RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596460.5

FKRP-211, Transcript of fukutin related protein, humanhuman

TSL 4

Gene FKRP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRP-211ENST00000596460 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.24■■■■■ 4.19
FKRP-211ENST00000596460 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.75■■■■□ 3.47
FKRP-211ENST00000596460 ABCC9O60706 1549 aa36.22■■■■□ 3.39
FKRP-211ENST00000596460 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.74■■■■□ 3.15
FKRP-211ENST00000596460 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.73■■■■□ 3.15
FKRP-211ENST00000596460 NACADO15069 1562 aa34.62■■■■□ 3.13
FKRP-211ENST00000596460 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
FKRP-211ENST00000596460 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.27■■■■□ 3.08
FKRP-211ENST00000596460 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.07■■■■□ 3.04
FKRP-211ENST00000596460 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.9■■■■□ 3.02
FKRP-211ENST00000596460 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.83■■■■□ 3.01
FKRP-211ENST00000596460 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.6■■■□□ 2.97
FKRP-211ENST00000596460 SCRIBQ14160 1630 aa33.58■■■□□ 2.97
FKRP-211ENST00000596460 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.33■■■□□ 2.93
FKRP-211ENST00000596460 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.25■■■□□ 2.91
FKRP-211ENST00000596460 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.79■■■□□ 2.84
FKRP-211ENST00000596460 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.71■■■□□ 2.83
FKRP-211ENST00000596460 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.54■■■□□ 2.8
FKRP-211ENST00000596460 SMARCA4P51532 1647 aa32.06■■■□□ 2.72
FKRP-211ENST00000596460 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.01■■■□□ 2.71
FKRP-211ENST00000596460 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.92■■■□□ 2.7
FKRP-211ENST00000596460 NCAPD3P42695 1498 aa31.91■■■□□ 2.7
FKRP-211ENST00000596460 SMARCA2P51531 1590 aa31.91■■■□□ 2.7
FKRP-211ENST00000596460 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.78■■■□□ 2.68
FKRP-211ENST00000596460 HMGXB3Q12766 1538 aa31.75■■■□□ 2.67
FKRP-211ENST00000596460 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
FKRP-211ENST00000596460 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.68■■■□□ 2.66
FKRP-211ENST00000596460 WIZO95785 1651 aa31.46■■■□□ 2.63
FKRP-211ENST00000596460 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.35■■■□□ 2.61
FKRP-211ENST00000596460 ERCC6Q03468 1493 aa31.28■■■□□ 2.6
FKRP-211ENST00000596460 NESP48681 1621 aa31.24■■■□□ 2.59
FKRP-211ENST00000596460 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.13■■■□□ 2.57
FKRP-211ENST00000596460 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
FKRP-211ENST00000596460 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.01■■■□□ 2.55
FKRP-211ENST00000596460 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.98■■■□□ 2.55
FKRP-211ENST00000596460 CUX2O14529 1486 aa30.93■■■□□ 2.54
FKRP-211ENST00000596460 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.88■■■□□ 2.53
FKRP-211ENST00000596460 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
FKRP-211ENST00000596460 CFTRP13569 1480 aa30.76■■■□□ 2.51
FKRP-211ENST00000596460 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.74■■■□□ 2.51
FKRP-211ENST00000596460 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.68■■■□□ 2.5
FKRP-211ENST00000596460 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.68■■■□□ 2.5
FKRP-211ENST00000596460 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.64■■■□□ 2.5
FKRP-211ENST00000596460 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
FKRP-211ENST00000596460 PRDM2Q13029 1718 aa30.54■■■□□ 2.48
FKRP-211ENST00000596460 WDR62O43379 1518 aa30.52■■■□□ 2.48
FKRP-211ENST00000596460 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
