RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602181.5

FKRP-226, Transcript of fukutin related protein, humanhuman

TSL 4

Gene FKRP, Length 482 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRP-226ENST00000602181 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.74■■■■■ 6.35
FKRP-226ENST00000602181 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49■■■■■ 5.43
FKRP-226ENST00000602181 ABCC9O60706 1549 aa48.71■■■■■ 5.39
FKRP-226ENST00000602181 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.49■■■■■ 5.03
FKRP-226ENST00000602181 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.21■■■■■ 4.99
FKRP-226ENST00000602181 NACADO15069 1562 aa46.21■■■■■ 4.99
FKRP-226ENST00000602181 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.61■■■■■ 4.89
FKRP-226ENST00000602181 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.48■■■■■ 4.87
FKRP-226ENST00000602181 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
FKRP-226ENST00000602181 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.41■■■■■ 4.86
FKRP-226ENST00000602181 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.28■■■■■ 4.84
FKRP-226ENST00000602181 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.17■■■■■ 4.82
FKRP-226ENST00000602181 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.07■■■■■ 4.8
FKRP-226ENST00000602181 SCRIBQ14160 1630 aa44.76■■■■■ 4.76
FKRP-226ENST00000602181 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.47■■■■■ 4.71
FKRP-226ENST00000602181 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44■■■■■ 4.63
FKRP-226ENST00000602181 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.97■■■■■ 4.63
FKRP-226ENST00000602181 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.82■■■■■ 4.6
FKRP-226ENST00000602181 SMARCA4P51532 1647 aa42.67■■■■■ 4.42
FKRP-226ENST00000602181 NCAPD3P42695 1498 aa42.62■■■■■ 4.41
FKRP-226ENST00000602181 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.57■■■■■ 4.41
FKRP-226ENST00000602181 SMARCA2P51531 1590 aa42.51■■■■■ 4.4
FKRP-226ENST00000602181 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
FKRP-226ENST00000602181 HMGXB3Q12766 1538 aa42.37■■■■■ 4.37
FKRP-226ENST00000602181 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
FKRP-226ENST00000602181 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.2■■■■■ 4.35
FKRP-226ENST00000602181 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.18■■■■■ 4.34
FKRP-226ENST00000602181 ERCC6Q03468 1493 aa42.07■■■■■ 4.33
FKRP-226ENST00000602181 NESP48681 1621 aa41.93■■■■■ 4.3
FKRP-226ENST00000602181 CUX2O14529 1486 aa41.77■■■■■ 4.28
FKRP-226ENST00000602181 WIZO95785 1651 aa41.77■■■■■ 4.28
FKRP-226ENST00000602181 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.66■■■■■ 4.26
FKRP-226ENST00000602181 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.45■■■■■ 4.23
FKRP-226ENST00000602181 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.43■■■■■ 4.22
FKRP-226ENST00000602181 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.42■■■■■ 4.22
FKRP-226ENST00000602181 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
FKRP-226ENST00000602181 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.37■■■■■ 4.21
FKRP-226ENST00000602181 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.32■■■■■ 4.21
FKRP-226ENST00000602181 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
FKRP-226ENST00000602181 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.05■■■■■ 4.16
FKRP-226ENST00000602181 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.98■■■■■ 4.15
FKRP-226ENST00000602181 CFTRP13569 1480 aa40.96■■■■■ 4.15
FKRP-226ENST00000602181 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.95■■■■■ 4.15
FKRP-226ENST00000602181 WDR62O43379 1518 aa40.92■■■■■ 4.14
FKRP-226ENST00000602181 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.75■■■■■ 4.11
FKRP-226ENST00000602181 PRDM2Q13029 1718 aa40.7■■■■■ 4.11
FKRP-226ENST00000602181 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
