RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600000.1

TIMM44-211, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

TSL 2

Gene TIMM44, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-211ENST00000600000 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.25■■■■■ 4.99
TIMM44-211ENST00000600000 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.46■■■■■ 4.23
TIMM44-211ENST00000600000 ABCC9O60706 1549 aa41.13■■■■■ 4.18
TIMM44-211ENST00000600000 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.27■■■■□ 3.88
TIMM44-211ENST00000600000 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.03■■■■□ 3.84
TIMM44-211ENST00000600000 NACADO15069 1562 aa39.02■■■■□ 3.84
TIMM44-211ENST00000600000 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.55■■■■□ 3.76
TIMM44-211ENST00000600000 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.46■■■■□ 3.75
TIMM44-211ENST00000600000 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
TIMM44-211ENST00000600000 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.3■■■■□ 3.72
TIMM44-211ENST00000600000 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.13■■■■□ 3.69
TIMM44-211ENST00000600000 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.11■■■■□ 3.69
TIMM44-211ENST00000600000 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.07■■■■□ 3.69
TIMM44-211ENST00000600000 SCRIBQ14160 1630 aa37.9■■■■□ 3.66
TIMM44-211ENST00000600000 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.49■■■■□ 3.59
TIMM44-211ENST00000600000 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.18■■■■□ 3.54
TIMM44-211ENST00000600000 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
TIMM44-211ENST00000600000 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.96■■■■□ 3.51
TIMM44-211ENST00000600000 SMARCA4P51532 1647 aa36.1■■■■□ 3.37
TIMM44-211ENST00000600000 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.93■■■■□ 3.34
TIMM44-211ENST00000600000 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
TIMM44-211ENST00000600000 NCAPD3P42695 1498 aa35.92■■■■□ 3.34
TIMM44-211ENST00000600000 SMARCA2P51531 1590 aa35.91■■■■□ 3.34
TIMM44-211ENST00000600000 HMGXB3Q12766 1538 aa35.79■■■■□ 3.32
TIMM44-211ENST00000600000 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
TIMM44-211ENST00000600000 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.69■■■■□ 3.3
TIMM44-211ENST00000600000 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.61■■■■□ 3.29
TIMM44-211ENST00000600000 ERCC6Q03468 1493 aa35.52■■■■□ 3.28
TIMM44-211ENST00000600000 NESP48681 1621 aa35.42■■■■□ 3.26
TIMM44-211ENST00000600000 WIZO95785 1651 aa35.38■■■■□ 3.25
TIMM44-211ENST00000600000 CUX2O14529 1486 aa35.21■■■■□ 3.23
TIMM44-211ENST00000600000 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.19■■■■□ 3.22
TIMM44-211ENST00000600000 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.11■■■■□ 3.21
TIMM44-211ENST00000600000 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
TIMM44-211ENST00000600000 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35■■■■□ 3.19
TIMM44-211ENST00000600000 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.92■■■■□ 3.18
TIMM44-211ENST00000600000 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.88■■■■□ 3.17
TIMM44-211ENST00000600000 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.87■■■■□ 3.17
TIMM44-211ENST00000600000 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.71■■■■□ 3.15
TIMM44-211ENST00000600000 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.65■■■■□ 3.14
TIMM44-211ENST00000600000 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.62■■■■□ 3.13
TIMM44-211ENST00000600000 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.58■■■■□ 3.13
TIMM44-211ENST00000600000 CFTRP13569 1480 aa34.56■■■■□ 3.12
TIMM44-211ENST00000600000 WDR62O43379 1518 aa34.55■■■■□ 3.12
TIMM44-211ENST00000600000 PRDM2Q13029 1718 aa34.53■■■■□ 3.12
TIMM44-211ENST00000600000 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.43■■■■□ 3.1
TIMM44-211ENST00000600000 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
TIMM44-211ENST00000600000 TOPBP1Q92547 1522 aa33.97■■■■□ 3.03