FKRP-211ENST00000596460 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.21■■■□□ 2.43
FKRP-211ENST00000596460 ABCC8Q09428 1581 aa30.15■■■□□ 2.42
FKRP-211ENST00000596460 TOPBP1Q92547 1522 aa30.15■■■□□ 2.42
FKRP-211ENST00000596460 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.1■■■□□ 2.41
FKRP-211ENST00000596460 IFT140Q96RY7 1462 aa30.02■■■□□ 2.4
FKRP-211ENST00000596460 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
FKRP-211ENST00000596460 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
FKRP-211ENST00000596460 CUX1P39880 1505 aa29.83■■■□□ 2.37
FKRP-211ENST00000596460 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
FKRP-211ENST00000596460 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.8■■■□□ 2.36
FKRP-211ENST00000596460 SOGA1O94964 1423 aa29.79■■■□□ 2.36
FKRP-211ENST00000596460 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.77■■■□□ 2.36
FKRP-211ENST00000596460 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
FKRP-211ENST00000596460 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.71■■■□□ 2.35
FKRP-211ENST00000596460 OSCARQ8IYS5 282 aa29.68■■■□□ 2.34
FKRP-211ENST00000596460 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
FKRP-211ENST00000596460 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.62■■■□□ 2.33
FKRP-211ENST00000596460 WDR97A6NE52 1622 aa29.56■■■□□ 2.32
FKRP-211ENST00000596460 TOP2BQ02880 1626 aa29.53■■■□□ 2.32
FKRP-211ENST00000596460 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.53■■■□□ 2.32
FKRP-211ENST00000596460 FBLN2P98095 1184 aa29.52■■■□□ 2.32
FKRP-211ENST00000596460 SYNJ1O43426 1573 aa29.52■■■□□ 2.32
FKRP-211ENST00000596460 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.46■■■□□ 2.31
FKRP-211ENST00000596460 GRIN2BQ13224 1484 aa29.45■■■□□ 2.31
FKRP-211ENST00000596460 CHD1O14646 1710 aa29.45■■■□□ 2.3
FKRP-211ENST00000596460 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.44■■■□□ 2.3
FKRP-211ENST00000596460 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.43■■■□□ 2.3
FKRP-211ENST00000596460 PBRM1Q86U86 1689 aa29.38■■■□□ 2.29
FKRP-211ENST00000596460 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
FKRP-211ENST00000596460 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
FKRP-211ENST00000596460 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.35■■■□□ 2.29
FKRP-211ENST00000596460 SYNJ2O15056 1496 aa29.28■■■□□ 2.28
FKRP-211ENST00000596460 TRIM41Q8WV44 630 aa29.27■■■□□ 2.28
FKRP-211ENST00000596460 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
FKRP-211ENST00000596460 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
FKRP-211ENST00000596460 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.16■■■□□ 2.26
FKRP-211ENST00000596460 ARHGEF11O15085 1522 aa29.15■■■□□ 2.26
FKRP-211ENST00000596460 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.12■■■□□ 2.25
FKRP-211ENST00000596460 ADAMTS12P58397 1594 aa29.11■■■□□ 2.25
FKRP-211ENST00000596460 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.08■■■□□ 2.25
FKRP-211ENST00000596460 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.06■■■□□ 2.24
FKRP-211ENST00000596460 GRIN2AQ12879 1464 aa29.06■■■□□ 2.24
FKRP-211ENST00000596460 KIF27Q86VH2 1401 aa29.03■■■□□ 2.24
FKRP-211ENST00000596460 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.97■■■□□ 2.23
FKRP-211ENST00000596460 NUP160Q12769 1436 aa28.9■■■□□ 2.22
FKRP-211ENST00000596460 CEP170Q5SW79 1584 aa28.9■■■□□ 2.22
FKRP-211ENST00000596460 IGF1RP08069 1367 aa28.88■■■□□ 2.21
FKRP-211ENST00000596460 ARAP1Q96P48 1450 aa28.88■■■□□ 2.21
FKRP-211ENST00000596460 CUL7Q14999 1698 aa28.84■■■□□ 2.21
FKRP-211ENST00000596460 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.75■■■□□ 2.19
FKRP-211ENST00000596460 SHROOM2Q13796 1616 aa28.69■■■□□ 2.18
FKRP-211ENST00000596460 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.68■■■□□ 2.18
FKRP-211ENST00000596460 JPH4Q96JJ6 628 aa28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms