RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594716.5

MPND-204, Transcript of MPN domain containing, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MPND, Length 1,547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPND-204ENST00000594716 NISCHQ9Y2I1 1504 aa75.81■■■■■ 9.73
MPND-204ENST00000594716 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa67.44■■■■■ 8.39
MPND-204ENST00000594716 ABCC9O60706 1549 aa66.12■■■■■ 8.18
MPND-204ENST00000594716 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa63.57■■■■■ 7.77
MPND-204ENST00000594716 DCAF8L2P0C7V8 631 aa63.49■■■■■ 7.75
MPND-204ENST00000594716 NACADO15069 1562 aa63.46■■■■■ 7.75
MPND-204ENST00000594716 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP63.11■■■■■ 7.69
MPND-204ENST00000594716 MYO15BQ96JP2 1530 aa63.04■■■■■ 7.68
MPND-204ENST00000594716 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa62.72■■■■■ 7.63
MPND-204ENST00000594716 UNC13AQ9UPW8 1703 aa62.06■■■■■ 7.52
MPND-204ENST00000594716 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP61.79■■■■■ 7.48
MPND-204ENST00000594716 BICRAQ9NZM4 1560 aa61.58■■■■■ 7.45
MPND-204ENST00000594716 SCRIBQ14160 1630 aa61.53■■■■■ 7.44
MPND-204ENST00000594716 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60.98■■■■■ 7.35
MPND-204ENST00000594716 DNAJC5BQ9UF47 199 aa60.77■■■■■ 7.32
MPND-204ENST00000594716 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP60.01■■■■■ 7.2
MPND-204ENST00000594716 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa59.79■■■■■ 7.16
MPND-204ENST00000594716 CECR2Q9BXF3 1484 aa59.43■■■■■ 7.11
MPND-204ENST00000594716 SMARCA4P51532 1647 aa58.84■■■■■ 7.01
MPND-204ENST00000594716 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP58.78■■■■■ 7
MPND-204ENST00000594716 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa58.56■■■■■ 6.97
MPND-204ENST00000594716 NCAPD3P42695 1498 aa58.55■■■■■ 6.96
MPND-204ENST00000594716 SMARCA2P51531 1590 aa58.51■■■■■ 6.96
MPND-204ENST00000594716 MROH2BQ7Z745 1585 aa58.4■■■■■ 6.94
MPND-204ENST00000594716 PEG3Q9GZU2 1588 aa58.26■■■■■ 6.92
MPND-204ENST00000594716 HMGXB3Q12766 1538 aa58.24■■■■■ 6.91
MPND-204ENST00000594716 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP58.1■■■■■ 6.89
MPND-204ENST00000594716 WIZO95785 1651 aa57.77■■■■■ 6.84
MPND-204ENST00000594716 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP57.71■■■■■ 6.83
MPND-204ENST00000594716 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP57.16■■■■■ 6.74
MPND-204ENST00000594716 NESP48681 1621 aa57.16■■■■■ 6.74
MPND-204ENST00000594716 ERCC6Q03468 1493 aa57.04■■■■■ 6.72
MPND-204ENST00000594716 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa57.04■■■■■ 6.72
MPND-204ENST00000594716 CADPSQ9ULU8 1353 aa56.87■■■■■ 6.69
MPND-204ENST00000594716 PDS5BQ9NTI5 1447 aa56.7■■■■■ 6.67
MPND-204ENST00000594716 CCDC88BA6NC98 1476 aa56.51■■■■■ 6.64
MPND-204ENST00000594716 CFTRP13569 1480 aa56.48■■■■■ 6.63
MPND-204ENST00000594716 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa56.47■■■■■ 6.63
MPND-204ENST00000594716 CUX2O14529 1486 aa56.45■■■■■ 6.63
MPND-204ENST00000594716 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP56.3■■■■■ 6.6
MPND-204ENST00000594716 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP56.24■■■■■ 6.59
MPND-204ENST00000594716 FANCD2Q9BXW9 1451 aa56.2■■■■■ 6.59
MPND-204ENST00000594716 CEP164Q9UPV0 1460 aa56.15■■■■■ 6.58
MPND-204ENST00000594716 MRC2Q9UBG0 1479 aa56.08■■■■■ 6.57
MPND-204ENST00000594716 PRDM2Q13029 1718 aa56.01■■■■■ 6.56
MPND-204ENST00000594716 WDR62O43379 1518 aa55.87■■■■■ 6.53
MPND-204ENST00000594716 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP55.61■■■■■ 6.49
MPND-204ENST00000594716 ABCC8Q09428 1581 aa55.32■■■■■ 6.45
MPND-204ENST00000594716 TOPBP1Q92547 1522 aa55.28■■■■■ 6.44
