RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593840.1

MEGF8-205, Transcript of multiple EGF like domains 8, humanhuman

TSL 4

Gene MEGF8, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF8-205ENST00000593840 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.18■■■■■ 4.18
MEGF8-205ENST00000593840 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.74■■■■□ 3.47
MEGF8-205ENST00000593840 ABCC9O60706 1549 aa36.31■■■■□ 3.4
MEGF8-205ENST00000593840 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.68■■■■□ 3.14
MEGF8-205ENST00000593840 NACADO15069 1562 aa34.56■■■■□ 3.12
MEGF8-205ENST00000593840 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.36■■■■□ 3.09
MEGF8-205ENST00000593840 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
MEGF8-205ENST00000593840 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.25■■■■□ 3.07
MEGF8-205ENST00000593840 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.1■■■■□ 3.05
MEGF8-205ENST00000593840 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.01■■■■□ 3.04
MEGF8-205ENST00000593840 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.85■■■■□ 3.01
MEGF8-205ENST00000593840 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
MEGF8-205ENST00000593840 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.74■■■□□ 2.99
MEGF8-205ENST00000593840 SCRIBQ14160 1630 aa33.57■■■□□ 2.97
MEGF8-205ENST00000593840 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.22■■■□□ 2.91
MEGF8-205ENST00000593840 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.89■■■□□ 2.86
MEGF8-205ENST00000593840 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.84■■■□□ 2.85
MEGF8-205ENST00000593840 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.61■■■□□ 2.81
MEGF8-205ENST00000593840 SMARCA4P51532 1647 aa32.06■■■□□ 2.72
MEGF8-205ENST00000593840 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.94■■■□□ 2.7
MEGF8-205ENST00000593840 NCAPD3P42695 1498 aa31.92■■■□□ 2.7
MEGF8-205ENST00000593840 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.88■■■□□ 2.69
MEGF8-205ENST00000593840 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.81■■■□□ 2.68
MEGF8-205ENST00000593840 SMARCA2P51531 1590 aa31.79■■■□□ 2.68
MEGF8-205ENST00000593840 HMGXB3Q12766 1538 aa31.76■■■□□ 2.68
MEGF8-205ENST00000593840 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.73■■■□□ 2.67
MEGF8-205ENST00000593840 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.59■■■□□ 2.65
MEGF8-205ENST00000593840 WIZO95785 1651 aa31.45■■■□□ 2.63
MEGF8-205ENST00000593840 NESP48681 1621 aa31.4■■■□□ 2.62
MEGF8-205ENST00000593840 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
MEGF8-205ENST00000593840 ERCC6Q03468 1493 aa31.19■■■□□ 2.58
MEGF8-205ENST00000593840 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.12■■■□□ 2.57
MEGF8-205ENST00000593840 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
MEGF8-205ENST00000593840 CUX2O14529 1486 aa31.01■■■□□ 2.56
MEGF8-205ENST00000593840 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31■■■□□ 2.55
MEGF8-205ENST00000593840 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
MEGF8-205ENST00000593840 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.95■■■□□ 2.55
MEGF8-205ENST00000593840 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.83■■■□□ 2.53
MEGF8-205ENST00000593840 CFTRP13569 1480 aa30.75■■■□□ 2.51
MEGF8-205ENST00000593840 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.68■■■□□ 2.5
MEGF8-205ENST00000593840 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.64■■■□□ 2.5
MEGF8-205ENST00000593840 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.63■■■□□ 2.49
MEGF8-205ENST00000593840 WDR62O43379 1518 aa30.62■■■□□ 2.49
MEGF8-205ENST00000593840 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.6■■■□□ 2.49
MEGF8-205ENST00000593840 PRDM2Q13029 1718 aa30.51■■■□□ 2.47
MEGF8-205ENST00000593840 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.45■■■□□ 2.47
MEGF8-205ENST00000593840 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.45■■■□□ 2.47
