RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596862.5

CCDC155-211, Transcript of coiled-coil domain containing 155, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC155, Length 570 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155-211ENST00000596862 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.23■■■■■ 5.79
CCDC155-211ENST00000596862 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.65■■■■■ 4.9
CCDC155-211ENST00000596862 ABCC9O60706 1549 aa44.99■■■■■ 4.79
CCDC155-211ENST00000596862 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.14■■■■■ 4.5
CCDC155-211ENST00000596862 NACADO15069 1562 aa43.02■■■■■ 4.48
CCDC155-211ENST00000596862 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.96■■■■■ 4.47
CCDC155-211ENST00000596862 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.66■■■■■ 4.42
CCDC155-211ENST00000596862 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
CCDC155-211ENST00000596862 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.37■■■■■ 4.37
CCDC155-211ENST00000596862 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.06■■■■■ 4.32
CCDC155-211ENST00000596862 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42■■■■■ 4.31
CCDC155-211ENST00000596862 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.81■■■■■ 4.28
CCDC155-211ENST00000596862 SCRIBQ14160 1630 aa41.66■■■■■ 4.26
CCDC155-211ENST00000596862 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.52■■■■■ 4.24
CCDC155-211ENST00000596862 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.4■■■■■ 4.22
CCDC155-211ENST00000596862 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
CCDC155-211ENST00000596862 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.65■■■■■ 4.1
CCDC155-211ENST00000596862 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.46■■■■■ 4.07
CCDC155-211ENST00000596862 SMARCA4P51532 1647 aa39.8■■■■□ 3.96
CCDC155-211ENST00000596862 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
CCDC155-211ENST00000596862 NCAPD3P42695 1498 aa39.7■■■■□ 3.95
CCDC155-211ENST00000596862 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.68■■■■□ 3.94
CCDC155-211ENST00000596862 SMARCA2P51531 1590 aa39.63■■■■□ 3.93
CCDC155-211ENST00000596862 HMGXB3Q12766 1538 aa39.48■■■■□ 3.91
CCDC155-211ENST00000596862 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.47■■■■□ 3.91
CCDC155-211ENST00000596862 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.41■■■■□ 3.9
CCDC155-211ENST00000596862 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
CCDC155-211ENST00000596862 WIZO95785 1651 aa39.01■■■■□ 3.84
CCDC155-211ENST00000596862 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
CCDC155-211ENST00000596862 ERCC6Q03468 1493 aa38.84■■■■□ 3.81
CCDC155-211ENST00000596862 NESP48681 1621 aa38.83■■■■□ 3.81
CCDC155-211ENST00000596862 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.69■■■■□ 3.78
CCDC155-211ENST00000596862 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
CCDC155-211ENST00000596862 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.54■■■■□ 3.76
CCDC155-211ENST00000596862 CUX2O14529 1486 aa38.5■■■■□ 3.75
CCDC155-211ENST00000596862 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.47■■■■□ 3.75
CCDC155-211ENST00000596862 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.32■■■■□ 3.72
CCDC155-211ENST00000596862 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.3■■■■□ 3.72
CCDC155-211ENST00000596862 CFTRP13569 1480 aa38.25■■■■□ 3.71
CCDC155-211ENST00000596862 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.15■■■■□ 3.7
CCDC155-211ENST00000596862 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.1■■■■□ 3.69
CCDC155-211ENST00000596862 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.09■■■■□ 3.69
CCDC155-211ENST00000596862 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.09■■■■□ 3.69
CCDC155-211ENST00000596862 WDR62O43379 1518 aa37.97■■■■□ 3.67
CCDC155-211ENST00000596862 PRDM2Q13029 1718 aa37.84■■■■□ 3.65
CCDC155-211ENST00000596862 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
CCDC155-211ENST00000596862 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
