RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600058.5

FCHO1-230, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 2

Gene FCHO1, Length 910 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-230ENST00000600058 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.05■■■■■ 4.48
FCHO1-230ENST00000600058 ABCC9O60706 1549 aa39.15■■■■□ 3.86
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.85■■■■□ 3.81
FCHO1-230ENST00000600058 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.14■■■■□ 3.54
FCHO1-230ENST00000600058 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.06■■■■□ 3.52
FCHO1-230ENST00000600058 NACADO15069 1562 aa36.79■■■■□ 3.48
FCHO1-230ENST00000600058 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.41■■■■□ 3.42
FCHO1-230ENST00000600058 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.36■■■■□ 3.41
FCHO1-230ENST00000600058 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.33■■■■□ 3.41
FCHO1-230ENST00000600058 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.18■■■■□ 3.38
FCHO1-230ENST00000600058 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.08■■■■□ 3.37
FCHO1-230ENST00000600058 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
FCHO1-230ENST00000600058 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.59■■■■□ 3.29
FCHO1-230ENST00000600058 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.57■■■■□ 3.28
FCHO1-230ENST00000600058 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa35.38■■■■□ 3.25
FCHO1-230ENST00000600058 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.33■■■■□ 3.25
FCHO1-230ENST00000600058 SCRIBQ14160 1630 aa35.32■■■■□ 3.24
FCHO1-230ENST00000600058 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
FCHO1-230ENST00000600058 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.36■■■■□ 3.09
FCHO1-230ENST00000600058 NCAPD3P42695 1498 aa33.96■■■■□ 3.03
FCHO1-230ENST00000600058 CUX2O14529 1486 aa33.95■■■■□ 3.03
FCHO1-230ENST00000600058 ERCC6Q03468 1493 aa33.84■■■■□ 3.01
FCHO1-230ENST00000600058 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.79■■■■□ 3
FCHO1-230ENST00000600058 SMARCA2P51531 1590 aa33.7■■■□□ 2.99
FCHO1-230ENST00000600058 HMGXB3Q12766 1538 aa33.69■■■□□ 2.98
FCHO1-230ENST00000600058 SMARCA4P51532 1647 aa33.68■■■□□ 2.98
FCHO1-230ENST00000600058 NESP48681 1621 aa33.53■■■□□ 2.96
FCHO1-230ENST00000600058 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
FCHO1-230ENST00000600058 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.44■■■□□ 2.94
FCHO1-230ENST00000600058 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.38■■■□□ 2.93
FCHO1-230ENST00000600058 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP33.31■■■□□ 2.92
FCHO1-230ENST00000600058 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.27■■■□□ 2.92
FCHO1-230ENST00000600058 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.15■■■□□ 2.9
FCHO1-230ENST00000600058 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.13■■■□□ 2.89
FCHO1-230ENST00000600058 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.07■■■□□ 2.88
FCHO1-230ENST00000600058 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.89■■■□□ 2.86
FCHO1-230ENST00000600058 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.81■■■□□ 2.84
FCHO1-230ENST00000600058 WDR62O43379 1518 aa32.77■■■□□ 2.84
FCHO1-230ENST00000600058 WIZO95785 1651 aa32.74■■■□□ 2.83
FCHO1-230ENST00000600058 TRIM41Q8WV44 630 aa32.64■■■□□ 2.82
FCHO1-230ENST00000600058 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.61■■■□□ 2.81
FCHO1-230ENST00000600058 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.52■■■□□ 2.8
FCHO1-230ENST00000600058 CFTRP13569 1480 aa32.45■■■□□ 2.79
FCHO1-230ENST00000600058 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
FCHO1-230ENST00000600058 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
FCHO1-230ENST00000600058 OSCARQ8IYS5 282 aa32.3■■■□□ 2.76
FCHO1-230ENST00000600058 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
FCHO1-230ENST00000600058 PRDM2Q13029 1718 aa32.15■■■□□ 2.74
