RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598547.5

CPAMD8-213, Transcript of C3 and PZP like, alpha-2-macroglobulin domain containing 8, humanhuman

TSL 5

Gene CPAMD8, Length 944 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPAMD8-213ENST00000598547 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.29■■■■■ 5.64
CPAMD8-213ENST00000598547 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.92■■■■■ 4.78
CPAMD8-213ENST00000598547 ABCC9O60706 1549 aa44.62■■■■■ 4.73
CPAMD8-213ENST00000598547 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.61■■■■■ 4.41
CPAMD8-213ENST00000598547 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.53■■■■■ 4.4
CPAMD8-213ENST00000598547 NACADO15069 1562 aa42.38■■■■■ 4.37
CPAMD8-213ENST00000598547 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.84■■■■■ 4.29
CPAMD8-213ENST00000598547 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.75■■■■■ 4.27
CPAMD8-213ENST00000598547 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.67■■■■■ 4.26
CPAMD8-213ENST00000598547 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.65■■■■■ 4.26
CPAMD8-213ENST00000598547 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.49■■■■■ 4.23
CPAMD8-213ENST00000598547 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.42■■■■■ 4.22
CPAMD8-213ENST00000598547 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.28■■■■■ 4.2
CPAMD8-213ENST00000598547 SCRIBQ14160 1630 aa41.07■■■■■ 4.17
CPAMD8-213ENST00000598547 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.71■■■■■ 4.11
CPAMD8-213ENST00000598547 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.28■■■■■ 4.04
CPAMD8-213ENST00000598547 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
CPAMD8-213ENST00000598547 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.12■■■■■ 4.01
CPAMD8-213ENST00000598547 SMARCA4P51532 1647 aa39.16■■■■□ 3.86
CPAMD8-213ENST00000598547 NCAPD3P42695 1498 aa39.09■■■■□ 3.85
CPAMD8-213ENST00000598547 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.07■■■■□ 3.85
CPAMD8-213ENST00000598547 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
CPAMD8-213ENST00000598547 SMARCA2P51531 1590 aa39■■■■□ 3.83
CPAMD8-213ENST00000598547 HMGXB3Q12766 1538 aa38.84■■■■□ 3.81
CPAMD8-213ENST00000598547 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
CPAMD8-213ENST00000598547 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.78■■■■□ 3.8
CPAMD8-213ENST00000598547 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.69■■■■□ 3.78
CPAMD8-213ENST00000598547 ERCC6Q03468 1493 aa38.54■■■■□ 3.76
CPAMD8-213ENST00000598547 NESP48681 1621 aa38.43■■■■□ 3.74
CPAMD8-213ENST00000598547 WIZO95785 1651 aa38.38■■■■□ 3.73
CPAMD8-213ENST00000598547 CUX2O14529 1486 aa38.19■■■■□ 3.7
CPAMD8-213ENST00000598547 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.18■■■■□ 3.7
CPAMD8-213ENST00000598547 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.12■■■■□ 3.69
CPAMD8-213ENST00000598547 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.98■■■■□ 3.67
CPAMD8-213ENST00000598547 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.98■■■■□ 3.67
CPAMD8-213ENST00000598547 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.95■■■■□ 3.67
CPAMD8-213ENST00000598547 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
CPAMD8-213ENST00000598547 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
CPAMD8-213ENST00000598547 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.71■■■■□ 3.63
CPAMD8-213ENST00000598547 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.62■■■■□ 3.61
CPAMD8-213ENST00000598547 CFTRP13569 1480 aa37.6■■■■□ 3.61
CPAMD8-213ENST00000598547 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.58■■■■□ 3.61
CPAMD8-213ENST00000598547 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.58■■■■□ 3.61
CPAMD8-213ENST00000598547 WDR62O43379 1518 aa37.47■■■■□ 3.59
CPAMD8-213ENST00000598547 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.46■■■■□ 3.59
CPAMD8-213ENST00000598547 PRDM2Q13029 1718 aa37.31■■■■□ 3.56
CPAMD8-213ENST00000598547 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
