RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597666.5

TIMM50-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM50, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-209ENST00000597666 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.34■■■■■ 5.97
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TIMM50-209ENST00000597666 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.08■■■■■ 4.65
TIMM50-209ENST00000597666 NACADO15069 1562 aa43.98■■■■■ 4.63
TIMM50-209ENST00000597666 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.71■■■■■ 4.59
TIMM50-209ENST00000597666 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.7■■■■■ 4.59
TIMM50-209ENST00000597666 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
TIMM50-209ENST00000597666 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.41■■■■■ 4.54
TIMM50-209ENST00000597666 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.96■■■■■ 4.47
TIMM50-209ENST00000597666 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.65■■■■■ 4.42
TIMM50-209ENST00000597666 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.61■■■■■ 4.41
TIMM50-209ENST00000597666 SCRIBQ14160 1630 aa42.46■■■■■ 4.39
TIMM50-209ENST00000597666 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.41■■■■■ 4.38
TIMM50-209ENST00000597666 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.07■■■■■ 4.33
TIMM50-209ENST00000597666 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
TIMM50-209ENST00000597666 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.44■■■■■ 4.22
TIMM50-209ENST00000597666 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.21■■■■■ 4.19
TIMM50-209ENST00000597666 SMARCA4P51532 1647 aa40.66■■■■■ 4.1
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TIMM50-209ENST00000597666 NCAPD3P42695 1498 aa40.54■■■■■ 4.08
TIMM50-209ENST00000597666 SMARCA2P51531 1590 aa40.52■■■■■ 4.08
TIMM50-209ENST00000597666 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.48■■■■■ 4.07
TIMM50-209ENST00000597666 HMGXB3Q12766 1538 aa40.37■■■■■ 4.05
TIMM50-209ENST00000597666 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.33■■■■■ 4.05
TIMM50-209ENST00000597666 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.25■■■■■ 4.03
TIMM50-209ENST00000597666 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
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TIMM50-209ENST00000597666 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
TIMM50-209ENST00000597666 ERCC6Q03468 1493 aa39.56■■■■□ 3.92
TIMM50-209ENST00000597666 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.55■■■■□ 3.92
TIMM50-209ENST00000597666 NESP48681 1621 aa39.48■■■■□ 3.91
TIMM50-209ENST00000597666 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
TIMM50-209ENST00000597666 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.33■■■■□ 3.89
TIMM50-209ENST00000597666 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.3■■■■□ 3.88
TIMM50-209ENST00000597666 CUX2O14529 1486 aa39.29■■■■□ 3.88
TIMM50-209ENST00000597666 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.09■■■■□ 3.85
TIMM50-209ENST00000597666 CFTRP13569 1480 aa39.06■■■■□ 3.84
TIMM50-209ENST00000597666 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
TIMM50-209ENST00000597666 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.93■■■■□ 3.82
TIMM50-209ENST00000597666 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.87■■■■□ 3.81
TIMM50-209ENST00000597666 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.86■■■■□ 3.81
TIMM50-209ENST00000597666 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.86■■■■□ 3.81
TIMM50-209ENST00000597666 PRDM2Q13029 1718 aa38.8■■■■□ 3.8
TIMM50-209ENST00000597666 WDR62O43379 1518 aa38.73■■■■□ 3.79
TIMM50-209ENST00000597666 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
TIMM50-209ENST00000597666 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.43■■■■□ 3.74
TIMM50-209ENST00000597666 ABCC8Q09428 1581 aa38.34■■■■□ 3.73