FCHO1-230ENST00000600058 IFT140Q96RY7 1462 aa31.97■■■□□ 2.71
FCHO1-230ENST00000600058 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.96■■■□□ 2.71
FCHO1-230ENST00000600058 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.96■■■□□ 2.71
FCHO1-230ENST00000600058 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.96■■■□□ 2.71
FCHO1-230ENST00000600058 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.94■■■□□ 2.7
FCHO1-230ENST00000600058 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.92■■■□□ 2.7
FCHO1-230ENST00000600058 TOPBP1Q92547 1522 aa31.87■■■□□ 2.69
FCHO1-230ENST00000600058 ARHGEF11O15085 1522 aa31.8■■■□□ 2.68
FCHO1-230ENST00000600058 ABCC8Q09428 1581 aa31.79■■■□□ 2.68
FCHO1-230ENST00000600058 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
FCHO1-230ENST00000600058 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.73■■■□□ 2.67
FCHO1-230ENST00000600058 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
FCHO1-230ENST00000600058 CHD1O14646 1710 aa31.63■■■□□ 2.65
FCHO1-230ENST00000600058 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.59■■■□□ 2.651e-6■■□□□ 13
FCHO1-230ENST00000600058 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.55■■■□□ 2.64
FCHO1-230ENST00000600058 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
FCHO1-230ENST00000600058 ARAP1Q96P48 1450 aa31.46■■■□□ 2.63
FCHO1-230ENST00000600058 FBLN2P98095 1184 aa31.43■■■□□ 2.62
FCHO1-230ENST00000600058 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.39■■■□□ 2.62
FCHO1-230ENST00000600058 SOGA1O94964 1423 aa31.34■■■□□ 2.61
FCHO1-230ENST00000600058 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
FCHO1-230ENST00000600058 WDR97A6NE52 1622 aa31.31■■■□□ 2.6
FCHO1-230ENST00000600058 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
FCHO1-230ENST00000600058 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.27■■■□□ 2.6
FCHO1-230ENST00000600058 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.26■■■□□ 2.59
FCHO1-230ENST00000600058 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.24■■■□□ 2.59
FCHO1-230ENST00000600058 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
FCHO1-230ENST00000600058 SYNJ1O43426 1573 aa31.19■■■□□ 2.58
FCHO1-230ENST00000600058 CUX1P39880 1505 aa31.17■■■□□ 2.58
FCHO1-230ENST00000600058 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
FCHO1-230ENST00000600058 GRIN2BQ13224 1484 aa31.14■■■□□ 2.58
FCHO1-230ENST00000600058 SYNJ2O15056 1496 aa31.09■■■□□ 2.57
FCHO1-230ENST00000600058 PBRM1Q86U86 1689 aa31.02■■■□□ 2.56
FCHO1-230ENST00000600058 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.97■■■□□ 2.55
FCHO1-230ENST00000600058 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.9■■■□□ 2.54
FCHO1-230ENST00000600058 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.89■■■□□ 2.54
FCHO1-230ENST00000600058 GRIN2AQ12879 1464 aa30.75■■■□□ 2.51
FCHO1-230ENST00000600058 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.71■■■□□ 2.51
FCHO1-230ENST00000600058 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.51
FCHO1-230ENST00000600058 ADAMTS12P58397 1594 aa30.69■■■□□ 2.5
FCHO1-230ENST00000600058 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.5
FCHO1-230ENST00000600058 NUP160Q12769 1436 aa30.66■■■□□ 2.5
FCHO1-230ENST00000600058 CEP170Q5SW79 1584 aa30.66■■■□□ 2.5
FCHO1-230ENST00000600058 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.61■■■□□ 2.49
FCHO1-230ENST00000600058 TOP2BQ02880 1626 aa30.59■■■□□ 2.49
FCHO1-230ENST00000600058 SHROOM2Q13796 1616 aa30.59■■■□□ 2.49
FCHO1-230ENST00000600058 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.57■■■□□ 2.48
FCHO1-230ENST00000600058 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
FCHO1-230ENST00000600058 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.51■■■□□ 2.47
FCHO1-230ENST00000600058 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.41■■■□□ 2.46
FCHO1-230ENST00000600058 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
FCHO1-230ENST00000600058 JPH4Q96JJ6 628 aa30.31■■■□□ 2.44
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