RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601006.1

FSD1-208, Transcript of fibronectin type III and SPRY domain containing 1, human

TSL 3

Gene FSD1, Length 254 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FSD1-208	ENST00000601006	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		60.38	■■■■■ 7.26
FSD1-208	ENST00000601006	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		53.96	■■■■■ 6.23
FSD1-208	ENST00000601006	ABCC9	O60706	1549 aa		53.46	■■■■■ 6.15
FSD1-208	ENST00000601006	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		51.12	■■■■■ 5.77
FSD1-208	ENST00000601006	NACAD	O15069	1562 aa		50.9	■■■■■ 5.74
FSD1-208	ENST00000601006	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		50.77	■■■■■ 5.72
FSD1-208	ENST00000601006	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		50.38	■■■■■ 5.66
FSD1-208	ENST00000601006	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	50.14	■■■■■ 5.62
FSD1-208	ENST00000601006	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.97	■■■■■ 5.59
FSD1-208	ENST00000601006	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.92	■■■■■ 5.58
FSD1-208	ENST00000601006	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.87	■■■■■ 5.57
FSD1-208	ENST00000601006	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		49.73	■■■■■ 5.55
FSD1-208	ENST00000601006	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		49.62	■■■■■ 5.53
FSD1-208	ENST00000601006	SCRIB	Q14160	1630 aa		49.17	■■■■■ 5.46
FSD1-208	ENST00000601006	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.99	■■■■■ 5.43
FSD1-208	ENST00000601006	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	48.34	■■■■■ 5.33
FSD1-208	ENST00000601006	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		48.32	■■■■■ 5.33
FSD1-208	ENST00000601006	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		48.1	■■■■■ 5.29
FSD1-208	ENST00000601006	NCAPD3	P42695	1498 aa		47	■■■■■ 5.11
FSD1-208	ENST00000601006	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.98	■■■■■ 5.11
FSD1-208	ENST00000601006	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		46.91	■■■■■ 5.1
FSD1-208	ENST00000601006	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	46.83	■■■■■ 5.09
FSD1-208	ENST00000601006	SMARCA2	P51531	1590 aa		46.81	■■■■■ 5.08
FSD1-208	ENST00000601006	HMGXB3	Q12766	1538 aa		46.67	■■■■■ 5.06
FSD1-208	ENST00000601006	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		46.54	■■■■■ 5.04
FSD1-208	ENST00000601006	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		46.53	■■■■■ 5.04
FSD1-208	ENST00000601006	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	46.48	■■■■■ 5.03
FSD1-208	ENST00000601006	ERCC6	Q03468	1493 aa		46.12	■■■■■ 4.97
FSD1-208	ENST00000601006	NES	P48681	1621 aa		46.06	■■■■■ 4.96
FSD1-208	ENST00000601006	WIZ	O95785	1651 aa		45.99	■■■■■ 4.95
FSD1-208	ENST00000601006	CUX2	O14529	1486 aa		45.87	■■■■■ 4.93
FSD1-208	ENST00000601006	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.84	■■■■■ 4.93
FSD1-208	ENST00000601006	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	45.77	■■■■■ 4.92
FSD1-208	ENST00000601006	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		45.59	■■■■■ 4.89
FSD1-208	ENST00000601006	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		45.57	■■■■■ 4.89
FSD1-208	ENST00000601006	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		45.49	■■■■■ 4.87
FSD1-208	ENST00000601006	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	45.49	■■■■■ 4.87
FSD1-208	ENST00000601006	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	45.44	■■■■■ 4.86
FSD1-208	ENST00000601006	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		45.31	■■■■■ 4.84
FSD1-208	ENST00000601006	CFTR	P13569	1480 aa		45.17	■■■■■ 4.82
FSD1-208	ENST00000601006	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		45.13	■■■■■ 4.82
FSD1-208	ENST00000601006	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		45.05	■■■■■ 4.8
FSD1-208	ENST00000601006	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		45.05	■■■■■ 4.8
FSD1-208	ENST00000601006	WDR62	O43379	1518 aa		45	■■■■■ 4.79
FSD1-208	ENST00000601006	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.94	■■■■■ 4.78
FSD1-208	ENST00000601006	PRDM2	Q13029	1718 aa		44.75	■■■■■ 4.75
FSD1-208	ENST00000601006	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	44.65	■■■■■ 4.74
