RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600748.5

TIMM44-212, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMM44, Length 768 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-212ENST00000600748 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.74■■■□□ 2.99
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TIMM44-212ENST00000600748 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.15■■■□□ 2.26
TIMM44-212ENST00000600748 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.15■■■□□ 2.26
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TIMM44-212ENST00000600748 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
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TIMM44-212ENST00000600748 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.47■■■□□ 2.15
TIMM44-212ENST00000600748 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.38■■■□□ 2.13
TIMM44-212ENST00000600748 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.35■■■□□ 2.13
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TIMM44-212ENST00000600748 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.8■■■□□ 2.04
TIMM44-212ENST00000600748 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.76■■■□□ 2.04
TIMM44-212ENST00000600748 SCRIBQ14160 1630 aa27.72■■■□□ 2.03
TIMM44-212ENST00000600748 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
TIMM44-212ENST00000600748 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.03■■□□□ 1.92
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TIMM44-212ENST00000600748 ERCC6Q03468 1493 aa26.59■■□□□ 1.85
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TIMM44-212ENST00000600748 HMGXB3Q12766 1538 aa26.45■■□□□ 1.83
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TIMM44-212ENST00000600748 SMARCA4P51532 1647 aa26.42■■□□□ 1.82
TIMM44-212ENST00000600748 NESP48681 1621 aa26.34■■□□□ 1.81
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TIMM44-212ENST00000600748 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
TIMM44-212ENST00000600748 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.19■■□□□ 1.78
TIMM44-212ENST00000600748 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.12■■□□□ 1.77
TIMM44-212ENST00000600748 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.01■■□□□ 1.75
TIMM44-212ENST00000600748 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.99■■□□□ 1.75
TIMM44-212ENST00000600748 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.94■■□□□ 1.74
TIMM44-212ENST00000600748 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.79■■□□□ 1.72
TIMM44-212ENST00000600748 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.78■■□□□ 1.72
TIMM44-212ENST00000600748 WDR62O43379 1518 aa25.75■■□□□ 1.71
TIMM44-212ENST00000600748 TRIM41Q8WV44 630 aa25.66■■□□□ 1.7
TIMM44-212ENST00000600748 WIZO95785 1651 aa25.66■■□□□ 1.7
TIMM44-212ENST00000600748 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.6■■□□□ 1.69
TIMM44-212ENST00000600748 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.52■■□□□ 1.68
TIMM44-212ENST00000600748 CFTRP13569 1480 aa25.45■■□□□ 1.66
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TIMM44-212ENST00000600748 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
TIMM44-212ENST00000600748 OSCARQ8IYS5 282 aa25.32■■□□□ 1.64
TIMM44-212ENST00000600748 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
TIMM44-212ENST00000600748 PRDM2Q13029 1718 aa25.2■■□□□ 1.62
TIMM44-212ENST00000600748 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.13■■□□□ 1.61
TIMM44-212ENST00000600748 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.13■■□□□ 1.61
TIMM44-212ENST00000600748 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.13■■□□□ 1.61
TIMM44-212ENST00000600748 IFT140Q96RY7 1462 aa25.09■■□□□ 1.61
TIMM44-212ENST00000600748 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
TIMM44-212ENST00000600748 ARHGEF11O15085 1522 aa25.02■■□□□ 1.6
TIMM44-212ENST00000600748 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMM44-212ENST00000600748 TOPBP1Q92547 1522 aa25.01■■□□□ 1.59
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TIMM44-212ENST00000600748 ABCC8Q09428 1581 aa24.9■■□□□ 1.58
TIMM44-212ENST00000600748 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.9■■□□□ 1.58
TIMM44-212ENST00000600748 CHD1O14646 1710 aa24.83■■□□□ 1.57
TIMM44-212ENST00000600748 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TIMM44-212ENST00000600748 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.561e-8■■■■□ 24.7
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TIMM44-212ENST00000600748 ARAP1Q96P48 1450 aa24.75■■□□□ 1.55
TIMM44-212ENST00000600748 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TIMM44-212ENST00000600748 FBLN2P98095 1184 aa24.62■■□□□ 1.53
TIMM44-212ENST00000600748 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.62■■□□□ 1.53
TIMM44-212ENST00000600748 WDR97A6NE52 1622 aa24.57■■□□□ 1.52
TIMM44-212ENST00000600748 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
TIMM44-212ENST00000600748 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.56■■□□□ 1.52
TIMM44-212ENST00000600748 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
TIMM44-212ENST00000600748 SOGA1O94964 1423 aa24.56■■□□□ 1.52
TIMM44-212ENST00000600748 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.56■■□□□ 1.52
TIMM44-212ENST00000600748 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.52■■□□□ 1.52
TIMM44-212ENST00000600748 SYNJ1O43426 1573 aa24.48■■□□□ 1.51
TIMM44-212ENST00000600748 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TIMM44-212ENST00000600748 CUX1P39880 1505 aa24.45■■□□□ 1.51
TIMM44-212ENST00000600748 GRIN2BQ13224 1484 aa24.43■■□□□ 1.5
TIMM44-212ENST00000600748 SYNJ2O15056 1496 aa24.4■■□□□ 1.5
TIMM44-212ENST00000600748 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TIMM44-212ENST00000600748 PBRM1Q86U86 1689 aa24.34■■□□□ 1.49
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TIMM44-212ENST00000600748 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.26■■□□□ 1.47
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TIMM44-212ENST00000600748 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.13■■□□□ 1.45
TIMM44-212ENST00000600748 GRIN2AQ12879 1464 aa24.13■■□□□ 1.45
TIMM44-212ENST00000600748 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TIMM44-212ENST00000600748 ADAMTS12P58397 1594 aa24.11■■□□□ 1.45
TIMM44-212ENST00000600748 CEP170Q5SW79 1584 aa24.08■■□□□ 1.44
TIMM44-212ENST00000600748 NUP160Q12769 1436 aa24.07■■□□□ 1.44
TIMM44-212ENST00000600748 SHROOM2Q13796 1616 aa24.02■■□□□ 1.44
TIMM44-212ENST00000600748 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
TIMM44-212ENST00000600748 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.99■■□□□ 1.43
TIMM44-212ENST00000600748 TOP2BQ02880 1626 aa23.97■■□□□ 1.43
TIMM44-212ENST00000600748 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.96■■□□□ 1.43
TIMM44-212ENST00000600748 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.92■■□□□ 1.42
TIMM44-212ENST00000600748 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.88■■□□□ 1.41
TIMM44-212ENST00000600748 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
TIMM44-212ENST00000600748 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
TIMM44-212ENST00000600748 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.79■■□□□ 1.4
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