CCDC155-211ENST00000596862 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.65■■■■□ 3.62
CCDC155-211ENST00000596862 TOPBP1Q92547 1522 aa37.45■■■■□ 3.59
CCDC155-211ENST00000596862 ABCC8Q09428 1581 aa37.43■■■■□ 3.58
CCDC155-211ENST00000596862 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.38■■■■□ 3.57
CCDC155-211ENST00000596862 IFT140Q96RY7 1462 aa37.31■■■■□ 3.56
CCDC155-211ENST00000596862 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.14■■■■□ 3.54
CCDC155-211ENST00000596862 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.12■■■■□ 3.53
CCDC155-211ENST00000596862 CUX1P39880 1505 aa37.05■■■■□ 3.52
CCDC155-211ENST00000596862 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.03■■■■□ 3.52
CCDC155-211ENST00000596862 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.99■■■■□ 3.51
CCDC155-211ENST00000596862 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
CCDC155-211ENST00000596862 SOGA1O94964 1423 aa36.97■■■■□ 3.51
CCDC155-211ENST00000596862 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.96■■■■□ 3.51
CCDC155-211ENST00000596862 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.89■■■■□ 3.5
CCDC155-211ENST00000596862 OSCARQ8IYS5 282 aa36.86■■■■□ 3.49
CCDC155-211ENST00000596862 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
CCDC155-211ENST00000596862 WDR97A6NE52 1622 aa36.75■■■■□ 3.47
CCDC155-211ENST00000596862 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.74■■■■□ 3.47
CCDC155-211ENST00000596862 TOP2BQ02880 1626 aa36.65■■■■□ 3.46
CCDC155-211ENST00000596862 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.63■■■■□ 3.45
CCDC155-211ENST00000596862 SYNJ1O43426 1573 aa36.62■■■■□ 3.45
CCDC155-211ENST00000596862 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.61■■■■□ 3.45
CCDC155-211ENST00000596862 GRIN2BQ13224 1484 aa36.58■■■■□ 3.45
CCDC155-211ENST00000596862 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.57■■■■□ 3.45
CCDC155-211ENST00000596862 FBLN2P98095 1184 aa36.55■■■■□ 3.44
CCDC155-211ENST00000596862 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.54■■■■□ 3.44
CCDC155-211ENST00000596862 CHD1O14646 1710 aa36.52■■■■□ 3.44
CCDC155-211ENST00000596862 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.44
CCDC155-211ENST00000596862 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.47■■■■□ 3.43
CCDC155-211ENST00000596862 PBRM1Q86U86 1689 aa36.42■■■■□ 3.42
CCDC155-211ENST00000596862 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
CCDC155-211ENST00000596862 SYNJ2O15056 1496 aa36.37■■■■□ 3.41
CCDC155-211ENST00000596862 TRIM41Q8WV44 630 aa36.32■■■■□ 3.4
CCDC155-211ENST00000596862 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.26■■■■□ 3.4
CCDC155-211ENST00000596862 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.26■■■■□ 3.4
CCDC155-211ENST00000596862 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.26■■■■□ 3.4
CCDC155-211ENST00000596862 ARHGEF11O15085 1522 aa36.26■■■■□ 3.4
CCDC155-211ENST00000596862 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.17■■■■□ 3.38
CCDC155-211ENST00000596862 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.17■■■■□ 3.38
CCDC155-211ENST00000596862 ADAMTS12P58397 1594 aa36.16■■■■□ 3.38
CCDC155-211ENST00000596862 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.11■■■■□ 3.37
CCDC155-211ENST00000596862 GRIN2AQ12879 1464 aa36.1■■■■□ 3.37
CCDC155-211ENST00000596862 KIF27Q86VH2 1401 aa36■■■■□ 3.35
CCDC155-211ENST00000596862 ARAP1Q96P48 1450 aa35.95■■■■□ 3.35
CCDC155-211ENST00000596862 NUP160Q12769 1436 aa35.95■■■■□ 3.35
CCDC155-211ENST00000596862 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.95■■■■□ 3.35
CCDC155-211ENST00000596862 CEP170Q5SW79 1584 aa35.92■■■■□ 3.34
CCDC155-211ENST00000596862 IGF1RP08069 1367 aa35.86■■■■□ 3.33
CCDC155-211ENST00000596862 CUL7Q14999 1698 aa35.77■■■■□ 3.32
CCDC155-211ENST00000596862 SHROOM2Q13796 1616 aa35.67■■■■□ 3.3
CCDC155-211ENST00000596862 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.66■■■■□ 3.3
CCDC155-211ENST00000596862 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.64■■■■□ 3.3
CCDC155-211ENST00000596862 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.63■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms