RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.41■■■■■ 4.38
HERC3-214ENST00000601319 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38■■■■□ 3.67
HERC3-214ENST00000601319 ABCC9O60706 1549 aa37.08■■■■□ 3.53
HERC3-214ENST00000601319 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.74■■■■□ 3.31
HERC3-214ENST00000601319 NACADO15069 1562 aa35.65■■■■□ 3.3
HERC3-214ENST00000601319 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.43■■■■□ 3.26
HERC3-214ENST00000601319 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
HERC3-214ENST00000601319 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.19■■■■□ 3.22
HERC3-214ENST00000601319 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.18■■■■□ 3.22
HERC3-214ENST00000601319 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.05■■■■□ 3.2
HERC3-214ENST00000601319 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.66■■■■□ 3.14
HERC3-214ENST00000601319 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.48■■■■□ 3.11
HERC3-214ENST00000601319 SCRIBQ14160 1630 aa34.48■■■■□ 3.11
HERC3-214ENST00000601319 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.38■■■■□ 3.09
HERC3-214ENST00000601319 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.1■■■■□ 3.05
HERC3-214ENST00000601319 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
HERC3-214ENST00000601319 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.65■■■□□ 2.98
HERC3-214ENST00000601319 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.37■■■□□ 2.93
HERC3-214ENST00000601319 SMARCA4P51532 1647 aa33.02■■■□□ 2.88
HERC3-214ENST00000601319 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.93■■■□□ 2.86
HERC3-214ENST00000601319 NCAPD3P42695 1498 aa32.83■■■□□ 2.85
HERC3-214ENST00000601319 SMARCA2P51531 1590 aa32.83■■■□□ 2.85
HERC3-214ENST00000601319 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.8■■■□□ 2.84
HERC3-214ENST00000601319 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.75■■■□□ 2.83
HERC3-214ENST00000601319 HMGXB3Q12766 1538 aa32.75■■■□□ 2.83
HERC3-214ENST00000601319 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.66■■■□□ 2.82
HERC3-214ENST00000601319 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.53■■■□□ 2.8
HERC3-214ENST00000601319 WIZO95785 1651 aa32.34■■■□□ 2.77
HERC3-214ENST00000601319 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
HERC3-214ENST00000601319 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.08■■■□□ 2.73
HERC3-214ENST00000601319 NESP48681 1621 aa32.04■■■□□ 2.72
HERC3-214ENST00000601319 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.01■■■□□ 2.72
HERC3-214ENST00000601319 ERCC6Q03468 1493 aa31.99■■■□□ 2.71
HERC3-214ENST00000601319 CUX2O14529 1486 aa31.83■■■□□ 2.69
HERC3-214ENST00000601319 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.83■■■□□ 2.69
HERC3-214ENST00000601319 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.8■■■□□ 2.68
HERC3-214ENST00000601319 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
HERC3-214ENST00000601319 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.75■■■□□ 2.67
HERC3-214ENST00000601319 CFTRP13569 1480 aa31.64■■■□□ 2.66
HERC3-214ENST00000601319 PRDM2Q13029 1718 aa31.63■■■□□ 2.65
HERC3-214ENST00000601319 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.53■■■□□ 2.64
HERC3-214ENST00000601319 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.48■■■□□ 2.63
HERC3-214ENST00000601319 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.48■■■□□ 2.63
HERC3-214ENST00000601319 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.47■■■□□ 2.63
HERC3-214ENST00000601319 WDR62O43379 1518 aa31.45■■■□□ 2.63
HERC3-214ENST00000601319 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
HERC3-214ENST00000601319 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
HERC3-214ENST00000601319 ABCC8Q09428 1581 aa30.99■■■□□ 2.55
HERC3-214ENST00000601319 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.98■■■□□ 2.55
