RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596522.1

FCHO1-215, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-215ENST00000596522 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34■■■■□ 3.03
FCHO1-215ENST00000596522 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.29■■■□□ 2.44
FCHO1-215ENST00000596522 ABCC9O60706 1549 aa29.68■■■□□ 2.34
FCHO1-215ENST00000596522 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.52■■■□□ 2.16
FCHO1-215ENST00000596522 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.47■■■□□ 2.15
FCHO1-215ENST00000596522 NACADO15069 1562 aa28.45■■■□□ 2.15
FCHO1-215ENST00000596522 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.13
FCHO1-215ENST00000596522 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.33■■■□□ 2.13
FCHO1-215ENST00000596522 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.25■■■□□ 2.11
FCHO1-215ENST00000596522 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.01■■■□□ 2.07
FCHO1-215ENST00000596522 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
FCHO1-215ENST00000596522 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.67■■■□□ 2.02
FCHO1-215ENST00000596522 SCRIBQ14160 1630 aa27.63■■■□□ 2.01
FCHO1-215ENST00000596522 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.36■■□□□ 1.97
FCHO1-215ENST00000596522 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.31■■□□□ 1.96
FCHO1-215ENST00000596522 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
FCHO1-215ENST00000596522 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.87■■□□□ 1.89
FCHO1-215ENST00000596522 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.65■■□□□ 1.86
FCHO1-215ENST00000596522 SMARCA4P51532 1647 aa26.42■■□□□ 1.82
FCHO1-215ENST00000596522 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
FCHO1-215ENST00000596522 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.25■■□□□ 1.79
FCHO1-215ENST00000596522 NCAPD3P42695 1498 aa26.23■■□□□ 1.79
FCHO1-215ENST00000596522 SMARCA2P51531 1590 aa26.22■■□□□ 1.79
FCHO1-215ENST00000596522 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.2■■□□□ 1.79
FCHO1-215ENST00000596522 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.13■■□□□ 1.77
FCHO1-215ENST00000596522 HMGXB3Q12766 1538 aa26.11■■□□□ 1.77
FCHO1-215ENST00000596522 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
FCHO1-215ENST00000596522 WIZO95785 1651 aa25.98■■□□□ 1.75
FCHO1-215ENST00000596522 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
FCHO1-215ENST00000596522 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
FCHO1-215ENST00000596522 NESP48681 1621 aa25.67■■□□□ 1.7
FCHO1-215ENST00000596522 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.59■■□□□ 1.69
FCHO1-215ENST00000596522 ERCC6Q03468 1493 aa25.57■■□□□ 1.68
FCHO1-215ENST00000596522 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.46■■□□□ 1.67
FCHO1-215ENST00000596522 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.43■■□□□ 1.66
FCHO1-215ENST00000596522 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.38■■□□□ 1.65
FCHO1-215ENST00000596522 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
FCHO1-215ENST00000596522 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.34■■□□□ 1.65
FCHO1-215ENST00000596522 CUX2O14529 1486 aa25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-215ENST00000596522 CFTRP13569 1480 aa25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-215ENST00000596522 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
FCHO1-215ENST00000596522 PRDM2Q13029 1718 aa25.25■■□□□ 1.63
FCHO1-215ENST00000596522 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.2■■□□□ 1.62
FCHO1-215ENST00000596522 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.16■■□□□ 1.62
FCHO1-215ENST00000596522 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.14■■□□□ 1.61
FCHO1-215ENST00000596522 WDR62O43379 1518 aa25.07■■□□□ 1.6
FCHO1-215ENST00000596522 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
FCHO1-215ENST00000596522 ABCC8Q09428 1581 aa24.82■■□□□ 1.56