MPND-204ENST00000594716 DNMBPQ6XZF7 1577 aa55.21■■■■■ 6.43
MPND-204ENST00000594716 IFT140Q96RY7 1462 aa54.98■■■■■ 6.39
MPND-204ENST00000594716 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa54.88■■■■■ 6.38
MPND-204ENST00000594716 CUX1P39880 1505 aa54.8■■■■■ 6.36
MPND-204ENST00000594716 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP54.8■■■■■ 6.36
MPND-204ENST00000594716 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP54.7■■■■■ 6.35
MPND-204ENST00000594716 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP54.66■■■■■ 6.34
MPND-204ENST00000594716 FGD5Q6ZNL6 1462 aa54.66■■■■■ 6.34
MPND-204ENST00000594716 SOGA1O94964 1423 aa54.61■■■■■ 6.33
MPND-204ENST00000594716 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa54.56■■■■■ 6.33
MPND-204ENST00000594716 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP54.48■■■■■ 6.31
MPND-204ENST00000594716 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP54.44■■■■■ 6.31
MPND-204ENST00000594716 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP54.4■■■■■ 6.3
MPND-204ENST00000594716 TOP2BQ02880 1626 aa54.31■■■■■ 6.28
MPND-204ENST00000594716 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP54.31■■■■■ 6.28
MPND-204ENST00000594716 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa54.3■■■■■ 6.28
MPND-204ENST00000594716 SYNJ1O43426 1573 aa54.27■■■■■ 6.28
MPND-204ENST00000594716 WDR97A6NE52 1622 aa54.26■■■■■ 6.28
MPND-204ENST00000594716 OSCARQ8IYS5 282 aa54.15■■■■■ 6.26
MPND-204ENST00000594716 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa54.12■■■■■ 6.25
MPND-204ENST00000594716 GRIN2BQ13224 1484 aa53.98■■■■■ 6.23
MPND-204ENST00000594716 GAPVD1Q14C86 1478 aa53.97■■■■■ 6.23
MPND-204ENST00000594716 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa53.89■■■■■ 6.22
MPND-204ENST00000594716 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa53.88■■■■■ 6.22
MPND-204ENST00000594716 FBLN2P98095 1184 aa53.85■■■■■ 6.21
MPND-204ENST00000594716 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP53.84■■■■■ 6.21
MPND-204ENST00000594716 PBRM1Q86U86 1689 aa53.81■■■■■ 6.21
MPND-204ENST00000594716 CHD1O14646 1710 aa53.81■■■■■ 6.2
MPND-204ENST00000594716 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP53.68■■■■■ 6.18
MPND-204ENST00000594716 SYNJ2O15056 1496 aa53.63■■■■■ 6.18
MPND-204ENST00000594716 ERICH3Q5RHP9 1530 aa53.49■■■■■ 6.15
MPND-204ENST00000594716 ADAMTS12P58397 1594 aa53.39■■■■■ 6.14
MPND-204ENST00000594716 FHAD1B1AJZ9 1412 aa53.34■■■■■ 6.13
MPND-204ENST00000594716 KIF27Q86VH2 1401 aa53.34■■■■■ 6.13
MPND-204ENST00000594716 GRIN2AQ12879 1464 aa53.26■■■■■ 6.12
MPND-204ENST00000594716 CLASP1Q7Z460 1538 aa53.23■■■■■ 6.11
MPND-204ENST00000594716 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa53.21■■■■■ 6.11
MPND-204ENST00000594716 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa53.21■■■■■ 6.11
MPND-204ENST00000594716 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa53.21■■■■■ 6.11
MPND-204ENST00000594716 ARHGEF11O15085 1522 aa53.2■■■■■ 6.11
MPND-204ENST00000594716 TRIM41Q8WV44 630 aa53.15■■■■■ 6.1
MPND-204ENST00000594716 IGF1RP08069 1367 aa53.12■■■■■ 6.09
MPND-204ENST00000594716 NUP160Q12769 1436 aa53.02■■■■■ 6.08
MPND-204ENST00000594716 CEP170Q5SW79 1584 aa52.97■■■■■ 6.07
MPND-204ENST00000594716 CUL7Q14999 1698 aa52.97■■■■■ 6.07
MPND-204ENST00000594716 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa52.82■■■■■ 6.05
MPND-204ENST00000594716 CYB5RLQ6IPT4 315 aa52.78■■■■■ 6.04
MPND-204ENST00000594716 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa52.76■■■■■ 6.04
MPND-204ENST00000594716 ARAP1Q96P48 1450 aa52.76■■■■■ 6.04
MPND-204ENST00000594716 SHROOM2Q13796 1616 aa52.61■■■■■ 6.01
MPND-204ENST00000594716 JPH4Q96JJ6 628 aa52.55■■■■■ 6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.9 ms