RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596282.5

ZNF548-205, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF548, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ZNF548-205ENST00000596282 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.39■■□□□ 1.17
ZNF548-205ENST00000596282 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.34■■□□□ 1.17
ZNF548-205ENST00000596282 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
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ZNF548-205ENST00000596282 SMARCA2P51531 1590 aa21.55■■□□□ 1.04
ZNF548-205ENST00000596282 ERCC6Q03468 1493 aa21.5■■□□□ 1.03
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ZNF548-205ENST00000596282 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.17■□□□□ 0.98
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ZNF548-205ENST00000596282 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.88■□□□□ 0.93
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ZNF548-205ENST00000596282 WDR62O43379 1518 aa20.78■□□□□ 0.92
ZNF548-205ENST00000596282 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.77■□□□□ 0.92
ZNF548-205ENST00000596282 CFTRP13569 1480 aa20.72■□□□□ 0.91
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ZNF548-205ENST00000596282 IFT140Q96RY7 1462 aa20.38■□□□□ 0.85
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ZNF548-205ENST00000596282 TOPBP1Q92547 1522 aa20.36■□□□□ 0.85
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ZNF548-205ENST00000596282 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa20.13■□□□□ 0.81
ZNF548-205ENST00000596282 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa20.13■□□□□ 0.81
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ZNF548-205ENST00000596282 CHD1O14646 1710 aa20.08■□□□□ 0.81
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ZNF548-205ENST00000596282 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.59■□□□□ 0.73
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ZNF548-205ENST00000596282 NUP160Q12769 1436 aa19.53■□□□□ 0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ERCC6L2Q5T890 1561 aa19.49■□□□□ 0.71
ZNF548-205ENST00000596282 SHROOM2Q13796 1616 aa19.44■□□□□ 0.7
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ZNF548-205ENST00000596282 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.35■□□□□ 0.69
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