENST00000602733 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.47■■■■■ 5.03
TCP11L1-211ENST00000602733 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.19■■■■■ 4.99
TCP11L1-211ENST00000602733 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.15■■■■■ 4.98
TCP11L1-211ENST00000602733 WDR62O43379 1518 aa46.12■■■■■ 4.97
TCP11L1-211ENST00000602733 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.97■■■■■ 4.95
TCP11L1-211ENST00000602733 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.96■■■■■ 4.95
TCP11L1-211ENST00000602733 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.96■■■■■ 4.95
TCP11L1-211ENST00000602733 CFTRP13569 1480 aa45.93■■■■■ 4.94
TCP11L1-211ENST00000602733 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
TCP11L1-211ENST00000602733 PRDM2Q13029 1718 aa45.55■■■■■ 4.88
TCP11L1-211ENST00000602733 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.49■■■■■ 4.87
TCP11L1-211ENST00000602733 TRIM41Q8WV44 630 aa45.41■■■■■ 4.86
TCP11L1-211ENST00000602733 OSCARQ8IYS5 282 aa45.2■■■■■ 4.83
TCP11L1-211ENST00000602733 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.82
TCP11L1-211ENST00000602733 TOPBP1Q92547 1522 aa45.11■■■■■ 4.81
TCP11L1-211ENST00000602733 IFT140Q96RY7 1462 aa45.05■■■■■ 4.8
TCP11L1-211ENST00000602733 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.9■■■■■ 4.78
TCP11L1-211ENST00000602733 ABCC8Q09428 1581 aa44.86■■■■■ 4.77
TCP11L1-211ENST00000602733 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.83■■■■■ 4.77
TCP11L1-211ENST00000602733 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.77■■■■■ 4.76
TCP11L1-211ENST00000602733 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.77■■■■■ 4.76
TCP11L1-211ENST00000602733 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
TCP11L1-211ENST00000602733 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.77■■■■■ 4.76
TCP11L1-211ENST00000602733 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.68■■■■■ 4.74
TCP11L1-211ENST00000602733 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.64■■■■■ 4.74
TCP11L1-211ENST00000602733 CHD1O14646 1710 aa44.59■■■■■ 4.73
TCP11L1-211ENST00000602733 ARHGEF11O15085 1522 aa44.55■■■■■ 4.72
TCP11L1-211ENST00000602733 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.54■■■■■ 4.72
TCP11L1-211ENST00000602733 SOGA1O94964 1423 aa44.4■■■■■ 4.7
TCP11L1-211ENST00000602733 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.37■■■■■ 4.69
TCP11L1-211ENST00000602733 CUX1P39880 1505 aa44.35■■■■■ 4.69
TCP11L1-211ENST00000602733 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.35■■■■■ 4.69
TCP11L1-211ENST00000602733 FBLN2P98095 1184 aa44.31■■■■■ 4.68
TCP11L1-211ENST00000602733 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.22■■■■■ 4.67
TCP11L1-211ENST00000602733 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.19■■■■■ 4.66
TCP11L1-211ENST00000602733 ARAP1Q96P48 1450 aa44.15■■■■■ 4.66
TCP11L1-211ENST00000602733 WDR97A6NE52 1622 aa44.14■■■■■ 4.66
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TCP11L1-211ENST00000602733 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.02■■■■■ 4.64
TCP11L1-211ENST00000602733 GRIN2BQ13224 1484 aa43.99■■■■■ 4.63
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TCP11L1-211ENST00000602733 PBRM1Q86U86 1689 aa43.94■■■■■ 4.63
TCP11L1-211ENST00000602733 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
TCP11L1-211ENST00000602733 SYNJ1O43426 1573 aa43.88■■■■■ 4.62
TCP11L1-211ENST00000602733 SYNJ2O15056 1496 aa43.86■■■■■ 4.61
TCP11L1-211ENST00000602733 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.86■■■■■ 4.61
TCP11L1-211ENST00000602733 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.81■■■■■ 4.6
TCP11L1-211ENST00000602733 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.81■■■■■ 4.6
TCP11L1-211ENST00000602733 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.69■■■■■ 4.58
TCP11L1-211ENST00000602733 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.59■■■■■ 4.57
TCP11L1-211ENST00000602733 TOP2BQ02880 1626 aa43.56■■■■■ 4.56
TCP11L1-211ENST00000602733 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.55■■■■■ 4.56
TCP11L1-211ENST00000602733 ADAMTS12P58397 1594 aa43.47■■■■■ 4.55
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TCP11L1-211ENST00000602733 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.43■■■■■ 4.54
TCP11L1-211ENST00000602733 CEP170Q5SW79 1584 aa43.4■■■■■ 4.54
TCP11L1-211ENST00000602733 NUP160Q12769 1436 aa43.33■■■■■ 4.53
TCP11L1-211ENST00000602733 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.27■■■■■ 4.52
TCP11L1-211ENST00000602733 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.22■■■■■ 4.51
TCP11L1-211ENST00000602733 SHROOM2Q13796 1616 aa43.2■■■■■ 4.51
TCP11L1-211ENST00000602733 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
TCP11L1-211ENST00000602733 JPH4Q96JJ6 628 aa42.87■■■■■ 4.45
TCP11L1-211ENST00000602733 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.86■■■■■ 4.45
TCP11L1-211ENST00000602733 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.75■■■■■ 4.43
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