TIMM50-209ENST00000597666 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.24■■■■□ 3.71
TIMM50-209ENST00000597666 TOPBP1Q92547 1522 aa38.2■■■■□ 3.71
TIMM50-209ENST00000597666 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.19■■■■□ 3.7
TIMM50-209ENST00000597666 IFT140Q96RY7 1462 aa38.09■■■■□ 3.69
TIMM50-209ENST00000597666 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
TIMM50-209ENST00000597666 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
TIMM50-209ENST00000597666 CUX1P39880 1505 aa37.8■■■■□ 3.64
TIMM50-209ENST00000597666 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
TIMM50-209ENST00000597666 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.72■■■■□ 3.63
TIMM50-209ENST00000597666 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
TIMM50-209ENST00000597666 SOGA1O94964 1423 aa37.71■■■■□ 3.63
TIMM50-209ENST00000597666 WDR97A6NE52 1622 aa37.67■■■■□ 3.62
TIMM50-209ENST00000597666 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.62■■■■□ 3.61
TIMM50-209ENST00000597666 OSCARQ8IYS5 282 aa37.57■■■■□ 3.6
TIMM50-209ENST00000597666 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.56■■■■□ 3.63e-7■■■■□ 23.2
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TIMM50-209ENST00000597666 TOP2BQ02880 1626 aa37.49■■■■□ 3.59
TIMM50-209ENST00000597666 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.48■■■■□ 3.59
TIMM50-209ENST00000597666 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
TIMM50-209ENST00000597666 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.41■■■■□ 3.58
TIMM50-209ENST00000597666 SYNJ1O43426 1573 aa37.38■■■■□ 3.57
TIMM50-209ENST00000597666 GRIN2BQ13224 1484 aa37.34■■■■□ 3.57
TIMM50-209ENST00000597666 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
TIMM50-209ENST00000597666 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.3■■■■□ 3.56
TIMM50-209ENST00000597666 CHD1O14646 1710 aa37.26■■■■□ 3.56
TIMM50-209ENST00000597666 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.26■■■■□ 3.55
TIMM50-209ENST00000597666 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.25■■■■□ 3.55
TIMM50-209ENST00000597666 PBRM1Q86U86 1689 aa37.22■■■■□ 3.55
TIMM50-209ENST00000597666 FBLN2P98095 1184 aa37.18■■■■□ 3.54
TIMM50-209ENST00000597666 SYNJ2O15056 1496 aa37.13■■■■□ 3.54
TIMM50-209ENST00000597666 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.11■■■■□ 3.53
TIMM50-209ENST00000597666 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37■■■■□ 3.51
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TIMM50-209ENST00000597666 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
TIMM50-209ENST00000597666 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.92■■■■□ 3.5
TIMM50-209ENST00000597666 ARHGEF11O15085 1522 aa36.92■■■■□ 3.5
TIMM50-209ENST00000597666 ADAMTS12P58397 1594 aa36.91■■■■□ 3.5
TIMM50-209ENST00000597666 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.88■■■■□ 3.49
TIMM50-209ENST00000597666 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.88■■■■□ 3.49
TIMM50-209ENST00000597666 GRIN2AQ12879 1464 aa36.83■■■■□ 3.49
TIMM50-209ENST00000597666 TRIM41Q8WV44 630 aa36.81■■■■□ 3.48
TIMM50-209ENST00000597666 KIF27Q86VH2 1401 aa36.8■■■■□ 3.48
TIMM50-209ENST00000597666 NUP160Q12769 1436 aa36.69■■■■□ 3.46
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TIMM50-209ENST00000597666 CEP170Q5SW79 1584 aa36.61■■■■□ 3.45
TIMM50-209ENST00000597666 IGF1RP08069 1367 aa36.6■■■■□ 3.45
TIMM50-209ENST00000597666 ARAP1Q96P48 1450 aa36.57■■■■□ 3.45
TIMM50-209ENST00000597666 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.54■■■■□ 3.44
TIMM50-209ENST00000597666 SHROOM2Q13796 1616 aa36.45■■■■□ 3.42
TIMM50-209ENST00000597666 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.41■■■■□ 3.42
TIMM50-209ENST00000597666 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.38■■■■□ 3.41
TIMM50-209ENST00000597666 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa36.31■■■■□ 3.4
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