RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598125.5

TIMM50-211, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM50, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-211ENST00000598125 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.32■■■■■ 5.01
TIMM50-211ENST00000598125 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.34■■■■■ 4.21
TIMM50-211ENST00000598125 ABCC9O60706 1549 aa40.23■■■■■ 4.03
TIMM50-211ENST00000598125 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.81■■■■□ 3.8
TIMM50-211ENST00000598125 NACADO15069 1562 aa38.75■■■■□ 3.79
TIMM50-211ENST00000598125 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
TIMM50-211ENST00000598125 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.53■■■■□ 3.76
TIMM50-211ENST00000598125 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.51■■■■□ 3.76
TIMM50-211ENST00000598125 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.37■■■■□ 3.73
TIMM50-211ENST00000598125 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.08■■■■□ 3.69
TIMM50-211ENST00000598125 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.63■■■■□ 3.61
TIMM50-211ENST00000598125 SCRIBQ14160 1630 aa37.62■■■■□ 3.61
TIMM50-211ENST00000598125 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.49■■■■□ 3.59
TIMM50-211ENST00000598125 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.25■■■■□ 3.55
TIMM50-211ENST00000598125 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.78■■■■□ 3.48
TIMM50-211ENST00000598125 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
TIMM50-211ENST00000598125 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.48■■■■□ 3.43
TIMM50-211ENST00000598125 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.15■■■■□ 3.38
TIMM50-211ENST00000598125 SMARCA4P51532 1647 aa36.01■■■■□ 3.36
TIMM50-211ENST00000598125 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
TIMM50-211ENST00000598125 SMARCA2P51531 1590 aa35.74■■■■□ 3.31
TIMM50-211ENST00000598125 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.71■■■■□ 3.31
TIMM50-211ENST00000598125 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.69■■■■□ 3.3
TIMM50-211ENST00000598125 NCAPD3P42695 1498 aa35.68■■■■□ 3.3
TIMM50-211ENST00000598125 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.66■■■■□ 3.3
TIMM50-211ENST00000598125 HMGXB3Q12766 1538 aa35.61■■■■□ 3.29
TIMM50-211ENST00000598125 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
TIMM50-211ENST00000598125 WIZO95785 1651 aa35.38■■■■□ 3.25
TIMM50-211ENST00000598125 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
TIMM50-211ENST00000598125 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.99■■■■□ 3.19
TIMM50-211ENST00000598125 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.84■■■■□ 3.17
TIMM50-211ENST00000598125 NESP48681 1621 aa34.83■■■■□ 3.17
TIMM50-211ENST00000598125 ERCC6Q03468 1493 aa34.69■■■■□ 3.14
TIMM50-211ENST00000598125 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.61■■■■□ 3.13
TIMM50-211ENST00000598125 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.58■■■■□ 3.13
TIMM50-211ENST00000598125 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.5■■■■□ 3.11
TIMM50-211ENST00000598125 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.5■■■■□ 3.11
TIMM50-211ENST00000598125 PRDM2Q13029 1718 aa34.47■■■■□ 3.11
TIMM50-211ENST00000598125 CFTRP13569 1480 aa34.46■■■■□ 3.11
TIMM50-211ENST00000598125 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.43■■■■□ 3.1
TIMM50-211ENST00000598125 CUX2O14529 1486 aa34.36■■■■□ 3.09
TIMM50-211ENST00000598125 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
TIMM50-211ENST00000598125 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.27■■■■□ 3.08
TIMM50-211ENST00000598125 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.25■■■■□ 3.07
TIMM50-211ENST00000598125 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.19■■■■□ 3.06
TIMM50-211ENST00000598125 WDR62O43379 1518 aa34.12■■■■□ 3.05
TIMM50-211ENST00000598125 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