TIMM44-211ENST00000600000 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.9■■■■□ 3.02
TIMM44-211ENST00000600000 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.87■■■■□ 3.01
TIMM44-211ENST00000600000 ABCC8Q09428 1581 aa33.85■■■■□ 3.01
TIMM44-211ENST00000600000 IFT140Q96RY7 1462 aa33.85■■■■□ 3.01
TIMM44-211ENST00000600000 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
TIMM44-211ENST00000600000 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
TIMM44-211ENST00000600000 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
TIMM44-211ENST00000600000 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
TIMM44-211ENST00000600000 OSCARQ8IYS5 282 aa33.63■■■□□ 2.97
TIMM44-211ENST00000600000 TRIM41Q8WV44 630 aa33.56■■■□□ 2.96
TIMM44-211ENST00000600000 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.54■■■□□ 2.96
TIMM44-211ENST00000600000 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.53■■■□□ 2.962e-8■■■□□ 17.4
TIMM44-211ENST00000600000 CUX1P39880 1505 aa33.53■■■□□ 2.96
TIMM44-211ENST00000600000 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.51■■■□□ 2.96
TIMM44-211ENST00000600000 CHD1O14646 1710 aa33.5■■■□□ 2.95
TIMM44-211ENST00000600000 SOGA1O94964 1423 aa33.46■■■□□ 2.95
TIMM44-211ENST00000600000 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
TIMM44-211ENST00000600000 FBLN2P98095 1184 aa33.33■■■□□ 2.93
TIMM44-211ENST00000600000 WDR97A6NE52 1622 aa33.32■■■□□ 2.92
TIMM44-211ENST00000600000 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.31■■■□□ 2.92
TIMM44-211ENST00000600000 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.31■■■□□ 2.92
TIMM44-211ENST00000600000 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.31■■■□□ 2.92
TIMM44-211ENST00000600000 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.25■■■□□ 2.91
TIMM44-211ENST00000600000 PBRM1Q86U86 1689 aa33.24■■■□□ 2.91
TIMM44-211ENST00000600000 ARHGEF11O15085 1522 aa33.18■■■□□ 2.9
TIMM44-211ENST00000600000 GRIN2BQ13224 1484 aa33.14■■■□□ 2.9
TIMM44-211ENST00000600000 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.13■■■□□ 2.89
TIMM44-211ENST00000600000 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
TIMM44-211ENST00000600000 SYNJ1O43426 1573 aa33.1■■■□□ 2.89
TIMM44-211ENST00000600000 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.1■■■□□ 2.89
TIMM44-211ENST00000600000 TOP2BQ02880 1626 aa33.09■■■□□ 2.89
TIMM44-211ENST00000600000 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.09■■■□□ 2.89
TIMM44-211ENST00000600000 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.07■■■□□ 2.89
TIMM44-211ENST00000600000 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.07■■■□□ 2.88
TIMM44-211ENST00000600000 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.05■■■□□ 2.88
TIMM44-211ENST00000600000 SYNJ2O15056 1496 aa32.99■■■□□ 2.87
TIMM44-211ENST00000600000 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.93■■■□□ 2.86
TIMM44-211ENST00000600000 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.89■■■□□ 2.86
TIMM44-211ENST00000600000 ARAP1Q96P48 1450 aa32.86■■■□□ 2.85
TIMM44-211ENST00000600000 ADAMTS12P58397 1594 aa32.84■■■□□ 2.85
TIMM44-211ENST00000600000 GRIN2AQ12879 1464 aa32.74■■■□□ 2.83
TIMM44-211ENST00000600000 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.69■■■□□ 2.82
TIMM44-211ENST00000600000 CEP170Q5SW79 1584 aa32.66■■■□□ 2.82
TIMM44-211ENST00000600000 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.65■■■□□ 2.82
TIMM44-211ENST00000600000 NUP160Q12769 1436 aa32.55■■■□□ 2.8
TIMM44-211ENST00000600000 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.52■■■□□ 2.8
TIMM44-211ENST00000600000 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.49■■■□□ 2.79
TIMM44-211ENST00000600000 SHROOM2Q13796 1616 aa32.44■■■□□ 2.78
TIMM44-211ENST00000600000 KIF27Q86VH2 1401 aa32.41■■■□□ 2.78
TIMM44-211ENST00000600000 CUL7Q14999 1698 aa32.39■■■□□ 2.78
TIMM44-211ENST00000600000 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.37■■■□□ 2.77
TIMM44-211ENST00000600000 IGF1RP08069 1367 aa32.27■■■□□ 2.76
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