MEGF8-205ENST00000593840 TOPBP1Q92547 1522 aa30.14■■■□□ 2.42
MEGF8-205ENST00000593840 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
MEGF8-205ENST00000593840 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.06■■■□□ 2.4
MEGF8-205ENST00000593840 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
MEGF8-205ENST00000593840 IFT140Q96RY7 1462 aa29.95■■■□□ 2.39
MEGF8-205ENST00000593840 ABCC8Q09428 1581 aa29.94■■■□□ 2.38
MEGF8-205ENST00000593840 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
MEGF8-205ENST00000593840 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
MEGF8-205ENST00000593840 CUX1P39880 1505 aa29.86■■■□□ 2.37
MEGF8-205ENST00000593840 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
MEGF8-205ENST00000593840 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.78■■■□□ 2.36
MEGF8-205ENST00000593840 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.74■■■□□ 2.35
MEGF8-205ENST00000593840 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.354e-6■■□□□ 13.9
MEGF8-205ENST00000593840 SOGA1O94964 1423 aa29.64■■■□□ 2.34
MEGF8-205ENST00000593840 WDR97A6NE52 1622 aa29.61■■■□□ 2.33
MEGF8-205ENST00000593840 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
MEGF8-205ENST00000593840 OSCARQ8IYS5 282 aa29.57■■■□□ 2.32
MEGF8-205ENST00000593840 CHD1O14646 1710 aa29.54■■■□□ 2.32
MEGF8-205ENST00000593840 SYNJ1O43426 1573 aa29.52■■■□□ 2.32
MEGF8-205ENST00000593840 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.48■■■□□ 2.31
MEGF8-205ENST00000593840 TOP2BQ02880 1626 aa29.45■■■□□ 2.3
MEGF8-205ENST00000593840 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.44■■■□□ 2.3
MEGF8-205ENST00000593840 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.41■■■□□ 2.3
MEGF8-205ENST00000593840 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
MEGF8-205ENST00000593840 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.41■■■□□ 2.3
MEGF8-205ENST00000593840 PBRM1Q86U86 1689 aa29.38■■■□□ 2.29
MEGF8-205ENST00000593840 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.35■■■□□ 2.29
MEGF8-205ENST00000593840 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.35■■■□□ 2.29
MEGF8-205ENST00000593840 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.35■■■□□ 2.29
MEGF8-205ENST00000593840 GRIN2BQ13224 1484 aa29.35■■■□□ 2.29
MEGF8-205ENST00000593840 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.32■■■□□ 2.28
MEGF8-205ENST00000593840 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
MEGF8-205ENST00000593840 TRIM41Q8WV44 630 aa29.29■■■□□ 2.28
MEGF8-205ENST00000593840 ARHGEF11O15085 1522 aa29.28■■■□□ 2.28
MEGF8-205ENST00000593840 FBLN2P98095 1184 aa29.26■■■□□ 2.27
MEGF8-205ENST00000593840 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.22■■■□□ 2.27
MEGF8-205ENST00000593840 SYNJ2O15056 1496 aa29.22■■■□□ 2.27
MEGF8-205ENST00000593840 ADAMTS12P58397 1594 aa29.13■■■□□ 2.25
MEGF8-205ENST00000593840 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
MEGF8-205ENST00000593840 ARAP1Q96P48 1450 aa29.07■■■□□ 2.24
MEGF8-205ENST00000593840 GRIN2AQ12879 1464 aa29.03■■■□□ 2.24
MEGF8-205ENST00000593840 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.02■■■□□ 2.24
MEGF8-205ENST00000593840 CEP170Q5SW79 1584 aa28.98■■■□□ 2.23
MEGF8-205ENST00000593840 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.95■■■□□ 2.23
MEGF8-205ENST00000593840 NUP160Q12769 1436 aa28.94■■■□□ 2.22
MEGF8-205ENST00000593840 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.9■■■□□ 2.22
MEGF8-205ENST00000593840 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.88■■■□□ 2.21
MEGF8-205ENST00000593840 SHROOM2Q13796 1616 aa28.8■■■□□ 2.2
MEGF8-205ENST00000593840 IGF1RP08069 1367 aa28.77■■■□□ 2.2
MEGF8-205ENST00000593840 KIF27Q86VH2 1401 aa28.76■■■□□ 2.19
MEGF8-205ENST00000593840 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.73■■■□□ 2.19
MEGF8-205ENST00000593840 CUL7Q14999 1698 aa28.69■■■□□ 2.18
MEGF8-205ENST00000593840 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms