RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595786.5

ZNF558-203, Transcript of zinc finger protein 558, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF558, Length 741 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558-203ENST00000595786 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.75■■■■■ 7.64
ZNF558-203ENST00000595786 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa56.07■■■■■ 6.57
ZNF558-203ENST00000595786 ABCC9O60706 1549 aa55.43■■■■■ 6.46
ZNF558-203ENST00000595786 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa53.11■■■■■ 6.09
ZNF558-203ENST00000595786 NACADO15069 1562 aa52.92■■■■■ 6.06
ZNF558-203ENST00000595786 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.66■■■■■ 6.02
ZNF558-203ENST00000595786 MYO15BQ96JP2 1530 aa52.46■■■■■ 5.99
ZNF558-203ENST00000595786 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP52.1■■■■■ 5.93
ZNF558-203ENST00000595786 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.96■■■■■ 5.91
ZNF558-203ENST00000595786 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.79■■■■■ 5.88
ZNF558-203ENST00000595786 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.71■■■■■ 5.87
ZNF558-203ENST00000595786 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.53■■■■■ 5.84
ZNF558-203ENST00000595786 BICRAQ9NZM4 1560 aa51.48■■■■■ 5.83
ZNF558-203ENST00000595786 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.02■■■■■ 5.76
ZNF558-203ENST00000595786 SCRIBQ14160 1630 aa50.99■■■■■ 5.75
ZNF558-203ENST00000595786 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP50.19■■■■■ 5.63
ZNF558-203ENST00000595786 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.13■■■■■ 5.62
ZNF558-203ENST00000595786 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.94■■■■■ 5.58
ZNF558-203ENST00000595786 NCAPD3P42695 1498 aa48.86■■■■■ 5.41
ZNF558-203ENST00000595786 SMARCA4P51532 1647 aa48.78■■■■■ 5.4
ZNF558-203ENST00000595786 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.74■■■■■ 5.39
ZNF558-203ENST00000595786 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.68■■■■■ 5.38
ZNF558-203ENST00000595786 SMARCA2P51531 1590 aa48.66■■■■■ 5.38
ZNF558-203ENST00000595786 HMGXB3Q12766 1538 aa48.51■■■■■ 5.36
ZNF558-203ENST00000595786 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.39■■■■■ 5.34
ZNF558-203ENST00000595786 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.29■■■■■ 5.32
ZNF558-203ENST00000595786 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP48.28■■■■■ 5.32
ZNF558-203ENST00000595786 ERCC6Q03468 1493 aa47.86■■■■■ 5.25
ZNF558-203ENST00000595786 NESP48681 1621 aa47.76■■■■■ 5.24
ZNF558-203ENST00000595786 WIZO95785 1651 aa47.7■■■■■ 5.23
ZNF558-203ENST00000595786 CUX2O14529 1486 aa47.67■■■■■ 5.22
ZNF558-203ENST00000595786 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.64■■■■■ 5.22
ZNF558-203ENST00000595786 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.55■■■■■ 5.2
ZNF558-203ENST00000595786 CADPSQ9ULU8 1353 aa47.39■■■■■ 5.18
ZNF558-203ENST00000595786 PDS5BQ9NTI5 1447 aa47.39■■■■■ 5.18
ZNF558-203ENST00000595786 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.21■■■■■ 5.15
ZNF558-203ENST00000595786 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
ZNF558-203ENST00000595786 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa47.15■■■■■ 5.14
ZNF558-203ENST00000595786 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.04■■■■■ 5.12
ZNF558-203ENST00000595786 CFTRP13569 1480 aa46.95■■■■■ 5.11
ZNF558-203ENST00000595786 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.88■■■■■ 5.09
ZNF558-203ENST00000595786 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.79■■■■■ 5.08
ZNF558-203ENST00000595786 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.79■■■■■ 5.08
ZNF558-203ENST00000595786 WDR62O43379 1518 aa46.74■■■■■ 5.07
ZNF558-203ENST00000595786 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.67■■■■■ 5.06
ZNF558-203ENST00000595786 PRDM2Q13029 1718 aa46.45■■■■■ 5.03
ZNF558-203ENST00000595786 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP46.33■■■■■ 5.01