FSD1-208	ENST00000601006	TOPBP1	Q92547	1522 aa		44.26	■■■■■ 4.68
FSD1-208	ENST00000601006	ABCC8	Q09428	1581 aa		44.23	■■■■■ 4.67
FSD1-208	ENST00000601006	IFT140	Q96RY7	1462 aa		44.15	■■■■■ 4.66
FSD1-208	ENST00000601006	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		44.14	■■■■■ 4.66
FSD1-208	ENST00000601006	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	44.12	■■■■■ 4.65
FSD1-208	ENST00000601006	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	44.01	■■■■■ 4.64
FSD1-208	ENST00000601006	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.9	■■■■■ 4.62
FSD1-208	ENST00000601006	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.83	■■■■■ 4.61
FSD1-208	ENST00000601006	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43.83	■■■■■ 4.61
FSD1-208	ENST00000601006	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.78	■■■■■ 4.6
FSD1-208	ENST00000601006	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	43.7	■■■■■ 4.59
FSD1-208	ENST00000601006	CUX1	P39880	1505 aa		43.68	■■■■■ 4.58
FSD1-208	ENST00000601006	SOGA1	O94964	1423 aa		43.67	■■■■■ 4.58
FSD1-208	ENST00000601006	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		43.67	■■■■■ 4.58
FSD1-208	ENST00000601006	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		43.64	■■■■■ 4.58
FSD1-208	ENST00000601006	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	43.51	■■■■■ 4.56
FSD1-208	ENST00000601006	TRIM41	Q8WV44	630 aa		43.5	■■■■■ 4.55
FSD1-208	ENST00000601006	WDR97	A6NE52	1622 aa		43.42	■■■■■ 4.54
FSD1-208	ENST00000601006	CHD1	O14646	1710 aa		43.37	■■■■■ 4.53
FSD1-208	ENST00000601006	FBLN2	P98095	1184 aa		43.31	■■■■■ 4.52
FSD1-208	ENST00000601006	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		43.25	■■■■■ 4.51
FSD1-208	ENST00000601006	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		43.23	■■■■■ 4.51
FSD1-208	ENST00000601006	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		43.23	■■■■■ 4.51
FSD1-208	ENST00000601006	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		43.23	■■■■■ 4.51
FSD1-208	ENST00000601006	GRIN2B	Q13224	1484 aa		43.22	■■■■■ 4.51
FSD1-208	ENST00000601006	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		43.18	■■■■■ 4.5
FSD1-208	ENST00000601006	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	43.17	■■■■■ 4.5
FSD1-208	ENST00000601006	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	43.15	■■■■■ 4.5
FSD1-208	ENST00000601006	ARHGEF11	O15085	1522 aa		43.15	■■■■■ 4.5
FSD1-208	ENST00000601006	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		43.14	■■■■■ 4.5
FSD1-208	ENST00000601006	TOP2B	Q02880	1626 aa		43.12	■■■■■ 4.49
FSD1-208	ENST00000601006	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		43.12	■■■■■ 4.49
FSD1-208	ENST00000601006	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	43.09	■■■■■ 4.49
FSD1-208	ENST00000601006	PBRM1	Q86U86	1689 aa		43.07	■■■■■ 4.49
FSD1-208	ENST00000601006	SYNJ1	O43426	1573 aa		43.07	■■■■■ 4.48
FSD1-208	ENST00000601006	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		43.05	■■■■■ 4.48
FSD1-208	ENST00000601006	SYNJ2	O15056	1496 aa		43.02	■■■■■ 4.48
FSD1-208	ENST00000601006	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.89	■■■■■ 4.46
FSD1-208	ENST00000601006	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.83	■■■■■ 4.45
FSD1-208	ENST00000601006	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.76	■■■■■ 4.44
FSD1-208	ENST00000601006	ADAMTS12	P58397	1594 aa		42.69	■■■■■ 4.42
FSD1-208	ENST00000601006	GRIN2A	Q12879	1464 aa		42.67	■■■■■ 4.42
FSD1-208	ENST00000601006	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		42.65	■■■■■ 4.42
FSD1-208	ENST00000601006	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		42.62	■■■■■ 4.41
FSD1-208	ENST00000601006	NUP160	Q12769	1436 aa		42.51	■■■■■ 4.4
FSD1-208	ENST00000601006	CEP170	Q5SW79	1584 aa		42.48	■■■■■ 4.39
FSD1-208	ENST00000601006	KIF27	Q86VH2	1401 aa		42.31	■■■■■ 4.36
FSD1-208	ENST00000601006	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		42.26	■■■■■ 4.36
FSD1-208	ENST00000601006	SHROOM2	Q13796	1616 aa		42.25	■■■■■ 4.35
FSD1-208	ENST00000601006	IGF1R	P08069	1367 aa		42.25	■■■■■ 4.35
FSD1-208	ENST00000601006	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	42.19	■■■■■ 4.34
FSD1-208	ENST00000601006	CUL7	Q14999	1698 aa		42.12	■■■■■ 4.33
FSD1-208	ENST00000601006	JPH4	Q96JJ6	628 aa		42.11	■■■■■ 4.33

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