RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595304.1

ZNF428-202, Transcript of zinc finger protein 428, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF428, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428-202ENST00000595304 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.98■■■■■ 7.19
ZNF428-202ENST00000595304 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.34■■■■■ 6.13
ZNF428-202ENST00000595304 ABCC9O60706 1549 aa52.58■■■■■ 6.01
ZNF428-202ENST00000595304 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.42■■■■■ 5.66
ZNF428-202ENST00000595304 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.37■■■■■ 5.65
ZNF428-202ENST00000595304 NACADO15069 1562 aa50.24■■■■■ 5.63
ZNF428-202ENST00000595304 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.89■■■■■ 5.58
ZNF428-202ENST00000595304 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.8■■■■■ 5.56
ZNF428-202ENST00000595304 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.53■■■■■ 5.52
ZNF428-202ENST00000595304 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.25■■■■■ 5.47
ZNF428-202ENST00000595304 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.17■■■■■ 5.46
ZNF428-202ENST00000595304 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.88■■■■■ 5.42
ZNF428-202ENST00000595304 SCRIBQ14160 1630 aa48.8■■■■■ 5.4
ZNF428-202ENST00000595304 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.51■■■■■ 5.36
ZNF428-202ENST00000595304 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.21■■■■■ 5.31
ZNF428-202ENST00000595304 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.61■■■■■ 5.21
ZNF428-202ENST00000595304 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.48■■■■■ 5.19
ZNF428-202ENST00000595304 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.22■■■■■ 5.15
ZNF428-202ENST00000595304 SMARCA4P51532 1647 aa46.58■■■■■ 5.05
ZNF428-202ENST00000595304 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
ZNF428-202ENST00000595304 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.4■■■■■ 5.02
ZNF428-202ENST00000595304 NCAPD3P42695 1498 aa46.38■■■■■ 5.01
ZNF428-202ENST00000595304 SMARCA2P51531 1590 aa46.3■■■■■ 5
ZNF428-202ENST00000595304 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.27■■■■■ 5
ZNF428-202ENST00000595304 HMGXB3Q12766 1538 aa46.09■■■■■ 4.97
ZNF428-202ENST00000595304 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.06■■■■■ 4.96
ZNF428-202ENST00000595304 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.02■■■■■ 4.96
ZNF428-202ENST00000595304 WIZO95785 1651 aa45.76■■■■■ 4.92
ZNF428-202ENST00000595304 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.66■■■■■ 4.9
ZNF428-202ENST00000595304 NESP48681 1621 aa45.44■■■■■ 4.86
ZNF428-202ENST00000595304 ERCC6Q03468 1493 aa45.31■■■■■ 4.84
ZNF428-202ENST00000595304 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.21■■■■■ 4.83
ZNF428-202ENST00000595304 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.17■■■■■ 4.82
ZNF428-202ENST00000595304 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.06■■■■■ 4.8
ZNF428-202ENST00000595304 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.92■■■■■ 4.78
ZNF428-202ENST00000595304 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.83■■■■■ 4.77
ZNF428-202ENST00000595304 CUX2O14529 1486 aa44.82■■■■■ 4.77
ZNF428-202ENST00000595304 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.73■■■■■ 4.75
ZNF428-202ENST00000595304 CFTRP13569 1480 aa44.72■■■■■ 4.75
ZNF428-202ENST00000595304 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.75
ZNF428-202ENST00000595304 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.55■■■■■ 4.72
ZNF428-202ENST00000595304 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.49■■■■■ 4.71
ZNF428-202ENST00000595304 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
ZNF428-202ENST00000595304 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.47■■■■■ 4.71
ZNF428-202ENST00000595304 PRDM2Q13029 1718 aa44.3■■■■■ 4.68
ZNF428-202ENST00000595304 WDR62O43379 1518 aa44.3■■■■■ 4.68
ZNF428-202ENST00000595304 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.65