FCHO1-215ENST00000596522 TOPBP1Q92547 1522 aa24.8■■□□□ 1.56
FCHO1-215ENST00000596522 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.76■■□□□ 1.55
FCHO1-215ENST00000596522 IFT140Q96RY7 1462 aa24.63■■□□□ 1.53
FCHO1-215ENST00000596522 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.62■■□□□ 1.53
FCHO1-215ENST00000596522 CUX1P39880 1505 aa24.59■■□□□ 1.53
FCHO1-215ENST00000596522 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
FCHO1-215ENST00000596522 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
FCHO1-215ENST00000596522 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
FCHO1-215ENST00000596522 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
FCHO1-215ENST00000596522 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.51■■□□□ 1.51
FCHO1-215ENST00000596522 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.48■■□□□ 1.51
FCHO1-215ENST00000596522 SOGA1O94964 1423 aa24.47■■□□□ 1.51
FCHO1-215ENST00000596522 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
FCHO1-215ENST00000596522 TOP2BQ02880 1626 aa24.42■■□□□ 1.5
FCHO1-215ENST00000596522 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.55e-10■■■■■ 58.2
FCHO1-215ENST00000596522 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.39■■□□□ 1.5
FCHO1-215ENST00000596522 SYNJ1O43426 1573 aa24.37■■□□□ 1.49
FCHO1-215ENST00000596522 WDR97A6NE52 1622 aa24.36■■□□□ 1.49
FCHO1-215ENST00000596522 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FCHO1-215ENST00000596522 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.27■■□□□ 1.48
FCHO1-215ENST00000596522 OSCARQ8IYS5 282 aa24.26■■□□□ 1.47
FCHO1-215ENST00000596522 CHD1O14646 1710 aa24.24■■□□□ 1.47
FCHO1-215ENST00000596522 PBRM1Q86U86 1689 aa24.22■■□□□ 1.47
FCHO1-215ENST00000596522 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-215ENST00000596522 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.19■■□□□ 1.46
FCHO1-215ENST00000596522 GRIN2BQ13224 1484 aa24.18■■□□□ 1.46
FCHO1-215ENST00000596522 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.16■■□□□ 1.46
FCHO1-215ENST00000596522 FBLN2P98095 1184 aa24.14■■□□□ 1.45
FCHO1-215ENST00000596522 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
FCHO1-215ENST00000596522 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
FCHO1-215ENST00000596522 SYNJ2O15056 1496 aa24.03■■□□□ 1.44
FCHO1-215ENST00000596522 TRIM41Q8WV44 630 aa24.03■■□□□ 1.44
FCHO1-215ENST00000596522 KIF27Q86VH2 1401 aa24.02■■□□□ 1.44
FCHO1-215ENST00000596522 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.01■■□□□ 1.43
FCHO1-215ENST00000596522 ADAMTS12P58397 1594 aa23.95■■□□□ 1.43
FCHO1-215ENST00000596522 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.92■■□□□ 1.42
FCHO1-215ENST00000596522 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.92■■□□□ 1.42
FCHO1-215ENST00000596522 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.92■■□□□ 1.42
FCHO1-215ENST00000596522 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.91■■□□□ 1.42
FCHO1-215ENST00000596522 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.89■■□□□ 1.41
FCHO1-215ENST00000596522 GRIN2AQ12879 1464 aa23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-215ENST00000596522 ARHGEF11O15085 1522 aa23.88■■□□□ 1.41
FCHO1-215ENST00000596522 IGF1RP08069 1367 aa23.82■■□□□ 1.4
FCHO1-215ENST00000596522 CUL7Q14999 1698 aa23.81■■□□□ 1.4
FCHO1-215ENST00000596522 CEP170Q5SW79 1584 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-215ENST00000596522 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.79■■□□□ 1.4
FCHO1-215ENST00000596522 EEA1Q15075 1411 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-215ENST00000596522 NUP160Q12769 1436 aa23.76■■□□□ 1.39
FCHO1-215ENST00000596522 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.72■■□□□ 1.39
FCHO1-215ENST00000596522 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.69■■□□□ 1.38
FCHO1-215ENST00000596522 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.68■■□□□ 1.38
FCHO1-215ENST00000596522 ARAP1Q96P48 1450 aa23.67■■□□□ 1.38
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