ZNF558-203ENST00000595786 ABCC8Q09428 1581 aa46.03■■■■■ 4.96
ZNF558-203ENST00000595786 TOPBP1Q92547 1522 aa45.96■■■■■ 4.95
ZNF558-203ENST00000595786 IFT140Q96RY7 1462 aa45.88■■■■■ 4.94
ZNF558-203ENST00000595786 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.85■■■■■ 4.93
ZNF558-203ENST00000595786 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
ZNF558-203ENST00000595786 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.65■■■■■ 4.9
ZNF558-203ENST00000595786 OSCARQ8IYS5 282 aa45.63■■■■■ 4.9
ZNF558-203ENST00000595786 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.52■■■■■ 4.88
ZNF558-203ENST00000595786 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
ZNF558-203ENST00000595786 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
ZNF558-203ENST00000595786 SOGA1O94964 1423 aa45.37■■■■■ 4.85
ZNF558-203ENST00000595786 CUX1P39880 1505 aa45.34■■■■■ 4.85
ZNF558-203ENST00000595786 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP45.34■■■■■ 4.853e-8■□□□□ 11.2
ZNF558-203ENST00000595786 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.3■■■■■ 4.84
ZNF558-203ENST00000595786 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa45.3■■■■■ 4.84
ZNF558-203ENST00000595786 WDR97A6NE52 1622 aa45.19■■■■■ 4.83
ZNF558-203ENST00000595786 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP45.16■■■■■ 4.82
ZNF558-203ENST00000595786 TRIM41Q8WV44 630 aa45.06■■■■■ 4.8
ZNF558-203ENST00000595786 CHD1O14646 1710 aa44.96■■■■■ 4.79
ZNF558-203ENST00000595786 FBLN2P98095 1184 aa44.93■■■■■ 4.78
ZNF558-203ENST00000595786 GRIN2BQ13224 1484 aa44.92■■■■■ 4.78
ZNF558-203ENST00000595786 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.89■■■■■ 4.78
ZNF558-203ENST00000595786 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.88■■■■■ 4.78
ZNF558-203ENST00000595786 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.88■■■■■ 4.78
ZNF558-203ENST00000595786 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.85■■■■■ 4.77
ZNF558-203ENST00000595786 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
ZNF558-203ENST00000595786 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
ZNF558-203ENST00000595786 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.83■■■■■ 4.77
ZNF558-203ENST00000595786 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.82■■■■■ 4.77
ZNF558-203ENST00000595786 TOP2BQ02880 1626 aa44.8■■■■■ 4.76
ZNF558-203ENST00000595786 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.79■■■■■ 4.76
ZNF558-203ENST00000595786 ARHGEF11O15085 1522 aa44.77■■■■■ 4.76
ZNF558-203ENST00000595786 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
ZNF558-203ENST00000595786 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.7■■■■■ 4.75
ZNF558-203ENST00000595786 SYNJ2O15056 1496 aa44.7■■■■■ 4.75
ZNF558-203ENST00000595786 SYNJ1O43426 1573 aa44.69■■■■■ 4.75
ZNF558-203ENST00000595786 PBRM1Q86U86 1689 aa44.67■■■■■ 4.74
ZNF558-203ENST00000595786 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.53■■■■■ 4.72
ZNF558-203ENST00000595786 CYB5RLQ6IPT4 315 aa44.44■■■■■ 4.7
ZNF558-203ENST00000595786 ARAP1Q96P48 1450 aa44.36■■■■■ 4.69
ZNF558-203ENST00000595786 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.34■■■■■ 4.69
ZNF558-203ENST00000595786 ADAMTS12P58397 1594 aa44.31■■■■■ 4.68
ZNF558-203ENST00000595786 GRIN2AQ12879 1464 aa44.31■■■■■ 4.68
ZNF558-203ENST00000595786 FHAD1B1AJZ9 1412 aa44.31■■■■■ 4.68
ZNF558-203ENST00000595786 NUP160Q12769 1436 aa44.17■■■■■ 4.66
ZNF558-203ENST00000595786 CEP170Q5SW79 1584 aa44.06■■■■■ 4.64
ZNF558-203ENST00000595786 KIF27Q86VH2 1401 aa43.99■■■■■ 4.63
ZNF558-203ENST00000595786 IGF1RP08069 1367 aa43.92■■■■■ 4.62
ZNF558-203ENST00000595786 SHROOM2Q13796 1616 aa43.88■■■■■ 4.62
ZNF558-203ENST00000595786 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.79■■■■■ 4.6
ZNF558-203ENST00000595786 CUL7Q14999 1698 aa43.78■■■■■ 4.6
ZNF558-203ENST00000595786 JPH4Q96JJ6 628 aa43.76■■■■■ 4.6
ZNF558-203ENST00000595786 TRHP20396 242 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12 ms