ZNF428-202ENST00000595304 TOPBP1Q92547 1522 aa43.81■■■■■ 4.6
ZNF428-202ENST00000595304 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.8■■■■■ 4.6
ZNF428-202ENST00000595304 ABCC8Q09428 1581 aa43.72■■■■■ 4.59
ZNF428-202ENST00000595304 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.71■■■■■ 4.59
ZNF428-202ENST00000595304 IFT140Q96RY7 1462 aa43.56■■■■■ 4.56
ZNF428-202ENST00000595304 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.45■■■■■ 4.55
ZNF428-202ENST00000595304 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
ZNF428-202ENST00000595304 CUX1P39880 1505 aa43.41■■■■■ 4.54
ZNF428-202ENST00000595304 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
ZNF428-202ENST00000595304 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.3■■■■■ 4.52
ZNF428-202ENST00000595304 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.3■■■■■ 4.52
ZNF428-202ENST00000595304 SOGA1O94964 1423 aa43.27■■■■■ 4.52
ZNF428-202ENST00000595304 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.21■■■■■ 4.51
ZNF428-202ENST00000595304 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.19■■■■■ 4.51
ZNF428-202ENST00000595304 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
ZNF428-202ENST00000595304 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.05■■■■■ 4.48
ZNF428-202ENST00000595304 OSCARQ8IYS5 282 aa43.03■■■■■ 4.48
ZNF428-202ENST00000595304 SYNJ1O43426 1573 aa42.96■■■■■ 4.47
ZNF428-202ENST00000595304 TOP2BQ02880 1626 aa42.93■■■■■ 4.46
ZNF428-202ENST00000595304 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.91■■■■■ 4.46
ZNF428-202ENST00000595304 WDR97A6NE52 1622 aa42.88■■■■■ 4.45
ZNF428-202ENST00000595304 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.82■■■■■ 4.45
ZNF428-202ENST00000595304 FBLN2P98095 1184 aa42.79■■■■■ 4.44
ZNF428-202ENST00000595304 GRIN2BQ13224 1484 aa42.75■■■■■ 4.43
ZNF428-202ENST00000595304 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.75■■■■■ 4.43
ZNF428-202ENST00000595304 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.75■■■■■ 4.43
ZNF428-202ENST00000595304 CHD1O14646 1710 aa42.73■■■■■ 4.43
ZNF428-202ENST00000595304 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.66■■■■■ 4.42
ZNF428-202ENST00000595304 PBRM1Q86U86 1689 aa42.63■■■■■ 4.42
ZNF428-202ENST00000595304 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
ZNF428-202ENST00000595304 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.58■■■■■ 4.41
ZNF428-202ENST00000595304 SYNJ2O15056 1496 aa42.49■■■■■ 4.39
ZNF428-202ENST00000595304 TRIM41Q8WV44 630 aa42.38■■■■■ 4.37
ZNF428-202ENST00000595304 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.32■■■■■ 4.37
ZNF428-202ENST00000595304 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.32■■■■■ 4.37
ZNF428-202ENST00000595304 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.32■■■■■ 4.37
ZNF428-202ENST00000595304 ADAMTS12P58397 1594 aa42.29■■■■■ 4.36
ZNF428-202ENST00000595304 ARHGEF11O15085 1522 aa42.29■■■■■ 4.36
ZNF428-202ENST00000595304 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.29■■■■■ 4.36
ZNF428-202ENST00000595304 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.22■■■■■ 4.35
ZNF428-202ENST00000595304 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.22■■■■■ 4.35
ZNF428-202ENST00000595304 GRIN2AQ12879 1464 aa42.2■■■■■ 4.35
ZNF428-202ENST00000595304 KIF27Q86VH2 1401 aa42.16■■■■■ 4.34
ZNF428-202ENST00000595304 IGF1RP08069 1367 aa42.04■■■■■ 4.32
ZNF428-202ENST00000595304 CEP170Q5SW79 1584 aa42.01■■■■■ 4.32
ZNF428-202ENST00000595304 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.01■■■■■ 4.32
ZNF428-202ENST00000595304 NUP160Q12769 1436 aa42.01■■■■■ 4.32
ZNF428-202ENST00000595304 ARAP1Q96P48 1450 aa41.95■■■■■ 4.31
ZNF428-202ENST00000595304 CUL7Q14999 1698 aa41.86■■■■■ 4.29
ZNF428-202ENST00000595304 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.79■■■■■ 4.28
ZNF428-202ENST00000595304 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.79■■■■■ 4.28
ZNF428-202ENST00000595304 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.71■■■■■ 4.27
ZNF428-202ENST00000595304 SHROOM2Q13796 1616 aa41.69■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 160.7 ms