RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598280.5

PITRM1-AS1-202, PITRM1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PITRM1-AS1, Length 601 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 NISCHQ9Y2I1 1504 aa16.96■□□□□ 0.3
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.1■□□□□ 0.01
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ABCC9O60706 1549 aa14.84□□□□□ -0.03
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 DNAJC5BQ9UF47 199 aa14.31□□□□□ -0.12
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.23□□□□□ -0.13
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.2□□□□□ -0.14
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 NACADO15069 1562 aa14.18□□□□□ -0.14
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.05□□□□□ -0.16
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14□□□□□ -0.17
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.92□□□□□ -0.18
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 UNC13AQ9UPW8 1703 aa13.88□□□□□ -0.19
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SCRIBQ14160 1630 aa13.86□□□□□ -0.19
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.2
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.77□□□□□ -0.21
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa13.64□□□□□ -0.23
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.39□□□□□ -0.27
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CECR2Q9BXF3 1484 aa13.35□□□□□ -0.27
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SMARCA4P51532 1647 aa13.2□□□□□ -0.3
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CUX2O14529 1486 aa13.16□□□□□ -0.3
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.1□□□□□ -0.31
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CHIC1Q5VXU3 224 aa13.1□□□□□ -0.31
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SMARCA2P51531 1590 aa13.1□□□□□ -0.31
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.09□□□□□ -0.31
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 NCAPD3P42695 1498 aa13.05□□□□□ -0.32
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 HMGXB3Q12766 1538 aa13.05□□□□□ -0.32
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.03□□□□□ -0.32
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 WIZO95785 1651 aa12.96□□□□□ -0.34
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 NESP48681 1621 aa12.82□□□□□ -0.36
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ERCC6Q03468 1493 aa12.82□□□□□ -0.36
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 TRIM41Q8WV44 630 aa12.78□□□□□ -0.36
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.76□□□□□ -0.37
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.69□□□□□ -0.38
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.67□□□□□ -0.38
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.67□□□□□ -0.38
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.64□□□□□ -0.39
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CFTRP13569 1480 aa12.62□□□□□ -0.39
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.61□□□□□ -0.39
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.6□□□□□ -0.39
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.58□□□□□ -0.4
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 PRDM2Q13029 1718 aa12.55□□□□□ -0.4
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 WDR62O43379 1518 aa12.53□□□□□ -0.4
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 TOPBP1Q92547 1522 aa12.39□□□□□ -0.43
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.38□□□□□ -0.43
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ABCC8Q09428 1581 aa12.34□□□□□ -0.43
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 OSCARQ8IYS5 282 aa12.32□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 IFT140Q96RY7 1462 aa12.31□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CUX1P39880 1505 aa12.29□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.27□□□□□ -0.44
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.23□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.23□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.23□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.23□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SYNJ1O43426 1573 aa12.21□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SOGA1O94964 1423 aa12.2□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 TOP2BQ02880 1626 aa12.18□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.18□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 WDR97A6NE52 1622 aa12.16□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.12□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ARHGEF11O15085 1522 aa12.11□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.11□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.11□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 PBRM1Q86U86 1689 aa12.09□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 GRIN2BQ13224 1484 aa12.08□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.08□□□□□ -0.47
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CHD1O14646 1710 aa12.08□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 FBLN2P98095 1184 aa12.06□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ADAMTS12P58397 1594 aa12.02□□□□□ -0.49
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SYNJ2O15056 1496 aa12.02□□□□□ -0.49
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.97□□□□□ -0.49
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SLC24A1O60721 1099 aa11.96□□□□□ -0.49
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 GRIN2AQ12879 1464 aa11.95□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 KIF27Q86VH2 1401 aa11.95□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CYB5RLQ6IPT4 315 aa11.95□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CLASP1Q7Z460 1538 aa11.94□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.94□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CEP170Q5SW79 1584 aa11.9□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 CUL7Q14999 1698 aa11.9□□□□□ -0.5
PITRM1-AS1-202ENST00000598280 ARAP1Q96P48 1450 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms