RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594321.5

SSC5D-205, Transcript of scavenger receptor cysteine rich family member with 5 domains, humanhuman

TSL 4

Gene SSC5D, Length 457 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5D-205ENST00000594321 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.42■■■■■ 5.5
SSC5D-205ENST00000594321 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.34■■■■■ 4.69
SSC5D-205ENST00000594321 ABCC9O60706 1549 aa44.03■■■■■ 4.64
SSC5D-205ENST00000594321 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.05■■■■■ 4.32
SSC5D-205ENST00000594321 NACADO15069 1562 aa41.84■■■■■ 4.29
SSC5D-205ENST00000594321 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.4■■■■■ 4.22
SSC5D-205ENST00000594321 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.39■■■■■ 4.22
SSC5D-205ENST00000594321 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.22■■■■■ 4.19
SSC5D-205ENST00000594321 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.2■■■■■ 4.19
SSC5D-205ENST00000594321 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
SSC5D-205ENST00000594321 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.96■■■■■ 4.15
SSC5D-205ENST00000594321 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.91■■■■■ 4.14
SSC5D-205ENST00000594321 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.89■■■■■ 4.14
SSC5D-205ENST00000594321 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.38■■■■■ 4.05
SSC5D-205ENST00000594321 SCRIBQ14160 1630 aa40.27■■■■■ 4.04
SSC5D-205ENST00000594321 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.86■■■■□ 3.97
SSC5D-205ENST00000594321 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.97
SSC5D-205ENST00000594321 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.67■■■■□ 3.94
SSC5D-205ENST00000594321 NCAPD3P42695 1498 aa38.64■■■■□ 3.78
SSC5D-205ENST00000594321 SMARCA4P51532 1647 aa38.51■■■■□ 3.76
SSC5D-205ENST00000594321 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.5■■■■□ 3.75
SSC5D-205ENST00000594321 SMARCA2P51531 1590 aa38.4■■■■□ 3.74
SSC5D-205ENST00000594321 HMGXB3Q12766 1538 aa38.37■■■■□ 3.73
SSC5D-205ENST00000594321 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.33■■■■□ 3.73
SSC5D-205ENST00000594321 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.22■■■■□ 3.71
SSC5D-205ENST00000594321 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.09■■■■□ 3.69
SSC5D-205ENST00000594321 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.06■■■■□ 3.68
SSC5D-205ENST00000594321 CUX2O14529 1486 aa37.96■■■■□ 3.67
SSC5D-205ENST00000594321 ERCC6Q03468 1493 aa37.96■■■■□ 3.67
SSC5D-205ENST00000594321 NESP48681 1621 aa37.9■■■■□ 3.66
SSC5D-205ENST00000594321 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.75■■■■□ 3.63
SSC5D-205ENST00000594321 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.72■■■■□ 3.63
SSC5D-205ENST00000594321 WIZO95785 1651 aa37.6■■■■□ 3.61
SSC5D-205ENST00000594321 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.56■■■■□ 3.6
SSC5D-205ENST00000594321 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.47■■■■□ 3.59
SSC5D-205ENST00000594321 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.44■■■■□ 3.58
SSC5D-205ENST00000594321 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.42■■■■□ 3.58
SSC5D-205ENST00000594321 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.32■■■■□ 3.56
SSC5D-205ENST00000594321 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
SSC5D-205ENST00000594321 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.12■■■■□ 3.53
SSC5D-205ENST00000594321 WDR62O43379 1518 aa37.07■■■■□ 3.53
SSC5D-205ENST00000594321 CFTRP13569 1480 aa37.06■■■■□ 3.52
SSC5D-205ENST00000594321 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.98■■■■□ 3.51
SSC5D-205ENST00000594321 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.96■■■■□ 3.51
SSC5D-205ENST00000594321 PRDM2Q13029 1718 aa36.76■■■■□ 3.48
SSC5D-205ENST00000594321 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.71■■■■□ 3.47
SSC5D-205ENST00000594321 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
SSC5D-205ENST00000594321 TOPBP1Q92547 1522 aa36.31■■■■□ 3.4
SSC5D-205ENST00000594321 ABCC8Q09428 1581 aa36.27■■■■□ 3.4
SSC5D-205ENST00000594321 IFT140Q96RY7 1462 aa36.26■■■■□ 3.4
SSC5D-205ENST00000594321 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.2■■■■□ 3.39
SSC5D-205ENST00000594321 OSCARQ8IYS5 282 aa36.19■■■■□ 3.38
SSC5D-205ENST00000594321 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
SSC5D-205ENST00000594321 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.03■■■■□ 3.36
SSC5D-205ENST00000594321 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.35
SSC5D-205ENST00000594321 TRIM41Q8WV44 630 aa35.98■■■■□ 3.35
SSC5D-205ENST00000594321 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
SSC5D-205ENST00000594321 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.85■■■■□ 3.33
SSC5D-205ENST00000594321 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.77■■■■□ 3.32
SSC5D-205ENST00000594321 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.75■■■■□ 3.31
SSC5D-205ENST00000594321 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.75■■■■□ 3.31
SSC5D-205ENST00000594321 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.75■■■■□ 3.31
SSC5D-205ENST00000594321 SOGA1O94964 1423 aa35.75■■■■□ 3.31
SSC5D-205ENST00000594321 CUX1P39880 1505 aa35.74■■■■□ 3.31
SSC5D-205ENST00000594321 CHD1O14646 1710 aa35.73■■■■□ 3.31
SSC5D-205ENST00000594321 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.72■■■■□ 3.31
SSC5D-205ENST00000594321 WDR97A6NE52 1622 aa35.7■■■■□ 3.31
SSC5D-205ENST00000594321 ARHGEF11O15085 1522 aa35.65■■■■□ 3.3
SSC5D-205ENST00000594321 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
SSC5D-205ENST00000594321 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
SSC5D-205ENST00000594321 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.48■■■■□ 3.27
SSC5D-205ENST00000594321 FBLN2P98095 1184 aa35.45■■■■□ 3.27
SSC5D-205ENST00000594321 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
SSC5D-205ENST00000594321 GRIN2BQ13224 1484 aa35.44■■■■□ 3.26
SSC5D-205ENST00000594321 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.38■■■■□ 3.25
SSC5D-205ENST00000594321 PBRM1Q86U86 1689 aa35.36■■■■□ 3.25
SSC5D-205ENST00000594321 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.36■■■■□ 3.25
SSC5D-205ENST00000594321 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.33■■■■□ 3.25
SSC5D-205ENST00000594321 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.32■■■■□ 3.25
SSC5D-205ENST00000594321 SYNJ2O15056 1496 aa35.32■■■■□ 3.24
SSC5D-205ENST00000594321 ARAP1Q96P48 1450 aa35.32■■■■□ 3.24
SSC5D-205ENST00000594321 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.29■■■■□ 3.24
SSC5D-205ENST00000594321 SYNJ1O43426 1573 aa35.29■■■■□ 3.24
SSC5D-205ENST00000594321 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.28■■■■□ 3.24
SSC5D-205ENST00000594321 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.27■■■■□ 3.24
SSC5D-205ENST00000594321 TOP2BQ02880 1626 aa35.24■■■■□ 3.23
SSC5D-205ENST00000594321 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.2■■■■□ 3.23
SSC5D-205ENST00000594321 ADAMTS12P58397 1594 aa35.01■■■■□ 3.2
SSC5D-205ENST00000594321 GRIN2AQ12879 1464 aa34.99■■■■□ 3.19
SSC5D-205ENST00000594321 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.94■■■■□ 3.18
SSC5D-205ENST00000594321 NUP160Q12769 1436 aa34.91■■■■□ 3.18
SSC5D-205ENST00000594321 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.9■■■■□ 3.18
SSC5D-205ENST00000594321 CEP170Q5SW79 1584 aa34.88■■■■□ 3.17
SSC5D-205ENST00000594321 SHROOM2Q13796 1616 aa34.78■■■■□ 3.16
SSC5D-205ENST00000594321 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.77■■■■□ 3.16
SSC5D-205ENST00000594321 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.76■■■■□ 3.16
SSC5D-205ENST00000594321 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.52■■■■□ 3.12
SSC5D-205ENST00000594321 IGF1RP08069 1367 aa34.5■■■■□ 3.11
SSC5D-205ENST00000594321 JPH4Q96JJ6 628 aa34.49■■■■□ 3.11
SSC5D-205ENST00000594321 KIF27Q86VH2 1401 aa34.48■■■■□ 3.11
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