CPAMD8-213ENST00000598547 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
CPAMD8-213ENST00000598547 TOPBP1Q92547 1522 aa36.9■■■■□ 3.5
CPAMD8-213ENST00000598547 ABCC8Q09428 1581 aa36.83■■■■□ 3.49
CPAMD8-213ENST00000598547 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.79■■■■□ 3.48
CPAMD8-213ENST00000598547 IFT140Q96RY7 1462 aa36.79■■■■□ 3.48
CPAMD8-213ENST00000598547 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
CPAMD8-213ENST00000598547 OSCARQ8IYS5 282 aa36.62■■■■□ 3.45
CPAMD8-213ENST00000598547 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.54■■■■□ 3.44
CPAMD8-213ENST00000598547 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
CPAMD8-213ENST00000598547 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
CPAMD8-213ENST00000598547 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.45■■■■□ 3.43
CPAMD8-213ENST00000598547 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.45■■■■□ 3.43
CPAMD8-213ENST00000598547 SOGA1O94964 1423 aa36.42■■■■□ 3.42
CPAMD8-213ENST00000598547 CUX1P39880 1505 aa36.41■■■■□ 3.42
CPAMD8-213ENST00000598547 TRIM41Q8WV44 630 aa36.41■■■■□ 3.42
CPAMD8-213ENST00000598547 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.4■■■■□ 3.42
CPAMD8-213ENST00000598547 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
CPAMD8-213ENST00000598547 FBLN2P98095 1184 aa36.26■■■■□ 3.4
CPAMD8-213ENST00000598547 CHD1O14646 1710 aa36.2■■■■□ 3.39
CPAMD8-213ENST00000598547 WDR97A6NE52 1622 aa36.12■■■■□ 3.37
CPAMD8-213ENST00000598547 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.09■■■■□ 3.37
CPAMD8-213ENST00000598547 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.05■■■■□ 3.36
CPAMD8-213ENST00000598547 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.05■■■■□ 3.36
CPAMD8-213ENST00000598547 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.05■■■■□ 3.36
CPAMD8-213ENST00000598547 GRIN2BQ13224 1484 aa36.03■■■■□ 3.36
CPAMD8-213ENST00000598547 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36■■■■□ 3.35
CPAMD8-213ENST00000598547 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
CPAMD8-213ENST00000598547 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.98■■■■□ 3.35
CPAMD8-213ENST00000598547 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
CPAMD8-213ENST00000598547 ARHGEF11O15085 1522 aa35.97■■■■□ 3.35
CPAMD8-213ENST00000598547 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.96■■■■□ 3.35
CPAMD8-213ENST00000598547 PBRM1Q86U86 1689 aa35.95■■■■□ 3.35
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CPAMD8-213ENST00000598547 SYNJ1O43426 1573 aa35.93■■■■□ 3.34
CPAMD8-213ENST00000598547 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.93■■■■□ 3.34
CPAMD8-213ENST00000598547 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.86■■■■□ 3.33
CPAMD8-213ENST00000598547 SYNJ2O15056 1496 aa35.85■■■■□ 3.33
CPAMD8-213ENST00000598547 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.78■■■■□ 3.32
CPAMD8-213ENST00000598547 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.71■■■■□ 3.31
CPAMD8-213ENST00000598547 ARAP1Q96P48 1450 aa35.63■■■■□ 3.29
CPAMD8-213ENST00000598547 ADAMTS12P58397 1594 aa35.59■■■■□ 3.29
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CPAMD8-213ENST00000598547 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.52■■■■□ 3.28
CPAMD8-213ENST00000598547 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.52■■■■□ 3.28
CPAMD8-213ENST00000598547 CEP170Q5SW79 1584 aa35.41■■■■□ 3.26
CPAMD8-213ENST00000598547 NUP160Q12769 1436 aa35.38■■■■□ 3.25
CPAMD8-213ENST00000598547 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
CPAMD8-213ENST00000598547 KIF27Q86VH2 1401 aa35.3■■■■□ 3.24
CPAMD8-213ENST00000598547 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.24■■■■□ 3.23
CPAMD8-213ENST00000598547 IGF1RP08069 1367 aa35.19■■■■□ 3.22
CPAMD8-213ENST00000598547 SHROOM2Q13796 1616 aa35.17■■■■□ 3.22
CPAMD8-213ENST00000598547 CUL7Q14999 1698 aa35.12■■■■□ 3.21
CPAMD8-213ENST00000598547 JPH4Q96JJ6 628 aa35.11■■■■□ 3.21
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