RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595594.1

FCHO1-210, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 898 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-210ENST00000595594 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.26■■■■■ 5
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FCHO1-210ENST00000595594 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.17■■■■□ 3.86
FCHO1-210ENST00000595594 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.95■■■■□ 3.83
FCHO1-210ENST00000595594 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.77■■■■□ 3.8
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FCHO1-210ENST00000595594 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.53■■■■□ 3.76
FCHO1-210ENST00000595594 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.4■■■■□ 3.74
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FCHO1-210ENST00000595594 SCRIBQ14160 1630 aa37.96■■■■□ 3.67
FCHO1-210ENST00000595594 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.65■■■■□ 3.62
FCHO1-210ENST00000595594 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.54■■■■□ 3.6
FCHO1-210ENST00000595594 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
FCHO1-210ENST00000595594 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.37■■■■□ 3.57
FCHO1-210ENST00000595594 NCAPD3P42695 1498 aa36.14■■■■□ 3.38
FCHO1-210ENST00000595594 SMARCA4P51532 1647 aa36.14■■■■□ 3.38
FCHO1-210ENST00000595594 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.11■■■■□ 3.37
FCHO1-210ENST00000595594 SMARCA2P51531 1590 aa35.98■■■■□ 3.35
FCHO1-210ENST00000595594 HMGXB3Q12766 1538 aa35.91■■■■□ 3.34
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FCHO1-210ENST00000595594 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
FCHO1-210ENST00000595594 NESP48681 1621 aa35.75■■■■□ 3.31
FCHO1-210ENST00000595594 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.72■■■■□ 3.31
FCHO1-210ENST00000595594 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.68■■■■□ 3.3
FCHO1-210ENST00000595594 CUX2O14529 1486 aa35.66■■■■□ 3.3
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FCHO1-210ENST00000595594 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.37■■■■□ 3.25
FCHO1-210ENST00000595594 WIZO95785 1651 aa35.37■■■■□ 3.25
FCHO1-210ENST00000595594 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
FCHO1-210ENST00000595594 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.33■■■■□ 3.25
FCHO1-210ENST00000595594 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.13■■■■□ 3.21
FCHO1-210ENST00000595594 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.07■■■■□ 3.2
FCHO1-210ENST00000595594 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
FCHO1-210ENST00000595594 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.89■■■■□ 3.18
FCHO1-210ENST00000595594 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
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FCHO1-210ENST00000595594 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.76■■■■□ 3.15
FCHO1-210ENST00000595594 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.73■■■■□ 3.15
FCHO1-210ENST00000595594 CFTRP13569 1480 aa34.68■■■■□ 3.14
FCHO1-210ENST00000595594 PRDM2Q13029 1718 aa34.48■■■■□ 3.11
FCHO1-210ENST00000595594 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
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FCHO1-210ENST00000595594 TRIM41Q8WV44 630 aa34.24■■■■□ 3.07
FCHO1-210ENST00000595594 TOPBP1Q92547 1522 aa34.09■■■■□ 3.05
FCHO1-210ENST00000595594 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.08■■■■□ 3.05
FCHO1-210ENST00000595594 OSCARQ8IYS5 282 aa34.06■■■■□ 3.04
FCHO1-210ENST00000595594 IFT140Q96RY7 1462 aa34.02■■■■□ 3.04
FCHO1-210ENST00000595594 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.96■■■■□ 3.03
FCHO1-210ENST00000595594 ABCC8Q09428 1581 aa33.89■■■■□ 3.02
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FCHO1-210ENST00000595594 SOGA1O94964 1423 aa33.57■■■□□ 2.96
FCHO1-210ENST00000595594 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.56■■■□□ 2.96
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FCHO1-210ENST00000595594 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
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FCHO1-210ENST00000595594 WDR97A6NE52 1622 aa33.35■■■□□ 2.93
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FCHO1-210ENST00000595594 PBRM1Q86U86 1689 aa33.27■■■□□ 2.92
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FCHO1-210ENST00000595594 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.13■■■□□ 2.89
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FCHO1-210ENST00000595594 CEP170Q5SW79 1584 aa32.8■■■□□ 2.84
FCHO1-210ENST00000595594 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.79■■■□□ 2.84
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FCHO1-210ENST00000595594 NUP160Q12769 1436 aa32.7■■■□□ 2.83
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FCHO1-210ENST00000595594 SHROOM2Q13796 1616 aa32.6■■■□□ 2.81
FCHO1-210ENST00000595594 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.43■■■□□ 2.78
FCHO1-210ENST00000595594 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.42■■■□□ 2.78
FCHO1-210ENST00000595594 JPH4Q96JJ6 628 aa32.38■■■□□ 2.77
FCHO1-210ENST00000595594 KIF27Q86VH2 1401 aa32.3■■■□□ 2.76
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