FKRP-226ENST00000602181 TOPBP1Q92547 1522 aa40.21■■■■■ 4.03
FKRP-226ENST00000602181 ABCC8Q09428 1581 aa40.11■■■■■ 4.01
FKRP-226ENST00000602181 IFT140Q96RY7 1462 aa40.11■■■■■ 4.01
FKRP-226ENST00000602181 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.1■■■■■ 4.01
FKRP-226ENST00000602181 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
FKRP-226ENST00000602181 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
FKRP-226ENST00000602181 OSCARQ8IYS5 282 aa39.94■■■■□ 3.98
FKRP-226ENST00000602181 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
FKRP-226ENST00000602181 TRIM41Q8WV44 630 aa39.82■■■■□ 3.97
FKRP-226ENST00000602181 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
FKRP-226ENST00000602181 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
FKRP-226ENST00000602181 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.72■■■■□ 3.95
FKRP-226ENST00000602181 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.68■■■■□ 3.94
FKRP-226ENST00000602181 SOGA1O94964 1423 aa39.65■■■■□ 3.94
FKRP-226ENST00000602181 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.64■■■■□ 3.94
FKRP-226ENST00000602181 CUX1P39880 1505 aa39.64■■■■□ 3.94
FKRP-226ENST00000602181 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
FKRP-226ENST00000602181 CHD1O14646 1710 aa39.54■■■■□ 3.92
FKRP-226ENST00000602181 FBLN2P98095 1184 aa39.48■■■■□ 3.91
FKRP-226ENST00000602181 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
FKRP-226ENST00000602181 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
FKRP-226ENST00000602181 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.43■■■■□ 3.9
FKRP-226ENST00000602181 WDR97A6NE52 1622 aa39.41■■■■□ 3.9
FKRP-226ENST00000602181 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.35■■■■□ 3.89
FKRP-226ENST00000602181 ARHGEF11O15085 1522 aa39.32■■■■□ 3.89
FKRP-226ENST00000602181 GRIN2BQ13224 1484 aa39.26■■■■□ 3.88
FKRP-226ENST00000602181 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
FKRP-226ENST00000602181 PBRM1Q86U86 1689 aa39.2■■■■□ 3.87
FKRP-226ENST00000602181 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.19■■■■□ 3.86
FKRP-226ENST00000602181 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.17■■■■□ 3.86
FKRP-226ENST00000602181 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.16■■■■□ 3.86
FKRP-226ENST00000602181 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.13■■■■□ 3.85
FKRP-226ENST00000602181 TOP2BQ02880 1626 aa39.11■■■■□ 3.85
FKRP-226ENST00000602181 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.11■■■■□ 3.85
FKRP-226ENST00000602181 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.11■■■■□ 3.85
FKRP-226ENST00000602181 SYNJ1O43426 1573 aa39.1■■■■□ 3.85
FKRP-226ENST00000602181 SYNJ2O15056 1496 aa39.09■■■■□ 3.85
FKRP-226ENST00000602181 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.03■■■■□ 3.84
FKRP-226ENST00000602181 CLASP1Q7Z460 1538 aa39■■■■□ 3.83
FKRP-226ENST00000602181 ARAP1Q96P48 1450 aa38.94■■■■□ 3.82
FKRP-226ENST00000602181 ADAMTS12P58397 1594 aa38.81■■■■□ 3.8
FKRP-226ENST00000602181 GRIN2AQ12879 1464 aa38.76■■■■□ 3.8
FKRP-226ENST00000602181 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.69■■■■□ 3.78
FKRP-226ENST00000602181 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.67■■■■□ 3.78
FKRP-226ENST00000602181 CEP170Q5SW79 1584 aa38.62■■■■□ 3.77
FKRP-226ENST00000602181 NUP160Q12769 1436 aa38.56■■■■□ 3.76
FKRP-226ENST00000602181 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.55■■■■□ 3.76
FKRP-226ENST00000602181 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.46■■■■□ 3.75
FKRP-226ENST00000602181 SHROOM2Q13796 1616 aa38.38■■■■□ 3.74
FKRP-226ENST00000602181 KIF27Q86VH2 1401 aa38.36■■■■□ 3.73
FKRP-226ENST00000602181 CUL7Q14999 1698 aa38.25■■■■□ 3.71
FKRP-226ENST00000602181 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.25■■■■□ 3.71
FKRP-226ENST00000602181 IGF1RP08069 1367 aa38.24■■■■□ 3.71
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