RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599733.5

TIMM50-212, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM50, Length 669 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-212ENST00000599733 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.35■■■■□ 3.09
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TIMM50-212ENST00000599733 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.56■■■□□ 2.32
TIMM50-212ENST00000599733 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.48■■■□□ 2.31
TIMM50-212ENST00000599733 NACADO15069 1562 aa29.31■■■□□ 2.28
TIMM50-212ENST00000599733 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.08■■■□□ 2.25
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TIMM50-212ENST00000599733 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.87■■■□□ 2.21
TIMM50-212ENST00000599733 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.86■■■□□ 2.21
TIMM50-212ENST00000599733 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.82■■■□□ 2.2
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TIMM50-212ENST00000599733 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.4■■■□□ 2.14
TIMM50-212ENST00000599733 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.33■■■□□ 2.13
TIMM50-212ENST00000599733 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.18■■■□□ 2.1
TIMM50-212ENST00000599733 SCRIBQ14160 1630 aa28.15■■■□□ 2.1
TIMM50-212ENST00000599733 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.08■■■□□ 2.09
TIMM50-212ENST00000599733 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TIMM50-212ENST00000599733 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.22■■□□□ 1.95
TIMM50-212ENST00000599733 NCAPD3P42695 1498 aa27.06■■□□□ 1.92
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TIMM50-212ENST00000599733 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.93■■□□□ 1.9
TIMM50-212ENST00000599733 SMARCA4P51532 1647 aa26.88■■□□□ 1.89
TIMM50-212ENST00000599733 HMGXB3Q12766 1538 aa26.85■■□□□ 1.89
TIMM50-212ENST00000599733 ERCC6Q03468 1493 aa26.83■■□□□ 1.89
TIMM50-212ENST00000599733 SMARCA2P51531 1590 aa26.83■■□□□ 1.89
TIMM50-212ENST00000599733 NESP48681 1621 aa26.72■■□□□ 1.87
TIMM50-212ENST00000599733 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.67■■□□□ 1.86
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TIMM50-212ENST00000599733 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
TIMM50-212ENST00000599733 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.5■■□□□ 1.83
TIMM50-212ENST00000599733 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.47■■□□□ 1.83
TIMM50-212ENST00000599733 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.45■■□□□ 1.82
TIMM50-212ENST00000599733 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.26■■□□□ 1.79
TIMM50-212ENST00000599733 WIZO95785 1651 aa26.18■■□□□ 1.78
TIMM50-212ENST00000599733 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.17■■□□□ 1.78
TIMM50-212ENST00000599733 WDR62O43379 1518 aa26.11■■□□□ 1.77
TIMM50-212ENST00000599733 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.1■■□□□ 1.77
TIMM50-212ENST00000599733 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.92■■□□□ 1.74
TIMM50-212ENST00000599733 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.88■■□□□ 1.73
TIMM50-212ENST00000599733 CFTRP13569 1480 aa25.86■■□□□ 1.73
TIMM50-212ENST00000599733 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
TIMM50-212ENST00000599733 TRIM41Q8WV44 630 aa25.79■■□□□ 1.72
TIMM50-212ENST00000599733 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
TIMM50-212ENST00000599733 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TIMM50-212ENST00000599733 PRDM2Q13029 1718 aa25.73■■□□□ 1.71
TIMM50-212ENST00000599733 OSCARQ8IYS5 282 aa25.59■■□□□ 1.69
TIMM50-212ENST00000599733 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.47■■□□□ 1.67
TIMM50-212ENST00000599733 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
TIMM50-212ENST00000599733 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.44■■□□□ 1.66
TIMM50-212ENST00000599733 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.44■■□□□ 1.66
TIMM50-212ENST00000599733 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.44■■□□□ 1.66
TIMM50-212ENST00000599733 IFT140Q96RY7 1462 aa25.42■■□□□ 1.66
TIMM50-212ENST00000599733 TOPBP1Q92547 1522 aa25.39■■□□□ 1.66
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TIMM50-212ENST00000599733 ARHGEF11O15085 1522 aa25.29■■□□□ 1.64
TIMM50-212ENST00000599733 ABCC8Q09428 1581 aa25.29■■□□□ 1.64
TIMM50-212ENST00000599733 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TIMM50-212ENST00000599733 CHD1O14646 1710 aa25.24■■□□□ 1.63
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TIMM50-212ENST00000599733 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TIMM50-212ENST00000599733 ARAP1Q96P48 1450 aa25.02■■□□□ 1.6
TIMM50-212ENST00000599733 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMM50-212ENST00000599733 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25■■□□□ 1.59
TIMM50-212ENST00000599733 WDR97A6NE52 1622 aa24.97■■□□□ 1.59
TIMM50-212ENST00000599733 SOGA1O94964 1423 aa24.94■■□□□ 1.58
TIMM50-212ENST00000599733 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
TIMM50-212ENST00000599733 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.91■■□□□ 1.58
TIMM50-212ENST00000599733 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.91■■□□□ 1.58
TIMM50-212ENST00000599733 FBLN2P98095 1184 aa24.89■■□□□ 1.58
TIMM50-212ENST00000599733 CUX1P39880 1505 aa24.88■■□□□ 1.57
TIMM50-212ENST00000599733 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.88■■□□□ 1.57
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TIMM50-212ENST00000599733 SYNJ1O43426 1573 aa24.8■■□□□ 1.56
TIMM50-212ENST00000599733 PBRM1Q86U86 1689 aa24.78■■□□□ 1.56
TIMM50-212ENST00000599733 GRIN2BQ13224 1484 aa24.77■■□□□ 1.56
TIMM50-212ENST00000599733 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TIMM50-212ENST00000599733 SYNJ2O15056 1496 aa24.74■■□□□ 1.55
TIMM50-212ENST00000599733 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TIMM50-212ENST00000599733 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.68■■□□□ 1.54
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TIMM50-212ENST00000599733 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.62■■□□□ 1.53
TIMM50-212ENST00000599733 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.5■■□□□ 1.51
TIMM50-212ENST00000599733 ADAMTS12P58397 1594 aa24.48■■□□□ 1.51
TIMM50-212ENST00000599733 GRIN2AQ12879 1464 aa24.48■■□□□ 1.51
TIMM50-212ENST00000599733 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.48■■□□□ 1.51
TIMM50-212ENST00000599733 CEP170Q5SW79 1584 aa24.46■■□□□ 1.51
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TIMM50-212ENST00000599733 SHROOM2Q13796 1616 aa24.43■■□□□ 1.5
TIMM50-212ENST00000599733 NUP160Q12769 1436 aa24.43■■□□□ 1.5
TIMM50-212ENST00000599733 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
TIMM50-212ENST00000599733 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.32■■□□□ 1.48
TIMM50-212ENST00000599733 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.31■■□□□ 1.48
TIMM50-212ENST00000599733 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.29■■□□□ 1.48
TIMM50-212ENST00000599733 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
TIMM50-212ENST00000599733 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMM50-212ENST00000599733 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
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