TIMM50-211ENST00000598125 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.76■■■□□ 2.99
TIMM50-211ENST00000598125 TOPBP1Q92547 1522 aa33.74■■■□□ 2.99
TIMM50-211ENST00000598125 ABCC8Q09428 1581 aa33.73■■■□□ 2.99
TIMM50-211ENST00000598125 IFT140Q96RY7 1462 aa33.5■■■□□ 2.95
TIMM50-211ENST00000598125 CUX1P39880 1505 aa33.49■■■□□ 2.95
TIMM50-211ENST00000598125 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
TIMM50-211ENST00000598125 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
TIMM50-211ENST00000598125 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.37■■■□□ 2.93
TIMM50-211ENST00000598125 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
TIMM50-211ENST00000598125 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
TIMM50-211ENST00000598125 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.32■■■□□ 2.92
TIMM50-211ENST00000598125 TOP2BQ02880 1626 aa33.27■■■□□ 2.92
TIMM50-211ENST00000598125 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.26■■■□□ 2.92
TIMM50-211ENST00000598125 WDR97A6NE52 1622 aa33.26■■■□□ 2.91
TIMM50-211ENST00000598125 SOGA1O94964 1423 aa33.25■■■□□ 2.91
TIMM50-211ENST00000598125 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.25■■■□□ 2.91
TIMM50-211ENST00000598125 SYNJ1O43426 1573 aa33.25■■■□□ 2.91
TIMM50-211ENST00000598125 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.13■■■□□ 2.89
TIMM50-211ENST00000598125 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.12■■■□□ 2.896e-8■■■■□ 23.2
TIMM50-211ENST00000598125 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.06■■■□□ 2.88
TIMM50-211ENST00000598125 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.03■■■□□ 2.88
TIMM50-211ENST00000598125 PBRM1Q86U86 1689 aa33.03■■■□□ 2.88
TIMM50-211ENST00000598125 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.01■■■□□ 2.87
TIMM50-211ENST00000598125 CHD1O14646 1710 aa32.96■■■□□ 2.87
TIMM50-211ENST00000598125 GRIN2BQ13224 1484 aa32.91■■■□□ 2.86
TIMM50-211ENST00000598125 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.91■■■□□ 2.86
TIMM50-211ENST00000598125 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.87■■■□□ 2.85
TIMM50-211ENST00000598125 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
TIMM50-211ENST00000598125 OSCARQ8IYS5 282 aa32.8■■■□□ 2.84
TIMM50-211ENST00000598125 SYNJ2O15056 1496 aa32.7■■■□□ 2.83
TIMM50-211ENST00000598125 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.69■■■□□ 2.82
TIMM50-211ENST00000598125 ADAMTS12P58397 1594 aa32.68■■■□□ 2.82
TIMM50-211ENST00000598125 FBLN2P98095 1184 aa32.65■■■□□ 2.82
TIMM50-211ENST00000598125 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
TIMM50-211ENST00000598125 KIF27Q86VH2 1401 aa32.54■■■□□ 2.8
TIMM50-211ENST00000598125 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.51■■■□□ 2.8
TIMM50-211ENST00000598125 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.51■■■□□ 2.8
TIMM50-211ENST00000598125 GRIN2AQ12879 1464 aa32.5■■■□□ 2.79
TIMM50-211ENST00000598125 CUL7Q14999 1698 aa32.47■■■□□ 2.79
TIMM50-211ENST00000598125 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
TIMM50-211ENST00000598125 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
TIMM50-211ENST00000598125 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.46■■■□□ 2.79
TIMM50-211ENST00000598125 ARHGEF11O15085 1522 aa32.4■■■□□ 2.78
TIMM50-211ENST00000598125 CEP170Q5SW79 1584 aa32.38■■■□□ 2.77
TIMM50-211ENST00000598125 TRIM41Q8WV44 630 aa32.38■■■□□ 2.77
TIMM50-211ENST00000598125 NUP160Q12769 1436 aa32.34■■■□□ 2.77
TIMM50-211ENST00000598125 IGF1RP08069 1367 aa32.34■■■□□ 2.77
TIMM50-211ENST00000598125 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.25■■■□□ 2.75
TIMM50-211ENST00000598125 SHROOM2Q13796 1616 aa32.2■■■□□ 2.75
TIMM50-211ENST00000598125 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.19■■■□□ 2.74
TIMM50-211ENST00000598125 ARAP1Q96P48 1450 aa32.12■■■□□ 2.73
TIMM50-211ENST00000598125 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.05■■■□□ 2.72
TIMM50-211ENST00000598125 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.03■■■□□ 2.72
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