HERC3-214ENST00000601319 TOPBP1Q92547 1522 aa30.98■■■□□ 2.55
HERC3-214ENST00000601319 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.92■■■□□ 2.54
HERC3-214ENST00000601319 IFT140Q96RY7 1462 aa30.82■■■□□ 2.53
HERC3-214ENST00000601319 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
HERC3-214ENST00000601319 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
HERC3-214ENST00000601319 CUX1P39880 1505 aa30.67■■■□□ 2.5
HERC3-214ENST00000601319 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
HERC3-214ENST00000601319 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.66■■■□□ 2.5
HERC3-214ENST00000601319 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.58■■■□□ 2.49
HERC3-214ENST00000601319 WDR97A6NE52 1622 aa30.56■■■□□ 2.48
HERC3-214ENST00000601319 SOGA1O94964 1423 aa30.48■■■□□ 2.47
HERC3-214ENST00000601319 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.48■■■□□ 2.47
HERC3-214ENST00000601319 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.47■■■□□ 2.47
HERC3-214ENST00000601319 TOP2BQ02880 1626 aa30.42■■■□□ 2.46
HERC3-214ENST00000601319 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.4■■■□□ 2.46
HERC3-214ENST00000601319 SYNJ1O43426 1573 aa30.37■■■□□ 2.45
HERC3-214ENST00000601319 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.35■■■□□ 2.45
HERC3-214ENST00000601319 CHD1O14646 1710 aa30.34■■■□□ 2.45
HERC3-214ENST00000601319 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.31■■■□□ 2.44
HERC3-214ENST00000601319 PBRM1Q86U86 1689 aa30.3■■■□□ 2.44
HERC3-214ENST00000601319 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.29■■■□□ 2.44
HERC3-214ENST00000601319 OSCARQ8IYS5 282 aa30.29■■■□□ 2.44
HERC3-214ENST00000601319 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
HERC3-214ENST00000601319 GRIN2BQ13224 1484 aa30.22■■■□□ 2.43
HERC3-214ENST00000601319 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.21■■■□□ 2.43
HERC3-214ENST00000601319 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.19■■■□□ 2.42
HERC3-214ENST00000601319 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.18■■■□□ 2.42
HERC3-214ENST00000601319 SYNJ2O15056 1496 aa30.06■■■□□ 2.4
HERC3-214ENST00000601319 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.02■■■□□ 2.4
HERC3-214ENST00000601319 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.02■■■□□ 2.4
HERC3-214ENST00000601319 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.02■■■□□ 2.4
HERC3-214ENST00000601319 ADAMTS12P58397 1594 aa29.99■■■□□ 2.39
HERC3-214ENST00000601319 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.97■■■□□ 2.39
HERC3-214ENST00000601319 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.97■■■□□ 2.39
HERC3-214ENST00000601319 FBLN2P98095 1184 aa29.96■■■□□ 2.39
HERC3-214ENST00000601319 ARHGEF11O15085 1522 aa29.96■■■□□ 2.39
HERC3-214ENST00000601319 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
HERC3-214ENST00000601319 GRIN2AQ12879 1464 aa29.85■■■□□ 2.37
HERC3-214ENST00000601319 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.83■■■□□ 2.37
HERC3-214ENST00000601319 CEP170Q5SW79 1584 aa29.74■■■□□ 2.35
HERC3-214ENST00000601319 CUL7Q14999 1698 aa29.73■■■□□ 2.35
HERC3-214ENST00000601319 NUP160Q12769 1436 aa29.73■■■□□ 2.35
HERC3-214ENST00000601319 KIF27Q86VH2 1401 aa29.72■■■□□ 2.35
HERC3-214ENST00000601319 TRIM41Q8WV44 630 aa29.71■■■□□ 2.35
HERC3-214ENST00000601319 ARAP1Q96P48 1450 aa29.68■■■□□ 2.34
HERC3-214ENST00000601319 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
HERC3-214ENST00000601319 SHROOM2Q13796 1616 aa29.64■■■□□ 2.34
HERC3-214ENST00000601319 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.58■■■□□ 2.33
HERC3-214ENST00000601319 IGF1RP08069 1367 aa29.57■■■□□ 2.32
HERC3-214ENST00000601319 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.48■■■□□ 2.31
HERC3-214ENST00000601319 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.46■■■□□ 2.31
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